Geri Dön

Türk toplumunda vitamin D bağlayıcı protein genotipi ve plazma 25(OH)D konsantrasyonu ile ilişkisi

The relationship between the genotype of vitamin D binding protein and plasma 25(OH)D concentration in Turkish population

PDF İndir

  1. Tez No: 613483
  2. Yazar: LUTFİYE KARCIOĞLU BATUR
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET ÖZAYDIN, PROF. DR. NEZİH HEKİM
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: 25(OH)D, Türk popülasyonu, DBP, Gc geni, D vitamini, 25(OH)D, Turkish population, DBP, Gc gene, D vitamin
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 102

Özet

Ülkemizdeki bireylerde yaygın olarak D vitamin düşüklüğü olduğu birçok çalışmayla gösterilmiştir. Aslında vücutlarında D vitamini seviyesi düşük sanılan bireylerin serbest D vitaminlerine bakıldığında gerçekten düşük olup olmadığı anlaşılmaktadır. D vitamini taşımada vitamin D bağlayan protein (DBP) ana proteindir ancak albümin ile birlikte dolaşımdaki D vitamini metabolitlerinin %99'a kadarını bağlar. Albüminin 25(OH)D'e olan afinitesi DBP'nin afinitesine göre daha düşük olduğu için plazmada bulunan 25(OH)D'ün ancak %10 kadarını taşır. Serbest D vitamini miktarını belirleyen DBP'dir ve dolaşımdaki 25(OH)D'ün %85 ila %90'ını bağlamaktadır. DBP'i kodlayan Gc geninde meydana gelen polimorfizmler toplumlara göre değişkenlik göstermektedir. Gc'de bulunan iki tek nükleotid polimorfizmi (SNP), rs7041 ve rs4588 farklı fenotiplerin oluşmasına (Gc1f, Gc1s ve Gc2) neden olmaktadır. Çalışmanın amacı 25(OH)D seviyesi düzeyi düşük olduğu için D vitamin yetmezliği olduğu sanılan bireylerde, bu düşüklüğün Gc geninindeki polimorfizmlerden kaynaklandığını göstermektir. Şubat-Mayıs 2019 tarihleri arasında kontrol (check-up) amacıyla hastaneye başvuran, son iki yıl içerisinde D vitamini takviyesi almamış toplam 51 beyaz Türk birey çalışmaya dahil edilmiştir. Plazmada 25(OH)D düzeyleri kemiluminesans mikropartikül immunassay yöntemi ve ayrıca sıvı kromotografisi-kütle spektrometrisi (LC-MS/MS) yöntemi ile belirlenmiş, albümin konsantrasyonu kolorimetrik test çalışması ile ölçülmüş ve DBP konsantrasyonu tayini quantikine insan vitamin DBP immunoassay ile gerçekleştirilmiştir. İzole edilmiş olan genomik DNA kullanılarak, rs4588 ve rs7041 tek nukleotit polimorfizimleri (SNP) için genotiplendirme gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile gerçekleştirilmiştir. Türk popülasyonunda en sık görülen genotip rs7041 SNP'sinde GT genotipi (%49) ve rs4588 için ise AC genotipi (%53) olarak tespit edilmiştir. rs7041 SNP'sine göre GG, GT ve TT genotipli bireylerin sırasıyla %31,25, %60 ve %60'ının plazma 25(OH)D düzeyi düşük (p = 0,028, p = 0,103 ve p = 0,262) iken serbest D vitamini düzeylerine göre %6, %28 ve %20'sinin düşük (p = 0,033, p = 0,052, p = 0,486) ve yararlanılabilir D vitaminlerine göre %43,75, %76 ve %70'inin düşük olduğu (p = 0,0171, p = 0,049, p = 0,348) olduğu tespit edilmiştir. rs4588 SNP'sine göre ise AA genotipe sahip bir bireyin plazma 25(OH)D konsantrasyonu düşük görünmesine rağmen serbest ve yararlanılabilir D vitaminleri normal düzeyde çıkmıştır. AC ve CC genotipli bireylerin sırasıyla %52 ve %48'sinin 25(OH)D düzeyi düşük (p = 0,447, p = 0,341) iken serbest D vitaminine göre %30 ve %9'unun düşük (p = 0,028, p = 0,038) ve yararlanılabilir D vitaminine göre %70,4 ve %65,2'sinin düşük olduğu tespit edilmiştir (p = 0,276, p = 0,421). Bireylerin rs7041 ve rs4588 SNP'lerinin kombinasyonlarından kaynaklanan fenotiplerine bakıldığında, en sık görülen fenotiplerin Gc1s/2 ve Gc1s/1s, nadir görülen fenotipin ise Gc1f/1f olduğu tespit edilmiştir. Bulgularımız Türk popülasyonunda rs7041 SNP'si açısından Avrupa popülasyonunun allel frekanslarıyla benzerliğimizi ve rs4588 SNP'si açısından da Gujarati Kızılderilileri ile benzerliğimizi ortaya koymaktadır.

