Preimplantasyon embriyo gelişim sürecinde DNMT1 ve DNMT3A genlerinin rolleri
The roles of DNMT1 and dnmt3a genes during preimplantation embryo development
- Tez No: 672762
- Danışmanlar: PROF. DR. ALP CAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Histoloji ve Embriyoloji, Histology and Embryology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Bir epigenetik mekanizma olan DNA metilasyonu, memelilerde ovogenez ve erken embriyo gelişim süreçlerinde önemli rol oynar. Ek olarak, DNA metilasyonu ovosit ve erken dönemdeki embriyonun gelişim süreçlerinde kritik rol oynayan genlerin transkripsiyonunda aktivatör veya baskılayıcı olarak rol alır. DNA metilasyonu, CpG adacıklarında ya da CpG adacığı olmayan alanlarda sitozin nükleotidinin beşinci karbon atomuna metil grubunun bağlanmasıyla gerçekleşir. Sürdürme ve de novo (yeni baştan) metilasyonu olmak üzere iki biçimde gerçekleşen bu mekanizmalar DNA metiltransferaz (DNMT) enzimleri tarafından katalizlenir. Memelilerde altı farklı DNMT enzimi (DNMT1, DNMT2, DNMT3A, DNMT3B, DNMT3C ve DNMT3L) tanımlanmıştır, DNMT1 sürdürme metilasyonundan sorumluyken DNMT3A de novo metilasyonunda görev alır. Bilindiği üzere, sürdürme ve de novo metilasyonu erken dönemdeki embriyonun gelişiminde gerçekleşir. Bu çalışmanın amacı Dnmt1 and Dnmt3a genlerinin susturulmasıyla preimplantasyon dönemindeki embriyonun gelişimi üzerine olan etkisini araştırmaktır. Bu amaçla fare embriyolarının in vitro ortamda gelişimi modeli üzerinde dört grup oluşturuldu; kontrol, Dnmt1 siRNA, Dnmt3a siRNA ve hedef olmayan geni içeren siRNA grubu. Dnmt genlerini susturmadaki başarı protein seviyesinde immünfloresan ve Western blot yöntemi yöntemiyle değerlendirildi. Dnmt1 ve Dnmt3a genlerini 1 hücreli aşamada susturduktan sonra, embriyonun gelişimi kapasitesi ve global DNA metilasyonu analizi immünfloresan yöntemle blastokist aşamasında analiz edildi. Fare embriyolarında Dnmt genlerini başarılı olarak susturuldu. Bu genlerin preimplantasyon dönemindeki embriyolarda kritik olduğunu saptandı. İlginç olarak; Dnmt1 siRNA uygulanan gruptaki blastokistlerde global DNA metilasyonu kontrol grubuna göre anlamlı olarak azalmış ve Dnmt3a siRNA uygulanan gruptaki blastokistlerde ise kontrol grubuna göre anlamlı artış saptandı (P
Özet (Çeviri)
DNA methylation is one of the epigenetic mechanisms and plays important roles during oogenesis and early embryo development in mammals. In addition, DNA methylation have important roles on transcriptional repression or activation of genes which critical during early oocyte and embryo development. DNA methylation is basically known as adding a methyl group to the fifth carbon atom of cytosine residues within cytosine-phosphate-guanine (CpG) and non-CpG dinucleotide sites. This mechanism is composed of two main processes: de novo methylation and maintenance methylation, both of which are catalyzed by specific DNA methyltransferase (DNMT) enzymes. To date, six different DNMT enzyme have been characterized in mammals defined as DNMT1, DNMT2, DNMT3A, DNMT3B, DNMT3C, and DNMT3L. While DNMT1 primarily functions in maintenance methylation, DNMT3A is essentially responsible for de novo methylation. As it is previously shown, either maintenance or de novo methylation processes appears in early embryo development. The aim of the present study was to investigate the role of Dnmt1 and Dnmt3a genes in preimplantation embryo development by knocking down Dnmt1 and Dnmt3a genes. For this purpose, the following groups were created in an in vitro mouse embryo model: control, Dnmt1 siRNA, Dnmt3a siRNA and non-targeted siRNA groups. Knockdown of Dnmt genes using siRNA was confirmed by analyzing the proteins using immunofluorescence and Western blot techniques. Following knockdown of Dnmt1 and Dnmt3a in one-cell mouse embryos, we analyzed the developmental competence of embryos and global DNA methylation levels by immunofluorescence in blastocyst stage. We found that both Dnmt genes were successfully knockeddown in mouse embryos and found out that these genes play critical roles in mouse preimplantation embryo development. Interestingly, we found that global DNA methylation level significantly decreased in Dnmt1 knockdown group while increased in Dnmt3a knockdown group (P
Benzer Tezler
- Fare preimplantif embriyo gelişim sürecinde FOXO1, FOXO3 ve FOXO4 ekspresyonlarının değerlendirilmesi
The evaluati̇on of expressi̇ons of FOXO1, FOXO3,and FOXO4 duri̇ng prei̇mplantati̇on embryo development i̇n mi̇ce
NİLAY KUŞCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Histoloji ve EmbriyolojiAkdeniz ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇİLER ÇELİK ÖZENCİ
- Determination of the relationship between c-abl protein tyrosine kinase and yap in cell fate determination during mouse preimplantation embryonic development
Farede preimplantasyon dönemi embriyonal gelişiminde hücre kaderinin belirlenmesinde c-abl protein tirozin kinaz ile yap arasındaki ilişkinin belirlenmesi
ECEM YILDIRIM
Doktora
İngilizce
2023
Histoloji ve EmbriyolojiYeditepe ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYLİN YABA UÇAR
- Farelerde preimplantasyon gelişim sürecinde c-Abl proteinin lokalizasyonu
Localization of c-Abl protein in preimplantation mouse development
DUYGU MUTLUAY
Doktora
Türkçe
2014
Histoloji ve EmbriyolojiMehmet Akif Ersoy ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN ÖNER
YRD. DOÇ. DR. VERNADETH B. ALARCON
- CRISPR/CAS9 kullanılarak sığır preimplantasyon embriyolarının trofektoderm farklılaşmasında CDX2 rolünün araştırılması
Investigation of CDX2 role in trophectoderm differentiation of bovine preimplantation embryos by using CRİSPR/CASs9
EMEL TÜTEN SEVİM
Doktora
Türkçe
2023
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL KARABAĞ
- Preimplantasyonel embriyonik gelişimde ın vivo ve ın vitro asidoz defans mekanizmalarının karşılaştırılması
Comparison of in vivo and in vitro acidosis defense mechanisms in preimplantation embryonic development
ÖZLEM IŞIĞIBOL GEZGİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
FizyolojiÇukurova ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞEREF ERDOĞAN