Geri Dön

Miyeloid malignensilerde, KLF-4, NANOG, SALL4, OCT3/4, C-MYC ve GATA2 ekspresyon düzeylerinin araştırılması

Investigation of KLF-4, NANOG, SALL4, OCT3/4, C-MYC AND GATA2 expression levels in myeloid malignancies

PDF İndir

  1. Tez No: 682193
  2. Yazar: MEHMET KORAY ÖZKAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZLEM İZCİ AY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Biyobelirteçler-tümör, Gen ifadesi, Hematopoetik kök hücre transplantasyonu, Hematopoetik kök hücreler, Lösemi-miyeloid, Neoplazmlar, Biomarkers-tumor, Gene expression, Hematopoietic stem cell transplantation, Hematopoietic stem cells, Leukemia-myeloid, Neoplasms
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Miyeloid malignensiler hematopoetik kök hücrelerin proliferasyon, farklılaşma ve kendini yenileme gibi aktivitelerinde meydana gelen değişiklikler sonucu ortaya çıkan klonal hastalıklardır. Miyeloid malignensilerle ilişkilendirilmiş birçok gen mutasyonu tanımlanmıştır, ancak tanı ve tedavide yeterli değildir. Bu durumun en büyük nedeni tanımlanan mutasyonların hastalar arasında oldukça değişkenlik göstermesidir. Miyeloid malignensiler genellikle rutin taramalarda tespit edilmektedir ve tanıda kullanılabilecek moleküler tanı belirteçleri oldukça sınırlıdır. Mevcut moleküler tanı belirteçleri tek başına kesin tanıda yeterli olamamaktadır. Tanı belirteçlerinin belirlenmesi kesin tanıyı kolaylaştırıp tedavinin daha etkili yapılmasını sağlayacaktır. Çalışmamızda, miyeloid malignensi tanısı almış 102 hasta (28 AML, 19 KML, 34 MDS, 11 PV, 10 ET) ve sağlıklı 13 kontrol olmak üzere toplam 115 bireyin kemik iliği örneğini kullandık. Miyeloid malignensilerde, ifade seviyelerindeki değişimi araştırdığımız KLF-4, NANOG, SALL4, OCT3/4, c-MYC ve GATA2 genleri hematopoetik kök hücrelerin yaşamsal faaliyetlerinin düzenlenmesinde ve hematopoezde görev almaktadır. Tüm hastalık gruplarında genlerin ifade seviyesindeki değişimi hem kontrol grubuna göre hem de hastalık grupları arasında kıyasladık. Ayrıca genlerin ifade seviyelerinin değişimindeki korelasyonları her hastalık grubunda araştırdık. Genlerin ifade seviyelerindeki değişim tüm gruplarda topluca kıyaslandığında, GATA2 (p=0,012), KLF4 (p<0,001) ve c-MYC (p<0,001) genlerinin ifade seviyesindeki değişim istatistiksel olarak anlamlı bulunurken; NANOG (p=0,270), OCT3/4 (p=0,532) ve SALL4 (p=0,483) genlerinin ifade seviyesindeki değişim istatistiksel olarak anlamsız bulundu. Genlerin ifade seviyesi arasındaki korelasyon incelendiğinde KLF4-SALL4(r=0,238;p=0,010), KLF4-NANOG(r=0,350;p=0,000), KLF4-cMYC(r=0,376;p=0,000), SALL4-NANOG(r=0,249;p=0,007), SALL4-cMYC(r=0,185;p=0,048), NANOG-OCT3/4(r=0,314;p=0,001), NANOG-cMYC(r=0,235;p=0,011) ve OCT3/4-cMYC(r=0,185;p=0,047) genleri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulundu. Sonuç olarak, elde ettiğimiz bulgulardan istatistiksel olarak anlamlı bulunan genlerin tanı belirteci ve ilaç hedefi adayı olarak değerlendirilip, gelecekte bu alanda yapılacak çalışmalara ön veri sunabileceğini düşünmekteyiz.

