Halofilik bir candida türünden NAD+-bağımlı format dehidrogenaz geninin klonlanması ve heterolog ekspresyonu
Cloning and heterologous expression of the NAD+-dependent formate dehydrogenase gene from a halophilic candida species
- Tez No: 688110
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL ORDU, ÖĞR. GÖR. GÜNSELİ KURT GÜR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 66
Özet
NAD+ bağımlı format dehidrogenazlar (FDH, EC 1.2.1.2), kiral moleküllerin sentezi için kullanılan ve pahalı bir koenzim olan NAD(P)H' nin yenilenmesi ve CO2 indirgenmesi reaksiyonları için endüstriyel önemi olan enzimlerdir. Bu enzimler daha ayrıntılı yapıların sentezinde yapı taşları olarak değerli olan saf alkollerin oluşturulması için aldehitlerin ve ketonların enzimatik indirgenmesinde NADH'nin yeniden üretilmesinde kullanılabilmektedir. Enzim stabilitesi, endüstriyel biyotransformasyon işlemlerinin gelişimi için sınırlayıcı bir faktördür. Mikroorganizmalarda bulunan FDH'ler daha yüksek enzimatik aktiviteye sahiptir. Bu durumdan dolayı daha çok mikroorganizma kaynaklı FDH' ler üzerine çalışmalar gerçekleşmektedir. Bu çalışma kapsamında FDH, halofilik bir mikroorganizmadan izole edilerek Escherichia coli'de rekombinant olarak eksprese edilmiştir. Rekombinant CdFDH proteinin homoloji modelinin yapılmasının ardından aktivite deneyleri yapılarak elde edilen CdFDH enziminin farklı pH koşulları altında enzimatik aktiviteye sahip olduğu gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
NAD + dependent formate dehydrogenases (FDH, EC 1.2.1.2) are enzymes of industrial importance for the regeneration of NAD(P)H and CO2 reduction reactions, an expensive coenzyme used for the synthesis of chiral molecules. These enzymes can be used to regenerate NADH in the enzymatic reduction of aldehydes and ketones to form pure alcohols that are valuable as building blocks in the synthesis of more detailed structures. Enzyme stability is a limiting factor for the development of industrial biotransformation processes. FDHs found in microorganisms have higher enzymatic activity. Due to this situation, studies on FDH originating from microorganisms are carried out. Within the scope of this study, FDH was isolated from a halophilic microorganism and expressed recombinantly in Escherichia coli. After the homology model of the recombinant CdFDH protein was made, it was shown that the CdFDH enzyme obtained by performing activity experiments has enzymatic activity under different pH conditions.
Benzer Tezler
- Candida diddensiae format dehidrogenaz enziminin rekombinant ekspresyonu ve karakterizasyonu
Recombinant expression and characterization of Candida diddensiae formate dehydrogenase enzyme
EDA ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMEL ORDU
- Recombinant production and characterization of serine protease enzyme from Virgibacillus sp. AGTR strain using site directed mutagenesis
Virgibacillus sp. AGTR suşundan izole edilen serin proteaz enziminin bölgeye yönelik mutagenez yöntemi kullanılarak rekombinant üretimi ve karakterizasyonu
EVRİM KAPUCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Amylolytic enzyme production from a moderately halophilic bacteria by using agricultural wastes
Tarımsal atıklar kullanılarak ılımlı halofilik bir bakteriden amilolitik enzim üretilmesi
KAMİL SERKAN UZYOL
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
BiyomühendislikMarmara ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK KAZAN
- Halofilik akuaporin ile modifiye edilmiş membranın tuz ve çözünür organik maddeleri itme performanslarının değerlendirilmesi
Evaluation of the rejection performance of salt and organic solutes of halophylic aquaporin modified membrane
AYŞEN YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Çevre MühendisliğiGebze Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELEK ÖZKAN
- Arkeik bir bakteri olan Haloarcula hispanica 2TK2 suşundan alfa amilaz üretimi
Production of alfa amylase from Haloarcula hispanica 2TK2 strain that is a kind of archaebacteria
AYTUN NİLAY ERDAĞI
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVİL YÜCEL