Geri Dön

COVİD-19 hastalığında SARS-COV-2 IGM ve SARS-COV-2 IGG antikor düzeyleri ile SARS-COV-2 reverz transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu döngü eşik değeri arasındaki ilişkinin değerlendirilmesi

Evaluation of the relationship between sars-cov-2 igm and SARS-COV-2 İGG antibody levels and SARS-COV-2 reverse transcriptase polymerase chain reaction cycle threshold value in COVİD-19 disease

  1. Tez No: 754046
  2. Yazar: PINAR ÖZAYDIN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞEN BAYRAM
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Antikorlar, COVID 19, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, SARS virüsü, İmmünoglobülin G, İmmünoglobülin M, Antibodies, COVID 19, Polymerase chain reaction, SARS virus, Immunoglobulin G, Immunoglobulin M
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sanko Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

SARS-CoV-2 adı verilen virüsün neden olduğu COVID-19 hastalığı, 2019 yılı Aralık ayında Çin'de ortaya çıkıp, tüm dünyayı etkisi altına alan en büyük pandemilerden birisi olmuştur. COVID-19 hastalığının çok bulaşıcı olması ve olguların bir kısmının ölümle sonuçlanması nedeniyle enfeksiyonun erken teşhis ve tedavisi önem taşımaktadır. COVID-19 tanısında altın standart yöntem boğaz ve nazofarengeal sürüntüden yapılan gerçek zamanlı ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) dur. PCR testi sonucunda elde edilen döngü eşik (Cycle treshold; Ct) değeri hastadan alınan örnekteki viral yükü temsil etmekte olup, Ct değerinin düşük olmasının enfeksiyonun şiddeti ile ters orantılı olduğu kabul edilmektedir. Pahalı ve deneyim gerektiren bu yöntemin dışında, COVID-19 tanısını destekleyen çeşitli serolojik yöntemler bulunmakta olup, bunlardan en sık kullanılanı SARS-CoV-2 ile karşılaşma sonrasında oluşan IgM ve IgG antikorlarının saptanmasıdır. Bu çalışmanın amacı, COVID-19 geçiren kişilerde oluşan SARS-CoV-2 IgM ve IgG antikorlarının hastalara ait Ct değerleri ile ilişkisini araştırmaktır. Çalışmaya, SANKO Üniversitesi Hastanesine Ağustos 2020-Ocak 2022 tarihleri arasında COVID-19 nedeniyle başvuran 57 (%52,8)'si erkek, 51 (%47,2)'i kadın toplam 108 hasta dahil edildi. Hastalarda eş zamanlı olarak, kan örneklerinde kemiluminesans mikropartikül immunassay (CMIA) yöntemi ile SARS-CoV-2 IgM ve SARS-CoV-2 IgG testleri, boğaz ve nazofarengeal sürüntü örneklerinde ise SARS-CoV-2 RT-PCR testi çalışıldı. Hastalardan elde edilen IgM ve IgG antikor değerleri ile RT-PCR Ct ölçümleri incelenmiş ve sonuçlar arasındaki ilişki istatistiksel olarak değerlendirildi. Spearman'in rho sonuçlarına göre; SARS-CoV-2 Ct değerleri ile IgM ve IgG değerleri arasında pozitif yönlü ve anlamlı zayıf ilişki tespit edildi (sırasıyla, rho=0,216; p<0,05 ve rho=0,203; p<0,05). SARS-CoV-2 IgM ile IgG değeri arasında da pozitif yönlü ve anlamlı orta düzeyde bir ilişki tespit edildi (rho=0,683; p<0,001). ROC analizinde ise; Ct değerinin IgM test sonuçları doğrultusunda ayırt edici olmadığı (p=0,144), ancak Ct değerinin IgG sonuçları doğrultusunda zayıf bir ayrıma sahip olduğu değerlendirildi (p=0,037). Çalışmanın sonucunda, COVID-19 tanısında RT-PCR yöntemi ile karşılaştırıldığında, SARS-CoV-2 IgM ve IgG antikor saptama testlerinin daha ucuz ve hızlı olmakla birlikte, antikor değerlerinin hastalardan elde edilen Ct değerleri ile uyumlu olduğu belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

