Geri Dön

Mikrobiyal kaynaklı antimikrobiyal peptit izolasyonu ve karakterizasyonu

Antimicrobial peptide isolation and characterization of microbial source

  1. Tez No: 730722
  2. Yazar: ESRA ÖZTUNÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ASHABİL AYGAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 63

Özet

Kahramanmaraş'ın farklı bölgelerinden alınan toprak örneklerinden laboratuvarda pastörizasyon işlemi sonrası bakteri suşlarınınizolasyonu ve saf kültürlerigerçekleştirilmiştir. Elde edilen Bacillus sp. suşlarının Gram pozitif (S. aureus) ve Gram negatif (E. coli) bakterilerine karşı petrilerde antimikrobiyal etkinlikleri test edilmiştir. Test edilen Bacillus sp. suşları arasındanenyüksek antimikrobiyal etkinliği gösteren G1 suşu seçilerek morfolojik, biyokimyasal ve moleküler olarak tanımlanarak antimikrobiyal etkinlik gösteren peptidlerini kısmi karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Gram pozitif ve sporu barındırıan G1 suşu, morfolojik- biyokimyasal testler ile 16S rDNA analiz sonuçlarına göre G1 suşu Bacillus amyloliquefaciens olarak tanımlanmıştır. Gram pozitif S.aureus ve Gram negatif E.coli bakterisine karşı antimikrobiyal etkinlik gösteren G1 suşu LB, MHB, TSB ve NB sıvı besiyerlerinde üretilerek en iyi antimikrobiyal madde sentezi gerçekleştirdiği parametreler belirlenmiştir. Bu denemeler sonucunda en yüksek antimikrobiyal etki NB besiyerinde üretilen G1 suşlarının inkübasyonu ile elde edilmiştir. NB besiyerinde inkübe edilen Bacillus amyloliquefaciens G1 suşu santrifüjleme işlemlerinde sonra supernatant amonyum sülfat presipitasyonu ve diyaliz torbasında (2000 kDa MWCO) diyaliz işlemleri ile kısmi saflaştırma gerçekleştirilerek SDS Gradient jel elektroforezine tabii tutulmuştur. Soft agar üzerinde antimikrobial etki gösteren peptid bandının moleküler büyüklüğü 8,16 kDa olarak olçülmüştür. Yapılan çalışma sonucunda Bacillus amyloliquefacienssuşu tarafından üretilen antimikrobiyal peptit başta ilaç endüstrisi olmak üzere birçok alandaki kullanılabilirliğini ortaya koymuştur.

Özet (Çeviri)

Isolation and pure cultures of bacterial strains were carried out after pasteurization in the laboratory from soil samples taken from different regions of Kahramanmaraş. Antimicrobial activities of the obtained Bacillus sp. strains were tested against Gram positive (S. aureus) and Gram negative (E. coli) bacteria in petri dishes. Among the tested Bacillus sp. strains, the G1 strain showing the highest antimicrobial activity was selected and morphologically, biochemically and molecularly identifined and partial characterization of its peptides with antimicrobial activity was performed. Gram-positive and spore-bearing G1 strain was defined as Bacillus amyloliquefaciens according to the results of morphological-biochemical tests and 16S rDNA analysis. G1 strain showing antimicrobial activity against S.aureusand E.coli was grown in LB, MHB, TSB and NB broth media and the medium, the best antimicrobial substance producing, were determined. According to the experiment, the highest antimicrobial peptide production was obtained in NB medium. After partial purification by supernatant ammonium sulfate precipitation and dialysis processeswith a dialysis bag (2000 kDa MWCO), the peptide were subjected to SDS gradient gel electrophoresis. The molecular size of the peptide band showing antimicrobial effect on soft agar was estimated as 8,16 kDa. As a result of the study, the antimicrobial peptide produced by the Bacillus amyloliquefaciens G1 strain revealed its potentials to use in many fields, especially in the pharmaceutical industry.

Benzer Tezler

  1. İstiridye kaynaklı defensin ve prolince zengin antimikrobiyal peptidlerin pichia pastoris'te rekombinant olarak üretimi

    Recombinant production of oyster defensin and proline rich antimicrobial peptides in pichia pastoris

    MİNE ERDEM BÜYÜKKİRAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiErciyes Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZÜLAL KESMEN

  2. Multiplex-PCR based screening and computational modeling of virulence factors and T cell mediated immunity in Helicobacter pylori infections for accurate clinical diagnosis

    Helicobacter pylori enfeksiyonlarının doğru klinik tanısı için virülans faktörleri ile T hücreye bağımlı bağışıklığın çoklu-PZT ile taranması ve biyoinformatik modellemesi

    SİNEM ÖKTEM OKULLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYÇA SAYI YAZGAN

    PROF. DR. ZÜHTÜ TANIL KOCAGÖZ

  3. Endüstriyel tavukçuluk alanında kullanılmak üzere mikrobiyal kaynaklı antimikrobiyal peptit üretimi, optimizasyonu ve antibakteriyel etkisinin belirlenmesi

    Production, optimization and determination of antibacterial effect of microbial sourced antimicrobial peptide to be used in industrial poultry

    İREM ALTUNTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMET KATI

  4. Pediococcus acidilactici PBF suşu tarafından üretilen bakteriyosinin karakterizasyonu ve saflaştırılması

    Characterization and purification of bacteriocin produced by Pediococcus acidilactici PBF

    BURCU BİLER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU

  5. M13mp18 iskele ipliğinden DNA origami nanodemetlerin geliştirilmesi ve ilaç taşıyıcı olarak kullanımının incelenmesi

    Development of DNA origami nanobundles from m13mp18 scaffold strand and investigation of their use as drug carrier

    AYKUT BİLİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyomühendislikHacettepe Üniversitesi

    Nanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NECDET SAĞLAM

    PROF. DR. CELAL ÜLGER