Geri Dön

Orta Karadeniz'den örneklenen bazı yengeç türlerinin 18s rDNA ve mitokondriyal sitokrom oksidaz I (COI) genlerine dayalı moleküler analizi

Molecular analysis of some crab species sampled from the Middle Black Sea based on 18s rDNA and mitochondrial cytochrome oxidase I (COI) genes

PDF İndir

  1. Tez No: 656030
  2. Yazar: ALİ ALPER ERDEM
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. YILMAZ ÇİFTCİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Balıkçılık Teknolojisi, Genetik, Fisheries Technology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ordu Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Bu tez çalışmasında, Orta Karadeniz'de dağılım gösteren Liocarcinus navigator, Liocarcinus depurator ve Eriphia verrucosa türlerinin genetik yapısı belirlenmiş, gen bankasındaki bu familyanın üyeleri arasındaki genetik ilişkinin derecesi mtDNA ve rDNA sekans analiz yöntemiyle analiz edilerek soyağacı çıkartılmıştır. Çalışılan gen bölgeleri PZR yöntem ile çoğaltılarak gen dizilimleri belirlenmiştir. Örneklemesi yapılan yengeç türleri bölgede ticari olarak kullanılan farklı av araçları elde edilmiştir.18S rDNA gen bölgesi 718 bç'nden 649 bç'nin (%90.4) pozisyonunun korunmuş ve 10 bç'nin (%14.5) polimorfik bilgi verici olan 69 bç'nin (%9.6) nükleotid pozisyonunda değişken olduğu belirlenmiştir. Çalışılan türler için 18S rDNA nükleotit çeşitlilik değeri (Pi) 0.02472 ve haplotip çeşitlilik değeri (Hd) 1 olarak hesaplanmıştır. mtDNA COI gen bölgesi 456 bç'nden 44 bç'nin (%9.6) pozisyonunun korunmuş ve 312 bç'nin (%75.7) parsominok bilgi verici olan 412 bç'nin (%90.4) nükleotid pozisyonunda değişken olduğu belirlenmiştir. Çalışılan türler için nükleotid çeşitlilik değeri (Pi) 0.3546 ve haplotip çeşitlilik değeri (Hd) 1 olarak hesaplanmıştır.

Özet (Çeviri)

In this thesis, the genetic structure of the Liocarcinus navigator, Liocarcinus depurator and Eriphia verrucosa species distributed in the Middle Black Sea was determined, the genetic relationship between the members of this family in the gene bank was analyzed by mtDNA and rDNA sequence analysis method and the genealogical tree was extracted. The studied gene regions was determined by PCR amplification. The sampled crab species were obtained by different commercially fishing gear used in the region. For the 18S rDNA partial gene region, a total of 718 characters for each of the individuals sequenced were aligned, 649 (90.4%) characters were constant, 69 (9.6%) characters were variable and 10 (14.5%) variable characters were parsimony-informative under the MP optimality criterion. For the studied species, 18S rDNA nucleotide diversity (Pi) and haplotype diversity (Hd) values were calculated as 0.02472 and 1, respectively. For the mtDNA COI gene region, a total of 456 characters for the individuals sequenced were aligned, 44 (9.6%) characters were constant, 412 (90.4%) characters were variable and 312 bp (75.7%) variable characters were parsimony-informative under the MP optimality criterion. Also, mtDNA COI nucleotide diversity (Pi) and haplotype diversity (Hd) values were calculated as 0.3546 and 1, respectively.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    406178

    Orta Karadeniz balıkçılığındaki bazı pelajik ve demersal balık türlerinin sagittal otolitlerinin morfometrik tanımlanması ve annulus oluşumunun görsel analizi

    Morphometric description and visual analysis of the annulus formation in sagittal otoliths of some pelagic and demersal fish species in the Middle Black Sea region fishery

    AYÇA YORAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Hidrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYSUN GÜMÜŞ

  2. Tez No

    377223

    Orta Karadeniz'deki tekir balığı (Mullus surmuletus L., 1758) populasyonunun bazı biyolojik özellikleri

    Some of biological characters of striped red mullet (Mullus surmuletus Linnaeus, 1758) population in the Middle Black Sea region, Turkey

    BEGÜM ERMİŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Su ÜrünleriMarmara Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÜNAL ERDEM

  3. Tez No

    1755

    Anadolu karaçamı (Pinus nigra Arn.ssp.pallasiana Lamb.Holmboe)nın coğrafik varyasyonları

    Variabilite geographique de Pinus nigra Arn.ssp.pallasiana Lamb. Holmboe

    C. ÜNAL ALPTEKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1986

    Ormancılık ve Orman Mühendisliğiİstanbul Üniversitesi

    Silvikültür Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SUAD ÜRGENÇ

  4. Tez No

    178028

    Demirköy-İğneada longos ormanları ve çevresinin bitki toplumları ve kuruluş özellikleri

    The plant communities and structural properties of Igneada floodplain forests and their surroundings

    ALİ KAVGACI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Orman Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. GÜLEN ÖZALP

  5. Tez No

    166969

    Trace metal composition of particulate metter in the water column and sediments of the Black Sea and regional rivers

    Karadeniz sedimanında, su kolonunda ve bölge nehirlerindeki parçacık madde eser element kompozisyonu

    OĞUZ YİĞİTERHAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2005

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimyasal Oşinografi Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. SEMAL YEMENİCİOĞLU

Geri Dön