Köpeklerde koagülaz pozitif stafilokokların nazal kolonizasyonu ve metisilin direncinin araştırılması
Nasal colonization of coagulase positive staphylococci and investigation of methicillin resistance in dogs
- Tez No: 606967
- Danışmanlar: PROF. DR. SERKAN İKİZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
Bu çalışmada, nazal sıvap örneklerinde koagülaz pozitif stafilokokların varlığı, oranı ve tür dağılımının saptanması ile fenotipik olarak metisilin direnci ve genotipik incelemeler sonucu mecA ve mecC gen varlığının ve prevalansının araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla çalışmaya alınan 200 adet köpeğe ait nazal sıvap örneklerinden 21 (%10,5) adedinde koagülaz pozitif stafilokoklar (KPS) izole edilmiştir. BD Phoenix otomatize sistemi (BD Diagnostic Instrument Systems, ABD) kullanılarak, 7 tanesi (%33,3) S. aureus, 14 tanesi (%66,6) S. intermedius grup (SIG) olmak üzere 21 koagülaz pozitif stafilokok izolatı tanımlanmıştır. İzolatlardan elde edilen DNA'lar kullanılarak, m-PCR yöntemi ile S. intermedius ve S. pseudintermedius izolatlarının identifikasyonu tamamlandı. Toplamda, 14 S. intermedius grup (SIG) üyesinin 14 tanesi (%100) de S. pseudintermedius olarak identifiye edildi. Söz konusu izolatların, fenotipik metisilin direnç profilinin ortaya çıkarılması açısından disk difüzyon yöntemi kullanılarak MHA üzerindeki zon çapları belirlendi. Toplamda, 8 farklı klinik ve barınaktaki 200 köpekten izole edilen 21 koagülaz pozitif stafilokoktan 16 tanesinde (%76,19) fenotipik metisilin direnci gözlemlendi. Genotipik metisilin direncinin saptanması amacıyla Multipleks Polimeraz Zincir Reaksiyonu yöntemiyle metisilin direnci sağlayan mecA ve mecC geni varlığı araştırıldı. Toplam 21 izolatın 8 tanesinde (%38,09) mecA geni saptandı. Fenotipik metisilin direnci gösteren izolatlar dahil olmak üzere çalışılan örneklerin hiçbirinde mecC genine rastlanmadı. Gerek koagülaz pozitif stafilokokların varlığının gerekse mecA gen varlığının yaş, cinsiyet ve son bir yıl içinde antibiyotik kullanımı ile istatistiksel olarak ilişkili olmadığı saptandı. (p>0,05) Ayrıca KPS ve mecA pozitif izolatların alındığı kaynaklara göre değerlendirildi. İzolatların barınaklardan ya da kliniklerden elde edilme durumlarının çalışmamız açısından bir önem taşımadığı belirlendi (p>0,05).
Özet (Çeviri)
The aim of this study was to determine the presence, prevalence and distribution of coagulase positive staphylococci in nasal swab specimens and to investigate the presence and prevalence of mecA and mecC genes by phenotypic resistance to methicillin resistance and genotypic studies. For this purpose, coagulase positive staphylococci (KPS) were isolated from 21 (10.5%) nasal swab samples of 200 dogs included in the study. A total of 21 coagulase positive staphylococci isolates were identified, 7 (33.3%) S. aureus and 14 (66.6%) S. intermedius group (SIG) using the BD Phoenix automated system (BD Diagnostic Instrument Systems, USA). Identification of S. intermedius and S. pseudintermedius isolates was completed by m-PCR using DNA obtained from the isolates. In total, 14 (100%) of 14 S. intermedius group (SIG) members were identified as S. pseudintermedius. Zone diameters on MHA were determined by disc diffusion method to determine phenotypic methicillin resistance profile of these isolates. In total, phenotypic methicillin resistance was observed in 16 (76.19%) of 21 coagulase positive staphylococci isolated from 200 dogs in 8 different clinics and shelters. In order to determine genotypic methicillin resistance, the presence of mecA and mecC gene that provides methicillin resistance was investigated by Multiplex Polymerase Chain Reaction method. MecA gene was detected in 8 (38.09%) of 21 isolates. No mecC gene was found in any of the samples studied, including phenotypic methicillin-resistant isolates. The presence of coagulase positive staphylococci and mecA gene were not found to be statistically correlated with age, sex and antibiotic use in the last year. (p> 0.05) In addition, KPS and mecA positive isolates were evaluated according to the sources. It was determined that isolates obtained from shelters or clinics were not important for our study (p> 0.05).
Benzer Tezler
- Sağlıklı ve otitis eksternalı köpeklerden izole edilen Staphylococcus İntermedius 'un eksfoliatif toksininin belirlenmesi
Determination of Staphylococcus İntermedius's exfoliative toxin isolated from healthy dogs and dogs with otitis externa
ÖZGENUR YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERAP SAVAŞAN
- Sağlıklı ve otitis externalı köpeklerden Staphylococcus pseudintermedius izolasyonu ve antibiyotik dirençliliğinin belirlenmesi
Isolation of Staphylococcus pseudintermedius from healthy and dogs with otitis externa and determination of antibiotic resistance
DUYGU KOCATEPE
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERAP SAVAŞAN
- Köpeklerde üriner sistem enfeksiyonunda ultrasonografik muayene sonuçları ile idrar analiz sonuçları arasındaki ilişkiler
The relationships between ultrasonographic examination and urinalysis results in urinary tract infections in dogs.
CENKER ÇAĞRI CINGI
Doktora
Türkçe
2007
Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MEHMET KAZIM BÖRKÜ
- İstanbul sokak köpeklerinin dışkı florasının, barsak parazitlerinin araştırılması ve çocuk parklarındaki kumların dışkı ile kontaminasyonundaki rollerinin incelenmesi
Detection of fecal flora and enteric parasites of dogs and their role in contamination of sand in play areas in Istanbul
GÖKHAN ŞENGÜR
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. YAŞAR ALİ ÖNER
- Trıchosporon türlerinde bazı virulans faktörlerinin araştırılması
Investigation of some virulence factors of trichosporon species
FEYZA DEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE SEMRA KUŞTİMUR