Geri Dön

Kolesteatoma etiyopatogenezinde tümör supresör genlerin ve onkogenlerin etkisinin yeni nesil dizileme varyant analizi ile araştırılması

Evaluation of the roles of tumor suppressor genes and oncogenes in cholesteatoma etiopathogenesis by next generation variant analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 712335
  2. Yazar: LEVENT ŞİMŞEK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MAHMUT SELMAN YILDIRIM
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
  10. Enstitü: Meram Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 115

Özet

Amaç: Kolesteatoma, timpanik kavite ve temporal kemiğin etkilendiği yüksek mortalite ve morbiditelere yol açabilen proliferatif bir hastalıktır. Şimdiye kadar yapılmış birçok araştırma ve ortaya atılmış çeşitli teorilere rağmen kolesteatoma etiyopatogenezi tam olarak aydınlatılamamıştır. İnvazyon, migrasyon, kontrolsüz proliferasyon, ve farklılaşma bozukluğu gibi özellikler hem kolesteatomada hem de kanser dokusunda gözlenmektedir. Bu bağlamda, kolesteatoma ve kanserin etiyopatogenez açısından taşıdğı ortaklıkları araştırmak önem kazanmaktadır. Bu projede; kanser patogenezinde rol oynayan 60 farklı gen, kolesteatoma dokusu ve normal dokuda karşılaştırmalı olarak analiz edilerek, kolesteatoma patogenezinde kanser ilişkili genlerin etkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Kulak Burun Boğaz kliniğinde kolesteatoma tanısı almış ve operasyon endikasyonu konulmuş yetişkin hastalardan, kolesteatoma rezeksiyonu esnasında rutin olarak çıkarılan kolesteatoma dokusu ve normal epitel dokuya karşılaştırmalı olarak ABL1, AKT1, ALK, APC, ATM, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDH1, CDKN2A, CSF1R, CTNNB1, DLC1, EGFR, ERBB2, ERBB4, ESR1, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FTSJ3, GNA11, GNAQ, GNAS, HNF1A, HRAS, IDH1, IDH2, JAK2, JAK3, KCNB2, KDR, KIT, KRAS, MET, MLH1, MYC, MYCN, NOTCH1, NRAS, NRXN1, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, PTPN11, RB1, RBAK, RET, ROS1, SMAD4, SMARCB1, SMO, SMURF1, SRC, SSFA2, STK11, TP53, VHL, ve ZNF594 genlerine yönelik yeni nesil dizileme varyant analizi yapıldı. Bulgular: İncelenen genlerde tespit edilen varyantlar, biyoinformatik algoritmalar eşliğinde analiz edildi ve her bir varyant için sınıflandırma yapıldı. Klinik anlamı olabilecek somatik JAK3 c.2164G>A (p.Val722Ile), TP53 c.284delC (p.Ser95PhefsTer28), ve KRAS c.377A>T (p.Asp126Val) değişimleri, kolesteatoma dokusunda gözlenirken normal dokuda saptanmadı. Ek olarak, daha önce kolesteatoma ile ilişkilendirilmemiş, klinik önemi olabilecek 12 farklı germline varyant tespit edildi. Sonuç: Çalışmamızda, kanser ilişkili genlerdeki değişimlerin kolesteatomadaki varlığı tespit edilmiş ve bu değişimler olası klinik uygulamalar açısından tartışılmıştır. Elde edilen veriler, literatüre sağlayacağı katkının yanında bu alanda gelecekte planlanacak araştırmalar için yol gösterici olabilir.

Özet (Çeviri)

Background/Aim: Cholesteatoma is a proliferative disease that affects the tympanic cavity and temporal bone, which can lead to high mortality and morbidity. Despite many studies and various theories, the etiopathogenesis of cholesteatoma has not been fully elucidated. Features such as invasion, migration, uncontrolled proliferation, and lack of differentiation are observed in both cholesteatoma and cancer tissue. In this context, it is important to investigate the intersection between cholesteatoma and cancer in terms of etiopathogenesis. In this project; 60 different genes that play a role in the pathogenesis of cancer were analyzed comparatively in cholesteatoma tissue and normal tissue in order to evaluate the effect of cancer-related genes in the pathogenesis of cholesteatoma. Methods: Cholesteatoma tissue and normal epithelial tissue, which were routinely removed during the cholesteatoma resection from adult patients diagnosed with cholesteatoma in the otorhinolaryngology clinic and indicated for operation, were comperatively analyzed for ABL1, AKT1, ALK, APC, ATM, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDH1, CDKN2A, CSF1R, CTNNB1, DLC1, EGFR, ERBB2, ERBB4, ESR1, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FTSJ3, GNA11, GNAQ, GNAS, HNF1A, HRAS, IDH1, IDH2, JAK2, JAK3, KCNB2, KDR, KIT, KRAS, MET, MLH1, MYC, MYCN, NOTCH1, NRAS, NRXN1, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, PTPN11, RB1, RBAK, RET, ROS1, SMAD4, SMARCB1, SMO, SMURF1, SRC, SSFA2, STK11, TP53, VHL, and ZNF594 genes using next generation sequencing variant analysis. Results: The variants detected in the examined genes were analyzed with bioinformatics algorithms and classification was made for each variant. Somatic JAK3 c.2164G>A (p.Val722Ile), TP53 c.284delC (p.Ser95PhefsTer28), and KRAS c.377A>T (p.Asp126Val) changes that may have clinical significance were observed in cholesteatoma tissue but not in normal tissue. In addition, 12 different germline variants not previously associated with cholesteatoma, which may have clinical significance, were identified. Conclusion: In our study, the presence of changes in cancer-related genes in cholesteatoma was determined and these changes were discussed in terms of possible clinical applications. The data obtained not only contribute to the literature, but also might be a guide for future research in this field.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    549747

    Kronik otitis media'lı hastalarda periostin, fibronektin ve tenaskin-c seviyelerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of periostin, fibronectin and tenascin-c levels in patients with chronic otitis media

    MEHMET BİRİNCİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Kulak Burun ve BoğazRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SUAT TERZİ

    PROF. DR. ENGİN DURSUN

  2. Tez No

    229916

    Helicobakter pylori'nin kronik otitis media etiyopatogenezindeki olası rolü

    Possible role of Helicobacter pylori in etiopathogenesis of chronic otitis media

    İBRAHİM HAKAN KELEKÇİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Kulak Burun ve BoğazSelçuk Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZİYA CENİK

    DOÇ. DR. HAMDİ ARBAĞ

  3. Tez No

    661719

    Mastoid cerrahisi yapılan kolesteatomlu ve kolesteatomsuz hastalarda kortikal kemik talaşından keratinize skuamöz epitel araştırılması

    Investigation of keratinized squamous epithelium from cortical bone dust in patients with or without cholesteatoma undergoing mastoid surgery

    HALİL ORKAN ORMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Kulak Burun ve BoğazSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHARREM DAĞLI

  4. Tez No

    54953

    Pediatrik yaş grubunda kolesteatomların yüksek rezolüsyonlu bilgisayarlı tomografik incelemesi

    Başlık çevirisi yok

    SÜREYYA K. SOYUPAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Radyoloji ve Nükleer TıpÇukurova Üniversitesi

  5. Tez No

    90007

    Seröz Oitis Media'da sigara ve önemli çevresel epidemiyolojik ve ailesel faktörlerin hastalıktaki etkinliği

    The Effects of tobacco smoke important environmental and epidemiological and familial factors in serous otitis media

    M. TARHUN YOSUNKAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Kulak Burun ve BoğazAnkara Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESEN BEDER

Geri Dön