Development of a non-radioactive diagnostic test for the detection of microsatellite instability in colorcctl cancer
Kolon kanserinde görülen mikrosatellite kararsızlığının incelenmesi için radyoaktif olmayan bir tanı testinin geliştirilmesi
- Tez No: 65020
- Danışmanlar: DOÇ. DR. TAYFUN ÖZÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 1997
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 74
Özet
ÖZET İnsan tümörlerinde görülen mikrosatellit kararsızlığının incelenmesi için radyoaktif olmayan bir tanı testinin geliştirilmesi Korkut Vata Yüksek Lisans Tezi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Tez Danışmanı: Doç. Dr. Tayfun Özçelik Ağustos 1997, 60 sayfa İnsan genomunda çeşitli sebeplerle mutasyonların oluşumu kanser gelişimi için atılan ilk adımdır. DNA tamir mekanizmasının bozulması veya eksik çalışmasına neden olan mutasyonlar ikincil olarak“mikrosatellit bölgeleri”olarak adlandırılan ve bir DNA dizi motifinin tekrarlandığı bölgelerde yeni mutasyonların oluşmasına yol açarlar. Bu mikrosatellit bölgelerinde bulunan tekrar dizileri aynı kişinin normal ve tümör gelişmiş dokusunda incelendiğinde farklılıklar gösterir. Bu durum“mikrosatellit kararsızlığı”olarak adlandırılmaktadır. Özellikle kolon kanserinin bir türü olan ailesel polipozsuz kolon kanseri başta olmak üzere bir çok kanser türünde tümör dokusunda“mikrosatellit kararsızlığının”varlığı gösterilmiştir. Yapılan son araştırmalara göre mikrosatellit kararsızlığı tümör dokusundan vücut sıvılarına (kan, idrar ve bunun gibi) kansan DNA örneklerinin incelenmesi ile de tespit edilebilmektedir. Tümör dokusunun direkt olarak incelenmesini gerektirmeyen bu gelişme kanserin erken tanısında kullanılabilecek önemli bir DNA testi olma potansiyelini taşımaktadır. Henüz araştırma laboratuvarlarında yürütülen mikrosatellit analizi deneylerinde radyoaktiviteye dayanan teknikler kullanılmaktadır. Halbuki klinik tam amaçlı DNA testlerinin radyoaktif olmayan metodlarla gerçekleştirilmesi tercih edilmektedir. Bu tezin amacı insan tümörlerinde görülen mikrosatellit kararsızlığının incelenmesi için radyoaktif olmayan bir tam testinin geliştirilmesidir. Bu nedenle aşağıda belirtilen mikrosatellit işaretleyicileri seçilmiş ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile çoğaltılması için gerekli koşullar optimize edilmiştir. Bu mikrosatellit işaretleyicileri şunlardır: i. tek nükleotid tekrarlan BAT25 ve BAX geninin bir bölgesi, ü. ikili nükleotid tekrarlan D5S105, D6S291, D11S904, D13S175, D17S855, ve iii dörtlü nükleotid tekrarı FGA. Buna ek olarak tek nükleotid tekrarlan altı kolorektal kanser hastasının parafine gömülü veya taze doku örnekleri ile kan örneklerinden elde edilen DNA üzerinde poliakrilamid jel elektroforezi ve gümüş boyama teknikleri kullanılarak incelenmiştir. rv
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Development of a non-radioactive diagnostic test for the detection of microsatellite instability in human tumors Korkut Vata M. S. in Molecular Biology and Genetics SupervisonAssoc. Prof. Dr. Tayfun özçelik August 1997, 60 pages Stepwise accumulation of mutations in the human genome is the initial step in carcinogenesis. Microsatellites are the regions which are first hit by the mutations resulting from mismatch repair deficiency. Until today microsatellite alterations have been shown mainly in hereditary non-polyposis colon cancer (HNPCC) and several other cancer types. Recent advances indicate that microsatellite alterations can also be detected in DNA samples (such as blood, urine, etc.), which are shed from tumors. This is an important finding for the early diagnosis of cancer since malignant cells can be detected in tissues other than the primary tumor. Therefore microsatellite analysis, when coupled with an easy, powerful screening technique could have a high diagnostic value for cancer types other than colorectal cancer. Despite its drawbacks the most common microsatellite screening method is based on the use of radioisotopes and autoradiography. However in the clinical setting non-radioactive detection methods are preferred. The aim of this thesis is development of a non-radioactive diagnostic test for the detection of microsatellite instability in genomic DNA which can be used for the early detection of some forms of cancer. Therefore we have optimized the PCR conditions for eight microsatellite markers which are: / mononucleotide repeats BAT25 and intragenic repeat region of BAX gene, ii. dinucleotide repeats D5S105, D6S291, D11S904," D13S175, D17S855, and in. tetranucleotide repeat FGA. In addition, we have analyzed the mononucleotide repeat markers in blood, paraffin embedded and fresh tumor samples of six colorectal cancer patients with polyacrylamide gel electrophoresis and silver staining m
Benzer Tezler
- 99mTc-sitro-folat sentezi ve radyofarmasötik potansiyelinin incelenmesi
The synthesis of 99mTc-citro-folate and investigation of radiopharmaceutical potential
BURCU ALTIPARMAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyokimyaEge ÜniversitesiNükleer Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA YURT LAMBRECHT
- Glioblastom teşhis ve tedavisi i̇çin tümöre hedeflendirilmiş nano i̇laç taşiyici si̇stemler üzerinde i̇n vitro çalişmalar
In vitro studies on tumor targeted nano drug delivery systems for diagnostic and treatment of glioblastoma
ARZU CEYLAN HAS
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiNanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SUNA ERDOĞAN
PROF. DR. SÜHEYLA ÖZBEY
- Development of ceramic and glass-ceramic shielding materials for protection from ionizing radiation
İyonizan radyasyondan korunmak için seramik ve cam seramik zırhlama malzemelerin geliştirilmesi
ABDULLAH OKYAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Enerjiİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMA ERENTÜRK
- Tıbbi radyasyon zırhlamalarında kullanılabilecek çok fonksiyonlu mikro/nano kompozit malzemelerin geliştirilmesi ve dozimetrik özelliklerinin incelenmesi
Development and investigation of dosimetric properties of multifunctional micro / nano composite materials that can be utilized in medical radiation shielding
MUSTAFA ÇAĞLAR
Doktora
Türkçe
2021
Fizik ve Fizik MühendisliğiYıldız Teknik ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN İÇELLİ
DOÇ. DR. HİLAL ACAR DEMİR