Özet (Çeviri)

Many studies have demonstrated that vitamin D is common among the individuals in our country. In fact, it is determined that individuals who are supposed to have low levels of vitamin D in their bodies have really low levels of the bioavailable vitamin D when measured. Vitamin D binding protein (DBP) is the main protein in vitamin D transport, but it binds up to 99% of the circulating vitamin D metabolites together with albumin. Since the affinity of albumin to 25(OH)Dis lower than the affinity of DBP, it carries only 10% of 25(OH)Din plazma. It is DBP that determines the amount of free vitamin D and binds 85 to 90% of circulating 25(OH)D3. The polymorphisms in the Gc gene encoding DBP vary according to races. Two single nucleotide polymorphisms (SNPs), rs7041 and rs4588 found in Gc gene lead to constitute the different phenotypes (Gc1f, Gc1s and Gc2). The aim of this study is to show that low levels of 25(OH)Dis due to the polymorphisms in DBP gene of individuals who were presumed to have vitamin D deficiency. A total of 51 white Turkish individuals who applied to hospital for check-up between February 2019 and May 2019 and who did not receive vitamin D supplements in the last two years were included in the study. Plazma 25(OH)Dlevels were determined by chemiluminescence microparticle immunassay method as well as liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS / MS) method, albumin concentration was measured by a colorimetric test, and DBP concentration was determined by quantikine human vitamin DBP immunoassay. Using isolated genomic DNA, genotyping for rs4588 and rs7041 single nucleotide polymorphisms (SNPs) was performed by real-time polymerase chain reaction. The most common genotype in the Turkish population was GT genotype (49%) in rs7041 SNP and AC genotype (53%) in rs4588. According to rs7041 SNP, plazma 25(OH)Dlevels of 31.25%, 60% and 60% of individuals with GG, GT and TT genotypes were low (p = 0.028, p = 0.103 and p = 0.262), respectively. 6%, 28% and 20% of them had low levels of free vitamin D (p = 0.033, p = 0.052, p = 0.486) and 43.75%, 76% and 70% had low levels of bioavailable vitamin D (p = 0.0171, p = 0.049, p = 0.348), respectively. According to rs4588 SNP, the plazma 25(OH)Dconcentration of an individual with AA genotype was found to be low, but free and bioavaliable vitamin D levels were normal. While 25(OH)Dlevels of 52% and 48% of individuals with AC and CC genotypes were low (p = 0.447, p = 0.341), 30% and 9% of them had lower free vitamin D (p = 0.028, p = 0.038) and 70.4% and 65.2% of them had lower bioavaliable vitamin D (p = 0.276, p = 0.421), respectively. Considering the phenotypes of individuals resulting from the combination of rs7041 and rs4588 SNPs, the most common phenotypes were Gc1s / 2 and Gc1s / 1s and the rare phenotype was Gc1f / 1f. Our findings show that the Turkish population has similarity with the allele frequencies of European population in terms of rs7041 SNP and similarity with allele frequencies of Gujarati Indians in terms of rs4588 SNP.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    366143

    Türk toplumunda statin kullanımına bağlı gelişen kas iskelet sistemi problemleri ve D vitamini ile ilişkisi

    Development of muskuloskeletal problems with statin treated patients and relationship with vitamin D in the Turkish population

    FATMA ÖZLEM SAPMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonUfuk Üniversitesi

    Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon Bölümü

    PROF. DR. EMİNE SÜREYYA ERGİN

  2. Tez No

    431844

    Türkiye'deki astımlı yetişkin hasta popülasyonunda serum vitamin D düzeylerinin incelenmesi

    The evaluation of serum vitamin D levels in adult patient population with asthma in Turkey

    ÖZGE ORHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Disiplinlerarası Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZELİHA BÜYÜKBİNGÖL

  3. Tez No

    875039

    Gençlerin erişkin başlangıçlı diyabeti'nde (MODY) vitamin D reseptör polimorfizmlerinin araştırılması

    Investigation of vitamin D receptor polimorphisms in maturity onset diabetes of the young

    BEYZANUR ŞİMŞEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    GenetikHaliç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ DENİZ KANCA DEMİRCİ

  4. Tez No

    597977

    D vitamini eksikliğinin derecesi ile komorbid hastalık sayısının ilişkisi

    The relationship between the degree of vitamin D deficiency and the number of comorbid diseases

    SAVAŞ ÇELEBİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    ÖĞR. GÖR. FATİH BORLU

  5. Tez No

    230486

    Tonsillektomi olmuş çocuklarda serum D vitamini düzeyleri ve gen polimorfizmleri

    Plasma vitamin D levels and gene polymorphisms among children with tonsillectomies

    SALİH AYDIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Kulak Burun ve Boğazİstanbul Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMET ASLAN

Geri Dön