Karadeniz Bölgesi'ndeki ruminantlarda border disease epidemiyolojisi
Border disease epidemiology in ruminants in the Black SEA region
- Tez No: 563374
- Danışmanlar: PROF. DR. SEMRA GÜMÜŞOVA
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Abort, BDV, Karadeniz Bölgesi, keçi, koyun, sığır, Abort, BDV, Black Sea Region, cattle, goat, sheep
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Amaç: Bu tezin amacı Karadeniz Bölgesi'nde koyun ve keçilerde BDV verilerini güncellemek, Türkiye' de ilk kez sığırlarda BDV' nin prevalansını ortaya koymak ve bölgede sığır, koyun ve keçilerde sirküle olan genotipi tespit etmektir. Materyal ve Metot: Bu tez kapsamında 2015-2017 yılları arasında Samsun Veteriner Kontrol Enstitüsü Müdürlüğü'ne bölge illerinden gönderilen 100 adet koyun, 20 adet keçi ve 193 adet sığır abort materyali BDV yönünden ELISA ve RT-PCR tekniği ile incelenmiştir. Bulgular: Yapılan Ag-ELISA sonucu sığırlarda %50,26 (97/193), koyunlarda %58 (58/100) ve keçilerde %55 (11/20) oranında pestivirus yönünden pozitiflik tespit edilmiştir. Aynı örneklerde BDV probları kullanılarak yapılan Real Time RT-PCR testi sonucu sadece 1 adet koyunda (%1) BDV pozitif tespit edilmiş olup 324/326 panpesti primerleri ve PBD1/PBD2 BDV spesifik primerleri ile yapılan konvansiyonel RT-PCR ile 3 adet koyunda (%3) ve 1 adet sığırda (%0,52) BDV pozitif sonuç elde edilmiştir. Keçilerde ise pozitiflik belirlenmemiştir. Ayrıca RT-PCR ile koyun abortlarından pozitif bulunan örneklerden yapılan filogenetik dizi analizi sonucunda incelenen bölgede sirküle olan 2 farklı genotip (BDV-3 ve BDV-7) olduğu da ortaya konmuştur. Ancak sığırdan elde edilen pozitif örnek, filogenetik dizi analizi sonucunda BVD-1 olarak belirlenmiştir. Sonuç: Bu tez çalışması sonucunda sığırlarda pestivirus varlığı araştırılırken BDV'nin de dikkate alınması gerektiği görülmektedir. Abort materyallerde pestivirusların tespitinde Ag-ELISA testi yerine daha duyarlı bir test olan RT-PCR yönteminin kullanılması önem arz etmektedir. Yerli suşlarımız kullanılarak yapılacak primer ve probe dizaynı ile yeni bir Real-Time RT-PCR panelinin optimize edilmesine ihtiyaç olduğu da bu çalışmadan çıkarılacak bir diğer önemli sonuçtur.
Özet (Çeviri)
Aim: The aim of this thesis is update the BDV data in sheep and goats in the Black Sea region, determine the prevalence of BDV in cattle for the first time in Turkey and identify the genotype circulated in cattle, sheep and goats in the region. Material and Method: For this purpose, 100 sheep, 20 goats and 193 cattle abort materials sent from the regional provinces to Samsun Veterinary Control Institute between 2015-2017 were analyzed in terms of BDV by ELISA and RT-PCR technique. Results: The results of Ag-ELISA were found to be positive for cattle with a rate of 50.26% (97/193), in sheep with 58% (58/100) and in goats with a rate of 55% (11/20) in terms of pestivirus. RealTime RT-PCR test was performed with the same samples by BDV probes, and BDV positive was detected in only 1 sheep (1%) and 324/326 panpest primers and PBD1 / PBD2 were performed with conventional RT-PCR in 3 sheeps (3%). and BDV positive result was obtained in 1 cattle (0.52%). No positivity was determined in goats. In addition, two different genotypes (BDV-3 and BDV-7) were found to be circulated in the investigated area as a result of phylogenetic sequence analysis performed with samples found positive from sheep abortions by RT-PCR. However, the positive sample obtained from cattle was determined as BVD-1 after phylogenetic sequence analysis. Conclusion: As a result of this study, it is seen that BDV should be taken into consideration while searching for the presence of pestivirus in cattle. In the detection of pestiviruses in abort materials, it is important to use the RT-PCR test which is a more sensitive test rather than Ag-ELISA test. Another important result of this study is the need to optimize a new Real-Time RT-PCR panel with primary and probe design using our native strains.
Benzer Tezler
- Doğu Karadeniz Bölgesi'ndeki amatör balıkçılığın sosyo ekonomik analizi
Socio-economic analysis of amateur fishing in the Eastern Black Sea region
MUHAMMET KARAPİÇAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Balıkçılık TeknolojisiOrdu ÜniversitesiBalıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET AYDIN
- Terkos havzasında tuzlu su girişimlerinin geçici elektromanyetik ve doğru akım özdirenç yöntemleriyle araştırılması
Investigation of saltwater intrusion in terkos basin using transient electromagnetic and direct current resistivity methods
AYÇA SULTAN ARDALI
Doktora
Türkçe
2014
Jeofizik Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiJeofizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYSAN GÜRER
- Numerical modeling of the bosphorus exchange flow dynamics
İstanbul Boğazı değişim akımlarının sayısal modellenmesi
ADİL SÖZER
Doktora
İngilizce
2013
Deniz BilimleriOrta Doğu Teknik ÜniversitesiOşinografi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİN ÖZSOY
- Doğu karadeniz bölgesinde osteoporoz için risk faktörlerinin tespiti
Identification of risk factors for osteoporosis in the region of east black sea
MÜNEVVER SERDAROĞLU BEYAZAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonKaradeniz Teknik ÜniversitesiFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET TOSUN
- Aktif işgücü piyasası programlarının etki değerlendirmesi: Denizli ili örneği
Impact evaluation of active labour market policies: The case of Denizli
SEZGİ AKBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileriPamukkale ÜniversitesiÇalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OĞUZ KARADENİZ