COVID-19, caused by the virus called SARS-CoV-2, emerged in China in December 2019, and became one of the biggest pandemics that affected the whole world. Early diagnosis and treatment are important because COVID-19 is very contagious infection and some of the cases result in death. The gold standard method in the diagnosis of COVID-19 is real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) from throat and nasopharyngeal swabs. The cycle threshold (Ct) value obtained from the PCR test represents the viral load in the sample taken from the patient, and a low Ct value is considered inversely proportional to the severity of the infection. Apart from this expensive and experienced method, there are serological methods that support the diagnosis of COVID-19. Among them, the most frequently used method is the detection of IgM and IgG antibodies obtained after infection with SARS-CoV-2. The aim of this study is to investigate the relationship of SARS-CoV-2 IgM and IgG antibodies with Ct values in patients with COVID-19. In this study, a total of 108 patients, 57 (52.8%) male and 51 (47.2%) female, who applied to SANKO University Hospital due to COVID-19 between August 2020 and January 2022, were included. SARS-CoV-2 IgM and SARS-CoV-2 IgG tests were performed via chemiluminescence microparticle immunoassay (CMIA) method in blood samples taken from patients, and SARS-CoV-2 RT-PCR test was studied from throat and nasopharyngeal swab samples. IgM and IgG antibody values and RT-PCR Ct values obtained from patients were examined and the relationship between the results was evaluated statistically. According to Spearman's rho results; There was a weak positive and significant correlation between SARS-CoV-2 Ct values and IgM and IgG values (rho=0.216; p<0.05 and rho=0.203; p<0.05, respectively). A positive and moderately significant correlation was also found between SARS-CoV-2 IgM and IgG values (rho=0.683; p<0.001). In ROC analysis; It was evaluated that the Ct value was not discriminatory according to the IgM test results (p=0.144), but the Ct value had a weak discrimination according to the IgG results (p=0.037). As a result of the study, it was determined that the SARS-CoV-2 IgM and IgG antibody detection tests were cheaper and faster, compared to the RT-PCR method in the diagnosis of COVID-19, and the antibody values were compatible with the Ct values obtained from the patients.

Benzer Tezler

  1. Irak'ta aşılanmış (Pfızer, sınopharm) kişilerde, SARS-CoV-2 hastalarında ve kontrol grubunda ıl-8 gen ekspresyonunun karşılaştırılması

    Comparison between il-8 gene expression in vaccinated (Pfizer, sinopharm) individuals, patients with SARS-CoV-2 and control group in Iraq

    MUROOJ MOHAMMED KAREEM KAREEM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EBRU ÖZDENİZ

  2. COVİD-19'da aşı ve hastalık sonrası oluşan nötralizan antikorların hastalığın süresi ve şiddeti açısından prediktif değeri

    The predictive value of neutralizing antibodies after from disease and vaccination for the duration and severity of the disease in COVID-19

    RUVEYDA ALACAHAN DÜRER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KADRİYE KART YAŞAR

  3. COVID-19 tanılı olgularda IG G antikor yanıtının takibi

    Follow-up of IG G antibody response in COVID-19 cases

    AYŞE BETÜL USLU ERSÖZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiBezm-İ Alem Vakıf Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİHA MERİÇ KOÇ

  4. PCR ile tanı konan COVİD-19 vakalarının antikor yanıtlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of antibody responses of COVİD-19 cases diagnosed by pcr

    KENAN GÖL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU

  5. COVID-19 patogenezi ile hematolojik parametrelerin ilişkisi

    The Relationship Between COVID-19 Pathogenesis and Hematologic Parameters

    FEYZA ATİŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZİHNİ AÇAR YAZICI