Geri Dön

Candida parapsilosis kökenlerinde antifungal direncin moleküler yöntemlerle araştırılması

Investigation of antifungal resistance in candida parapsilosis strains by molecular methods

PDF İndir

  1. Tez No: 741119
  2. Yazar: ÖZGE KURT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÖMER KÜÇÜKBASMACI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 58

Özet

Dünya'nın birçok yerinde flukonazol dirençli (FLU-R) Candida parapsilosis kökenlerinin sayısı artmaktadır. Ancak, dirence sebep olan mekanizmalar henüz netlik kazanmamıştır. İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Hastanesi'nde 2018-2019 yıllarında kan kültüründen üretilen, identifikasyonları MALDI-TOF MS ve DNA dizi analizi ile yapılmış ve duyarlılıkları E-TEST ile saptanmış C. parapsilosis kökenlerinde flukonazol direncinin moleküler yöntemler ile araştırılması amaçlanmıştır. 17 FLU-R, 12 duyarlı, bir doza bağımlı duyarlı olmak üzere 30 kökene ait ERG11 ve MRR1 genleri Yeni Nesil Dizileme (NGS) yöntemi ile dizilendi. Dirençli kökenlerin 11 (%67,7)'inde ve bir doza bağımlı duyarlı izolatta gösterilen Y132F mutasyonu en sık saptanan mutasyondu. Y132F mutasyonu ile birlikte ERG11'de G307A (%52,9), Y132F+G307A (%47), K143R (%35,29), Y132F+K143R (%17,64), R398I (%5,8) mutasyonları tespit edildi. Duyarlı kökenlerin hiçbirinde Y132F tespit edilmedi. MRR1'de ise bir doza bağımlı duyarlıda R405K, dört dirençli kökende G927C mutasyonu tespit edildi. Çalışmada tespit edilen tüm mutasyonlar daha önce literatürde tanımlanmıştır ancak azol direnci ile ilişkileri henüz netlik kazanmamıştır. ERG11'in Y132F mutasyonu C. parapsilosis izolatlarında azol direncinde baskın mekanizma olarak kabul edilebilir ancak tam olarak mekanizmaların aydınlatılabilmesi için daha fazla çalışma gereklidir.

Özet (Çeviri)

The number of fluconazole resistant (FLU-R) Candida parapsilosis strains is increasing all over the world. However, the mechanisms that cause resistance have not been clarified yet. The aim of this study was to investigate fluconazole resistance in C. parapsilosis strains produced from blood culture, identified by MALDI-TOF MS and DNA sequence analysis and determined whose susceptibility by E-TEST at Istanbul University-Cerrahpaşa, Cerrahpaşa Medical Faculty Hospital in 2018-2019. ERG11 and MRR1 genes of 30 strains which include 17 FLU-R, 12 susceptible and one dose dependently susceptible were sequenced by Next Generation Sequencing (NGS). Y132F mutation was the most frequently detected mutation in 11 (67.7%) of the resistant strains and one dose-dependent susceptible isolate. Along with the Y132F mutation, G307A (52.9%), Y132F+G307A (47%), K143R (35.29%), Y132F+K143R (17.6%), R398I (5.8%) mutations were detected in ERG11. Y132F was not detected in none of the susceptible strains. In MRR1, R405K mutation was detected in one dose-dependent susceptible and G927C mutation in four resistant strains. All mutations detected in the study have been previously described in the literature, but their relationship with azole resistance has not yet been clarified. Y132F mutation of ERG11 can be considered as the dominant mechanism in azole resistance in C. parapsilosis isolates, but more studies are needed to elucidate the exact mechanisms.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    347837

    Candıda türlerinin tanımlanmasında 26S RDNA dizi analizi temel alınarak 'API ID 32C' ve 'maldı tof ms' yöntemlerinin duyarlılık ve maliyet etkinliklerinin araştırılması

    Evaluation of sensitivity and cost effectiveness of 'API id 32C' and 'maldi tof ms' methods on the basis of 26s rdna sequence analysis in identification of candida species

    EYLEM TURHAN ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİLGÜN ÇERİKÇİOĞLU

  2. Tez No

    579475

    Kanal tedavisi yapılan hastalarda izole edilen candidaların PCR-RFLP yöntemi ile genotiplendirilmesi ve azol direncinin belirlenmesi

    Kanal tedavi̇si̇ yapilan hastalarda i̇zole edi̇len candidalarin PCR-RFLP yöntemi̇ i̇le genoti̇plendi̇ri̇lmesi̇ ve azol di̇renci̇ni̇n beli̇rlenmesi̇

    ZAHİDE TOPAKTAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİZAMİ DURAN

  3. Tez No

    310301

    Kan kültürlerinde üreyen mantarların antifungal duyarlılıkları

    Antifungal susceptibility of fungi in blood cultures

    BİRAY OFLAZOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DİLEK YEŞİM METİN

  4. Tez No

    555524

    Ekinokandin sınıfı antifungal ilaçlar ile karşılaştırılmış mutant candida kökenlerinin karakterizasyonu

    Characterization of resistant mutants of candida strains exposured to echinocandin antifungals

    NURNEHİR BALTACI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE KALKANCI

  5. Tez No

    157999

    Candida infeksiyonlarına duyarlı hastalardan soyutlanan Candida'ların ve virulans faktörlerinin belirlenmesi, antifungal duyarlılıklarının araştırılması

    Determination of Candida species, their virulence factors and antifungal susceptibilities in patients susceptible to Candida infections

    GAZANFER AY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    MikrobiyolojiTrakya Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT TUĞRUL

Geri Dön