Geri Dön

Evaluation of genetic diversity of cotton genotypes (Gossypium hirsutum L.) using iPBS marker system

iPBS markör sistemi kullanılarak pamuk genotiplerinin (Gossypium hirsutum L.) genetik çeşitliliğinin değerlendirilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 716193
  2. Yazar: BİNNUR YEŞİL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. UFUK DEMİREL, DOÇ. DR. ALLAH BAKHSH
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Pamuk (Gossypium hirsutum L.), moleküler markörler, moleküler karakterizasyon, filogenetik analiz, retrotranspozonlar, iPBS, Filogenetik, Markörler, Moleküler özellikler, Retrotranspozon, Cotton (Gossypium hirsutum L.), molecular markers, molecular characterization, phylogenetic analysis, retrotransposons, iPBS, Phylogenetic, Markers, Molecular properties, Retrotransposon
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Son yıllarda filogenetik analizlerde retrotranspozon moleküler markörler etkili bir biçimde kullanılmaktadır. Bu çalışmada yerli ve yabancı orijinli 179 pamuk genotipi LTR retrotranspozonlara dayalı inter-Primer Binding Site (iPBS) markör tekniği ile genetik çeşitliliğini değerlendirmek için analiz edilmiştir. İlk olarak polimorfizmleri belirlemek için 32 iPBS primeri kullanılarak 8 genotip taranmıştır. Çalışmanın devamında bu primerler arasından 7 tanesi ürettiği polimorfik bantlar nedeniyle seçilmiştir. Çalışmada kullanılan 7 iPBS primeri toplam 133 skorlanabilir bant oluşturdu ve elde edilen 133 banttan 128'i polimorfizm gösterdi. Ortalama polimorfik bant sayısı primer başına 18.28 olup, 16 ile 21 arasında değerler almıştır. 179 genotipin genetik çeşitliliği ve moleküler karakterizasyonunun belirlenmesi için kullanılan 7 iPBS retrotranspozon primerinin ortalama polimorfizm oranı %96.28 olarak hesaplanmıştır. Polimorfizm bilgi içeriği (PIC) değeri ise 0.31 ile 0.46 arasında değişmektedir. Bu sonuçlar ışığında, Türkiye ve yabancı orijinli pamuk genotiplerinin çeşitlilik açısından, zengin bir genetik kaynağa sahip oldukları belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In recent years, retrotransposon molecular markers have been used effectively in phylogenetic analysis. In this study, 179 cotton genotypes of domestic and foreign origin were analyzed to evaluate their genetic diversity with the inter-Primer Binding Site (iPBS) marker technique based on LTR retrotransposons. First, 8 genotypes were screened by using 32 iPBS primers to identify polymorphisms. In the continuation of the study, 7 of these primers were selected because of the polymorphic bands they produced. The 7 iPBS primers that used in the study created total of 133 scoreable bands, and 128 of the 133 bands showed polymorphism. The mean of polymorphic bands was 18.28 per primer, with values between 16 and 21. The mean of polymorphism rate of 7 iPBS retrotransposon primers that used to determine genetic diversity and molecular characterization of 179 genotypes was calculated as 96.28%. The polymorphism information content (PIC) value varies between 0.31 and 0.46. In the dendrogram, the populations were divided into three main groups. In the light of these results, it has been determined that Turkish and foreign origin cotton genoypes have a rich genetic resource in terms of diversity.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    179526

    Bazı pamuk çeşitlerinde genetik farklılığın RAPD tekniği ile belirlenmesi

    Determination of genetic diversity among some cotton cultivars using the RAPD technique

    YONCA SURGUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    GenetikMuğla Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BETÜL BÜRÜN

  2. Tez No

    719751

    Farklı pamuk gen kaynaklarının iPBS markörleri ile karakterizasyonu ve bu markörlerin solgunluk hastalıklarıyla ilişkilendirilmesi

    The characterization of different germplasms of cotton using iPBS markers and the association of these markers with wilt diseases

    NURETTİN BARAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatDicle Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEFHAR GÜLTEKİN TEMİZ

    DOÇ. DR. FAHEEM SHAHZAD BALOCH

  3. Tez No

    987741

    Pamuktan elde edilen fusarium oxysporum F. SP. vasinfectum izolatlarının vejetatif uyum grupları, mikoviral dsrna'nın içeriği ve hipovirülenslik yönünden incelenmesi

    Evaluation of fusarium oxysporum F. SP. vasinfectum isolates obtained from cotton i̇n terms of vegetative compatibility groups, mycoviral dsRNA content and hypovirulence

    YAĞMUR AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    ZiraatAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER ERİNCİK

  4. Tez No

    868196

    Selection, evaluation, morphological and molecular analysis of genetic diversity in melon (Cucumis melo L.) from Central Asia (Kyrgyzstan, Uzbekistan)

    Orta Asya'dan (Kırgızistan, Özbekistan) kavunlarda (Cucumis melo L.) genetik çeşitliliğin seçimi, değerlendirilmesi, morfolojik ve moleküler analizi

    AIDAI MURATBEK KYZY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyoteknolojiAkdeniz Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEDİM MUTLU

    DOÇ. DR. HASAN PINAR

  5. Tez No

    815448

    Türkiye yerli sığır ırklarında genetik çeşitlilik ve seleksiyon izlerinin yüksek yoğunlukta SNP verilerle değerlendirilmesi

    Evaluation of genetic diversity and selection signatures in native Turkish cattle breeds via high-density SNP data

    EYMEN DEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatAkdeniz Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT SONER BALCIOĞLU

Geri Dön