Antalya domates üretim alanlarından izole edilen Fusarium izolatlarının genotipik ve fenotipik karakterizasyonu
Genotypic and phenotypic characterization of Fusarium isolates obtained from Antalya tomato production areas
- Tez No: 644343
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZER ÇALIŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Türkiye'de çok miktarda yetiştirilen ve tüketilen domatesin üretimini kısıtlayan önemli biyotik hastalıklar bulunmaktadır. Toprak kökenli fungal Fusarium hastalık etmenleri domates bitkilerinde kök ve kök boğazı hastalıklarının nedeni olarak domates üretiminde önemli ürün kayıplarına sebep olmaktadır. Kışlık domates üretim merkezi olan Antalya ve ilçelerinde daha önce yapılan sürveylerle elde edilen 20 Fusarium izolatının bu çalışmada moleküler yöntemlerle avirulenslik ve virulenslik durumları karakterize edilmiştir. Farklı 5 genotip domates çeşidi bu 20 izolat ile patojenisite testlerine tabi tutulmuştur. Fusarium patojenlerinin virenslikten sorumlu genlerini içeren spesifik primerler kullanılarak hastalık etmenlerinin genotipik yapıları araştırılmıştır. Patojenisite testlerinde fenotipik olarak FORL izolatlarının 1 ve 9 izolatları, FOL içerisinde 8 ırk 2 ve FOL 2 ırk 3 izolatları en virulent izolatlar olarak bulunmuştur. Test edilen 4 dayanıklı ve 1 hassas ticari çeşit ile 13 FOL ve 7 FORL arasında gen-için-gen ilişkisi ortaya konmuştur. Moleküler çalışmalar 13 FOL ve 7 FORL izolatında Avr1 geninin olmadığını gösterirken FOL 5 ırk 3 ve FOL 13 ırk 3 izolatlarında Avr2 ve Avr3 genleri tespit edilmiştir. Tüm 13 FOL ve 7 FORL izolatlarının hücre duvarını parçalayan Fga1, Snf1, Frp1, Chsv, Xy12, Fem1, Arg genlerini içerdiği bu moleküler çalışmalarda belirlenmiştir. Böylece Fusarium patojenlerinin sahip oldukları avirulens genlerle bitkilerin dayanıklılık genleri arasındaki konukçu-patojen ilişkisi bu çalışmayla gösterilmiştir. Bu durum gelecekte Fusarium patojenlerinin konukçu domates bitkilerinde hedef aldığı proteinlerin belirlenmesine ve bu ilişkilerin konukçu lehine düzenlenmesine olanak sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
There are important biotic pathogens limiting production of tomatoes and their consume in Turkey. Soil-borne fungal Fusarium pathogens cause tomato root rot, browning in vascular tissues, wilting and chlorosis on leaves leading significant yield loss in tomato grown areas. Antalya and its districts are center of winter grown tomato where surveys were previously conducted, total 20 Fusarium isolates were determined. In this study, we aim to characterize avirulence and virulence situations of the Fusariıum isolates by molecular methods. There are 5 different tomato genotypes were inoculated with the 20 Fusarium isolates in pathogenicity tests. Specific primers which were developed from avirulence and virulence gene's regions of Fusarium isolates were amplified for their genotypes in molecular analyses. The pathogenicity tests revealed that 1st and 9th isolates of FORL and FOL 8 race 2 and FOL 2 race 3 isolates were most virulent found. Pathogenicity test also exhibited that 4 resistant and 1 susceptible commercial tomato varieties have gene-for-gene interaction with 13 FOL and 7 FORL isolates. Moleculer studies with 13 FOL and 7 FORL isolates showed that they do not have Avr1 gene but Avr2 and Avr3 genes were present in 5th and 13th FOL isolates. All tested 13 FOL and 7 FORL isolates have cell wall degrading Fga1, Snf1, Frp1, Chsv, Xy12, Fem1, Arg genes in the molecular analyses. The molecular and pathogenicity studies have identified possible virulence genes of Fusarium isolates and their counterpart in resistance genes of tomato plants revealing host-pathogen interactions. These results already enlightened Fusarium pathogens, further studies will reveal their target proteins in host tomato plants to gain resistance for host tomato plants.
Benzer Tezler
- Amerika domates genetik kaynakları merkezinden temin edilen domates hatlarının fusarium etmenlerine (Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici ve Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici) karşı dayanıklılık reaksiyonlarının belirlenmesi
Identification of resistance reactions of tomato lines obtained from American tomato genetics resources center to fusarium pathogens (Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici and Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici)
SEMRA CAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZER ÇALIŞ
- Batı Akdeniz bölgesi domates üretim alanlarında domates kloroz virüsü (Tomato Chlorosis Virus; ToCV)'nün biyolojik ve moleküler karakterizasyonu
Molecular chracterization and biological of tomato chlorosis virus (ToCV) in tomato production areas in Western Mediterranean region
NEVİN AKDURA
Doktora
Türkçe
2011
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BAYRAM ÇEVİK
- Domateste Sw-5 dayanıklılığını kıran Tswv izolatlarının belirlenmesi için real time pcr yöntemi geliştirilmesi
Development of real time pcr method for determination of Tswv isolates breaking tomato Sw-5 resistance
TUĞÇE KOCAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAYRAM ÇEVİK
- Antalya ili jerbera üretim alanlarında görülen bazı virüs hastalıklarının belirlenmesi
Determination of some virus diseases on gerbera plants in Antalya province
BETÜL ALBAYRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatSelçuk ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERKAN YEŞİL
- Antalya ili domates üretim alanlarında kök ve kök boğazı çürüklüğüne neden olan Phytophthora türlerinin ve bazı domates genotiplerinin önemli türlere karşı reaksiyonlarının belirlenmesi
Determination of Phytophthora species causing root and crown rot on tomato growing areas in Antalya province and reactions of some tomato genotypes against important species
EMİNE GÜMRÜKCÜ
Doktora
Türkçe
2023
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜRSEL KARACA