Geri Dön

Gümüşhane ilinden toplanan fasulye genotiplerinde SCoT ve SSR markörleri kullanılarak genetik çeşitliliğin belirlenmesi

Determination of genetic diversity using SCoT and SSR markers in common bean genotypes collected from Gümüşhane province

PDF İndir

  1. Tez No: 692956
  2. Yazar: EBRU GÜNEŞ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. EMRE İLHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Ziraat, Biology, Biotechnology, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erzurum Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 85

Özet

Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Fabaceae (baklagiller) ailesine ait olup proteince zengin olmasından dolayı insan beslenmesinde kullanılmaktadır. Çalışmasının amacı Gümüşhane ilinden toplanan yerel fasulye genotiplerinin SCoT ve SSR markörleri kullanılarak genetik çeşitliliğin belirlenmesidir. Bu amaç doğrultusunda Gümüşhane ilinin farklı bölgelerinden toplanan 28 genotip ve 2 ticari çeşit (Elkoca ve Kantar) 15 SCoT ve 14 SSR markörü ile test edilmiştir. 14 SSR marköründen toplam 61 allel elde edilmiştir. En düşük allel sayısı 3 (BM-187), en yüksek ise 7 (PV-AT001) olmuştur. Ortalama PIC değeri 0,34 olup, 0,31-0,36 arasında değişmektedir. Genotipler arasındaki genetik uzaklık 0,40-0,94 arasında olup G5 ile G6 genotipleri yakın akraba, KEM8 ile KEM9 genotipleri ise uzak akrabadır. SSR markörleri ile yapılan filogenetik ağaca göre 2 grup (A ve B) oluşmuştur. Diğer taraftan çalışmamızda 15 SCoT markörün toplam allel sayısı 575 olup primer başına ortalama 38,33 allel sayısı elde edilmiştir. En yüksek allel sayısı 49 ile SCoT-65 marköründen elde edilirken en düşük olanı ise 29 ile SCoT-1 marköründen elde edilmiştir. En düşük PIC değeri SCoT-18 marköründe 0,21 ve en yükseği ise SCoT-1 marköründe 0,30 olmuştur. Bu çalışmada ortalama PIC değeri ise 0,26 olarak tespit edilmiştir. SCoT verilerine dayalı 30 kuru fasulye genotipinde en yüksek genetik uzaklık oranı 0,17 ila 0,56 arasında olup G4 ile G5 genotipleri en yakın akraba, KEM4 ile G7 en uzak akrabalardır. SCoT markörlerine göre elde edilen dendogramda 2 grup (A ve B) oluşmuştur. Çalışmanın sonuçları fasulye genotipleri arasında genetik çeşitliliğin yüksek düzeylerini göstermiştir. Genetik varyasyonun bu düzeyi bitki ıslahında planlanmasında, germplazm yönetimi ve kullanımında faydalı olacaktır.

Özet (Çeviri)

Common beans (Phaseolus vulgaris L.) belong to the Fabaceae family and are used in human nutrition due to protein richness. The aim of this study was to determine the genetic diversity of local bean genotypes collected from Gümüşhane province by using SCoT and SSR markers. For this purpose, 28 genotypes collected from different regions of Gümüşhane and 2 cultivars (Elkoca and Kantar) were examined with 15 SCoT and 14 SSR markers. A total of 61 alleles were obtained from 14 SSR markers. The lowest number of alleles was 3 (BM-187) and the highest was 7 (PV-AT001). The average PIC value is 0.34 and range between 0.31-0.36. The genetic distance among the genotypes was between 0.40-0.94, and the genotypes G5 and G6 are closely related, while the genotypes KEM8 and KEM9 are distantly related. According to the phylogenetic tree made with SSR markers, 2 groups (A and B) were formed. On the other hand, in our study, an average of alleles per primer was 38.33 and the total allele number of 15 SCoT markers was 575 The highest number of alleles was obtained from the marker SCoT-65 with 49, while the lowest number was obtained from the marker SCoT-1 with 29. The lowest PIC value was 0.21 for the SCoT-18 marker and the highest was 0.30 for the SCoT-1 marker. In this study, the mean PIC value was found to be 0.26. The highest genetic distance ratio in 30 bean genotypes based on SCoT data is between 0.17 and 0.56, with G4 and G5 genotypes being the closest relatives, and KEM4 and G7 the most distant relatives respectively. In the dendogram obtained according to the SCoT markers, 2 groups (A and B) were formed. The results of the study showed high levels of genetic diversity among bean genotypes. This level of genetic variation will be useful in plant breeding planning, germplasm management and use.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    771220

    Karadeniz bölgesi yerel buğday genotiplerinde kök çürüklüğüne (Fusarium culmorum) dayanıklı genotiplerin seçimi

    Determination of root rot (Fusarium culmorum) resistant genotypes in local pure wheat genotypes of the Black Sea region

    YAKUP AKIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatSelçuk Üniversitesi

    Bitki Islahı ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEYDİ AHMET BAĞCI

    DR. CEMAL ŞERMET

  2. Tez No

    866432

    Green extraction and encapsulation of black rosehip polyphenols: İn vitro bioaccessibility, bioavailability, and biological activities

    Siyah kuşburnu polifenollerinin yeşil ekstraksiyonu ve enkapsülasyonu: İn vitro biyoerişilebilirlik, biyoyararlılık, ve biyolojik aktiviteleri

    KADRİYE NUR KASAPOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERAAT ÖZÇELİK

  3. Tez No

    470881

    Gümüşhane ili dytiscidae (Coleoptera) türleri üzerine faunistik araştırma

    A faunistic study on the species of dytiscidae (Coleoptera) in Gumushane province

    ELANUR DAŞBAŞI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    ZoolojiAtatürk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER KÖKSAL ERMAN

  4. Tez No

    571522

    Morus nigra L.(karadut) meyve ekstraktlarının antimikrobiyal aktivitesinin ve antibiyotiklerle sinerjistik etkisinin belirlenmesi

    Determination of the antimicrobial activity and the synergistic effect with antibiotics of Morus nigra L. (black mulberry) fruit extracts

    OSMAN AKMEŞE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiGümüşhane Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TUBA ACET

    DR. ÖĞR. ÜYESİ KADRİYE ÖZCAN

  5. Tez No

    544499

    Gümüşhane ilinde faaliyet gösteren bir maden firmasında yeraltı çalışanların tükenmişlik düzeylerinin iş sağlığı ve güvenliği bakımından incelenmesi

    Examination of the depletion levels of underground workers in terms of occupational health and safety in a mining company operating in Gümüşhane.

    MUSTAFA GÜNAYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Maden Mühendisliği ve MadencilikGümüşhane Üniversitesi

    İş Sağlığı ve Güvenliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EBRU EMİNE ŞÜKÜROĞLU

Geri Dön