Özet (Çeviri)

Myeloid malignancies are clonal diseases that occur as a result of changes in the activities of hematopoietic stem cells such as proliferation, differentiation and self-renewal. Many gene mutations associated with myeloid malignancies have been described, but they are not sufficient for diagnosis and treatment. The biggest reason for this situation is that the identified mutations vary widely among patients. Myeloid malignancies are usually detected in routine screening and molecular diagnostic markers that can be used in diagnosis are very limited. Existing molecular diagnostic markers alone are not sufficient for definitive diagnosis. Determination of diagnostic markers will facilitate the definitive diagnosis and provide more effective treatment. In our study, we used bone marrow samples of a total of 115 individuals, including 102 patients (28 AML, 19 CML, 34 MDS, 11 PV, 10 ET) diagnosed with myeloid malignancy and 13 healthy controls. KLF-4, NANOG, SALL4, OCT3/4, c-MYC and GATA2 genes, whose expression levels we investigated in myeloid malignancies, are involved in the regulation of the vital activities of hematopoietic stem cells and in hematopoiesis. We compared the change in the expression level of genes in all disease groups, both compared to the control group and between the disease groups. We also investigated correlations in the variation of expression levels of genes in each disease group. When the changes in the expression levels of the genes were compared in all groups, the change in the expression level of the GATA2 (p=0.012), KLF4 (p<0.001) and c-MYC (p<0.001) genes was found to be statistically significant; The change in the expression level of NANOG (p=0.270), OCT3/4 (p=0.532) and SALL4 (p=0.483) genes was found to be statistically insignificant. When the correlation between the expression levels of the genes was examined, a statistically significant correlation was found between the KLF4-SALL4 (r=0,238;p=0,010), KLF4-NANOG (r=0,350;p=0,000), KLF4-cMYC (r=0,376;p=0,000), SALL4-NANOG (r=0,249;p=0,007), SALL4-cMYC (r=0,185;p=0,048), NANOG-OCT3/4 (r=0,314;p=0,001), NANOG-cMYC (r=0,235;p=0,011) and OCT3/4-cMYC (r=0,185;p=0,047) genes. As a result, we think that the genes that are statistically significant from the findings we have obtained can be evaluated as diagnostic markers and drug target candidates and can provide preliminary data for future studies in this field.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    522098

    Miyeloid hematolojik malignensilerde miRNA oluşum yolağındaki genlerin ekspresyon düzeylerinin araştırılması

    The investigation of expression levels of miRNA biogenesis genes in myeloid hematological malignancies

    KENAN ÇEVİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Tıbbi BiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ERTAN AY

  2. Tez No

    351356

    Hematolojik malignensilerde konvansiyonel sitogenetik, moleküler ve moleküler sitogenetik uygulamalar

    Conventional cytogenetics, molecular and moleccular cytogenetics aplications in hematological malignancies

    BARBAROS YİĞİT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Tıbbi BiyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. PINAR ASLAN KOŞAR

  3. Tez No

    40190

    Hematolojik malignansilerde miyeloid stem hücre (CFU-GM) oluşumunun değerlendirilmesi

    The Formation of the myeloid stem cell (CFU-GM) in hematological malignancies

    GÜLLÜ TOPAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Allerji ve İmmünolojiHacettepe Üniversitesi

    PROF.DR. EMİN KANSU

  4. Tez No

    233774

    Kronik myeloid lösemili hastalarda DAP kinaz geninin metilasyon analizleri

    The meyhlation analysis of DAP kinase gene in chronic myelodi leukemia patients

    SELCEN ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ASUMAN SUNGUROĞLU

  5. Tez No

    577725

    Miyeloid malignansilerde hematopoetik miRNA ekspresyonlarının araştırılması

    Investigation of miRNA ekspressions in Myeloid hematopoietic malignancies

    CEMİLE ERSÖZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Tıbbi BiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ERTAN AY

Geri Dön