Türkiye'de yayılış gösteren bazı onosma L. (Boraginaceae) taksonlarının sistematik problemlerinin çözümüne yönelik moleküler yaklaşımlar
Molecular approaches to the solution of systematic problems on some onosma (Boraginaceae) species which grown naturally in Turkey
- Tez No: 605145
- Danışmanlar: DOÇ. DR. RIZA BİNZET, ÖĞR. GÖR. SERTAN ÇEVİK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Botanik, Genetik, Botany, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Botanik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 131
Özet
Bu çalışmanın amacı, Onosma L. cinsinin Protonosma M. Popov., Podonosma (Boiss.) Gürke. ve Onosma seksiyonları ile Haplotricha (Boiss.) Gürke. ve Asterotricha (Boiss.) Gürke. altseksiyonlarında yer alan 24 taksonunun matK, rbcL, trnH-psbA ile ITS2 barkod bölgeleri kullanılarak DNA barkodlama yönteminin cinsin taksonomik sorunlarına katkısını belirlemektir. Taksonomik açıdan birçok problem barındıran Onosma cinsinde seksiyon ve altseksiyon düzeyinde birbirine en yakın ve problemli türler (O. gigantea Lam. , O. auriculata Prodr., ile O. malatyana; O. mutabilis Boiss, ile O. alborosea Fisch&Mey., gibi) seçilerek mevcut taksonomik problemlerin çözülmesi amaçlanmıştır. Bu doğrultuda matK, rbcL, trnH-psbA ve ITS2 gen bölgelerine ait sekans verileri yardımıyla Maksimum Parsimoni, Maksimum Benzerlik, UPGMA (Ortalamayı Kullanan Ağırlıksız Çift Grup Metodu), Neighbour-Joining (NJ – Komşu Birleştirme Metodu), Minimum Evrim analiz metodları kullanılarak filogenetik ağaçlar oluşturulmuştur. Çalışma sonucunda elde edilen filogenetik ağaçlar, daha önce yapılmış morfolojik, anatomik ve palinolojik analizler ile desteklenerek değerlendirilmiş ve ITS2 barkod bölgesinin çalışılan Onosma türleri arasındaki ilişkiyi en sağlıklı şekilde açıklayarak çözümlediği belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar ışığında Protonosma ve Podonosma seksiyonlarının ayrı birer cins olarak değerlendirilmesi önerilmiştir. Ayrıca bu çalışma ile O. gigantea ile O. auriculata'nın moleküler özelliklerinin tamamen örtüştüğü belirlenmiş,“Uluslararası Alg, Mantar ve Bitkileri Adlandırma Kodu”nun öncelik prensibine göre geçerli ismin O. gigantea olduğunu ve bu nedenle O. auriculata'nın O. gigantea'nın sinonimi olarak kabul edilmesi gerekliliğini ortaya koymuştur. Aynı şekilde tez çalışması sonucunda elde edilen sonuçlar, sistematik açıdan sorunlar içeren O. alborosea ve O. mutabilis'in de moleküler verilerinin örtüştüğünü ve kodun öncelik kuralına göre geçerli ismin O. olborosea olduğunu ve O. mutabilis'in ise O. olborosea'nın sinonimi olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
The aim of this study was to determine the contribution of DNA barcoding using matK, rbcL, trnH-psbA and ITS2 barcode regions on 24 Onosma taxa, representing 3 distinct sections of the genus (Protonosma, Podonosma and Onosma) and two sub-sections (Haplotricha, Asterotricha). It was aimed to solve the problems by choosing the closest and problematic species (O. gigantea, O. auriculata and O. malatyana; O. mutabilis and O. alborosea) in the section of Onosma which has many problems in taxonomic terms. Using the sequence data of matK, rbcL, trnH-psbA and ITS2 gene regions and Maximum Parsimony, Maximum Likelyhood, UPGMA ((Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean), Neighbor-Joining (NJ), Minimum Evolution analysis programs are used and phylogenetic trees were formed. Phylogenetic trees obtained as a result of the study, previously supported by morphological, anatomical, palynological and karyological analysis and the ITS region has solved the relationship between Onosma species in the most accurate way. It was determined that the chloroplast gene regions examined in the scope of the thesis did not present healthy analyzes on Onosma genus alone. In the light of the data obtained, it is suggested that O. orientalis in Podonosma and O. rostellata in Protonosma are separated from other sections and it would be systematically more convenient to accept as a separate breed in both sections. In addition to molecular data, anatomical and palynological characters are also considered and O. gigantea and O. auriculata species which are both biennial and have very similar properties. It is proposed as according to International Code of Nomenclature for algae, fungi and plants (Melbourne Code), the valid species is O. gigantea and O. auriculata species is accepted as the synonym of O. gigantea. Another important result obtained from the thesis study is that the molecular data of O. alborosea and O. mutabilis which contain systematic problems are overlapped and according to the priority O. olborosea is the valid species and O. mutabilis is accepted as synonym.
Benzer Tezler
- Türkiye'nin bazı endemik Onosma L. (Boraginaceae) taksonlarının morfolojik ve palinolojik yönden incelenmesi
Morphological and palynological investigations of some endemic Onosma L. (Boraginaceae) taxa from Turkey
HALİL İBRAHİM TEKE
- Kırıkkale'deki Boraginaceae familyasına ait bazı türler üzerinde mikromorfolojik bir araştırma
A micromorphological study on some species of the family Boraginaceaein Kırıkkale
ZEYNEP CANKURTARAN
- Onosma polyantha DC. ve Onosma mitis Boiss. & Heldr. türlerinin morfolojik, anatomik ve palinolojik incelenmesi
Morphological, anatomical and palinological investigation of Onosma polyantha DC. and Onosma mitis Boiss. & Heldr.
HÜSEYİN SUNA
- Erzincan'da yayılış gösteren bazı endemik bitki türlerini tehdit eden ekolojik ve genetik faktörlerin belirlenmesi
Determination of threatening ecological and genetic factors for some endemic plant species distributed in Erzincan
MUHİP HİLOOĞLU
- Türkiye'de yayılış gösteren bazı campanula türlerinin fitokimyasal açıdan değerlendirilmesi ve biyolojik aktivitelerinin araştırılması
Investigation of phytochemical properties and biological activities of some campanula species distributed in Turkey
AYŞE ERDOĞAN
Doktora
Türkçe
2022
Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYNUR SARI