Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında YTHDF1 ve YTHDF3 RNA metilasyon gen düzeylerinin araştırılması
Investigation of YTHDF1 and YTHDF3 rna methylation gene levels in crimean congo hemorrhagic fever patients
- Tez No: 686294
- Danışmanlar: PROF. DR. SERDAL ARSLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Tıp Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 83
Özet
Kırım Kongo Kanamalı Ateşi (KKKA) hastalığına neden olan, Kırım Kongo kanamalı ateş virüsü (KKKAV), Nairoviridae ailesi içinde Orthonairovirus cinsine ait bir RNA virüsüdür. KKKA %5-30 ölüm oranı ile seyreden ciddi bir viral hastalıktır. N6-metiladenozin (m6A) mRNA'da stabilite, splaysing ve translasyonda görev alan bir RNA modifikasyonudur. m6A modifikasyonu; yazıcılar, siliciler ve okuyucular olmak üzere 3 kısımdan oluşmaktadır. Okuyucu ailesine ait olan YTHDF1 ve YTHDF3 genleri metilli mRNA'ya bağlanarak bu mRNA'nın stabilitesini, ifadesini ve translasyonunu düzenlemekle görevlidir. Ayrıca YTHDF3 geni YTHDF1 geni ile kompleks oluşturarak translasyon verimliliğini arttırmaktadır. YTHDF3, diğer okuyucu proteinler ile etkileşime girerek mRNA yıkılmasına aracılık edebilir. Bu çalışma KKKA hastalığı ile adı geçen YTHDF1 ve YTHDF3 RNA genlerinin ekspresyon seviyelerinin incelendiği ilk çalışmadır. Çalışmamızda 40'ı kontrol, 60'ı KKKA hastası olmak üzere 100 adet kan örneği kullanıldı ve bu kan örneklerinden Total RNA izolasyonu yapıldı. Daha sonra SYBR Green temelli qPCR gerçekleştirilerek YTHDF1 ve YTHDF3 RNA genlerinin ekspresyon düzeyleri belirlendi. Bu çalışmada YTHDF1 ve YTHDF3 ifade düzeyleri hasta-kontrol, ölen-kontrol ve şiddetli-hafif grupları arasında karşılaştırılmıştır. YTHDF1 ve YTHDF3'ün ifadesi istatistiksel olarak anlamlı olmamakla birlikte hasta ve kontrol grubu arasında YTHDF1 1,21 (p=0,56), YTHDF3 2,99 kat azalmıştır (p=0,18). Ölenler ve kontrol grubu karşılaştırıldığında ölenlerde YTHDF1'in 1,29 (p=0,84) ve YTHDF3'ün 1,41 kat azaldığı (p=0,67) gözlenmiştir. Hastalığı hafif geçirenlere göre hastalığı şiddetli geçirenlerde YTHDF1 1,14 (p=0,35), YTHDF3 ise 1,46 kat azalmıştır (p=0,30). Sonuç olarak KKKA hastalığında YTHDF1 ve YTHDF3 ifadesinin azalması hastalığın seyrinde etkili olabilir.
Özet (Çeviri)
Crimean Congo Hemorrhagic Fever (CCHF) is an RNA virus belonging to the Orthonairovirus genus in the Nairoviridae family. CCHF is a serious viral disease with a mortality rate of 5-30%. N6-methyladenosine (m6A) is an RNA modification involved in stability, splicing and translation of mRNA. m6A modification; It consists of 3 parts: writers, ereasers and readers. The YTHDF1 and YTHDF3 genes belonging to the reader family are responsible for regulating the stability, expression and translation of this mRNA by binding to methylated mRNA. In addition, the YTHDF3 gene increases the translation efficiency by forming a complex with the YTHDF1 gene. YTHDF3 can mediate mRNA degradation by interacting with other reader proteins. This study is the first to examine the expression levels of YTHDF1 and YTHDF3 RNA genes mentioned with CCHF disease. In our study, 100 blood samples, 40 of which were controls and 60 of whom were CCHF patients, were used and Total RNA was isolated from these blood samples. Then, expression levels of YTHDF1 and YTHDF3 RNA genes were determined by performing SYBR Green-based qPCR. In this study, YTHDF1 and YTHDF3 expression levels were compared between patient-control, deceased-control, and severe-mild groups. Although the expression of YTHDF1 and YTHDF3 was not statistically significant, YTHDF1 decreased 1.21 (p=0.56) and YTHDF3 2.99-fold (p=0.18) between the patient and control groups. When the deceased and the control group were compared, it was observed that YTHDF1 decreased by 1.29 (p=0.84) and YTHDF3 decreased by 1.41 times (p=0.67) in the deceased. Compared to those with mild disease, YTHDF1 was decreased by 1.14 (p=0.35) and YTHDF3 was decreased by 1.46 times (p=0.30) in those with severe disease. In conclusion, decreased expression of YTHDF1 and YTHDF3 in CCHF disease may be effective in the course of the disease.
Benzer Tezler
- Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında mir-126-3p ve mir-142-5p ifade düzeylerinin araştırılması
Investigation of mir-126-3p and mir-142-5p expression levels in patients with crimean congo hemorrhagic fever
NAZIM ESERYEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Tıbbi BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERDAL ARSLAN
- Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında serum transforming growth factor-beta ve platelet derived growth factor düzeylerinin klinik seyir ve prognozla ilişkisi
Relationship between serum transforming growth factor-beta and platelet derived growth factor levels with clinical course and prognosis in crimean congo hemorrhagic fever patients
NAZAN CİNİSLİOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAtatürk ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMALETTİN ÖZDEN
- Kırım-kongo kanamalı ateşi hastalarında miRNA-1908 ve miRNA-144 RNA ifade düzeylerinin araştırılması
Investigation of miRNA-144 and miRNA-1908 expression levels in crimean-congo hemorrhagic fever patients
ÖZLEM ALDEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSivas Cumhuriyet ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYNUR ENGİN
- Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi hastalarında serum anjiopoietin like protein düzeylerinin araştırılması
Investigation of serum angiopoietin-like protein levels in Crimino-Congo Hemorative Fever patients
SÜMEYYE YEŞİLDAĞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEYİT ALİ BÜYÜKTUNA
- Kırım-kongo kanamalı ateşi hastalarında uzun kodlama yapmayan RNA NRAV ve uzun kodlama yapmayan RNA LETHE ifade düzeylerinin hastalığın prognozu ile ilişkisinin incelenmesi
Investigation of the relationship of Non-Long-Coding RNA NRAV and non-long-coding RNA LETHE expression levels with the prognosis of the disease in patients with breeding fever of the Crimean Congo
AYŞENUR ÇÖMEZ BAYSAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YASEMİN ÇAKIR KIYMAZ