Geri Dön

Evaluation of T cell response with interferon gamma release test in COVID-19 patients with positive detection by molecular methods in hospital and intensive care

Hastanede ve yoğun bakımda yatan moleküler yöntemlerle pozitif saptanan COVID-19 hastalarında T hücre yanıtının interferon gama salınım testi ile değerlendirilmesi

  1. Tez No: 758318
  2. Yazar: ZAINAB KHAIRULLAH SEDEEQ SEDEEQ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. DUYGU FINDIK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: COVID 19, Hastaneler, T lenfositleri, Yatan hastalar, Yoğun bakım, Yoğun bakım üniteleri, İnterferon-gamma, COVID 19, Hospitals, T lymphocytes, Inpatients, Intensive care, Intensive care units, Interferon-gamma
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Selçuk Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Giriş ve Amaç: Interferon gama salınım testi (IGRA) patojen spesifik peptidlerle uyarımdan sonra antijen spesifik T hücrelerden salınan IFN-γ'yı ölçmeye yarayan invitro bir kan testidir. Bu çalışmada hastane servislerinde ve yoğun bakımda yatan COVID- 19 hastalarında T hücre yanıtının Interferon gama (IFN-γ) salınım testi (IGRA) kullanarak araştırılması ve çeşitli laboratuvar değerlerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Enfeksiyon Hastalıkları Servisi ve Reanimasyon Yoğun Bakım Ünitesi'nde moleküler yöntemle COVID-19 pozitif saptanan toplam 100 hasta (50+50) dahil edilmiştir. Hastalardan alınan kan örneklerinde IFN-γ düzeyleri QuantiFERON SARS-CoV-2 (QIAGEN, Almanya) kiti kullanılarak saptanmıştır. Hastaların cinsiyet, yaş, CRP, AST, ALT, IL-6, lenfosit sayısı, prokalsitonin, D-dimer sonuçları hastane otomasyon sisteminden alınmıştır. Bulgular ve Sonuç: Hastaların 51'inin erkek, 49'unun kadın olduğu ve 19–89 (54.13 ± 20.73) yaş aralığında olduğu belirlenmiştir. IGRA test sonuçlarının 38'i negatif, 44'ü pozitif ve 18'i ara değer olarak saptanmıştır. IGRA test sonucu negatif olan hastaların yaşları pozitif olanlara kıyasla anlamlı şekilde yüksek (p<.001) bulunmuştur. Hastaların IGRA test sonucu ile cinsiyet, prognoz, IL-6, lenfosit, CRP, AST ve ALT değerleri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamıştır. IGRA test sonucu şüpheli olanların D-dimer (p=.033) ve prokalsitonin (p =.044) düzeyleri pozitif olanlara göre istatistiksel olarak anlamlı derecede yüksek bulunmuştur. Yoğun bakım ve serviste yatan hastalar arasında IGRA test sonuçları arasında istatistiksel anlamlı bir fark saptanmamıştır. Ancak negatif ve ara değer sonuçlar yoğun bakım hastalarında göreceli olarak fazla (p=.054) bulunmuştur. Yoğun bakımda yatan hastaların yaşları, ölüm oranları, D-dimer, CRP, prokalsitonin, AST ve ALT değerleri serviste yatan hastalara göre anlamlı şekilde yüksek (p<.001) iken, lenfosit değerleri düşük (p<.001), cinsiyet dağılımları ve IL-6 düzeyleri benzer tespit edilmiştir. IGRA negatif sonuçların yaşlılarda, negatif ve ara değer sonuçların yoğun bakım hastalarında göreceli olarak fazla çıkması ve yoğun bakım hastalarında lenfosit değerlerinin düşük olması hücresel immün yanıtın azaldığını ve/veya olmadığını göstermektedir. Yoğun bakımda yatan hastaların ölüm oranları, D-dimer, CRP, prokalsitonin, AST ve ALT değerlerinin serviste yatanlara göre yüksek oluşu inflamasyon şiddetini ve organ yetmezliklerinin geliştiğini göstermektedir. COVID-19 hastalarında morbidite ve mortalitenin en önemli nedeni olarak hiperinflamatuar sitokin fırtınası ve konağın immün yanıtında defekt/çökme gösterilmektedir. Bu bulgular ışığında IGRA testlerinin immünomodülatör tedavide yol gösterici olacağını düşünüyoruz.

Özet (Çeviri)

Introduction and purpose: Interferon gamma release test (IGRA) is an in vitro blood test to measure IFN-γ released from antigen-specific T cells after stimulation with pathogen-specific peptides. In this study, it was aimed to investigate the T cell response using the Interferon gamma (IFN-γ) release test (IGRA) and to compare various laboratory values in COVID-19 patients hospitalized in hospital inpatient cilinics and intensive care units. Materials and Methods: A total of 100 patients (50+50) who were detected as COVID-19 positive by molecular method in Selcuk University Faculty of Medicine Infectious Diseases Service and Reanimation Intensive Care Unit were included in the study. IFN-γ levels in blood samples taken from patients were determined using the QuantiFERON SARS-CoV-2 (QIAGEN, Germany) kit. The patients' gender, age, CRP, AST, ALT, IL-6, lymphocyte count, procalcitonin, D-dimer results were obtained from the hospital automation system. Results and Conclusion: It was determined that 51 of the patients were male and 49 were female, and they were between the ages of 19-89 (54.13 ± 20.73). 38 of the IGRA test results were negative, 44 were positive and 18 were intermediate values. The age of patients with negative IGRA test results was significantly higher (p<.001) compared to patients with positive results. There was no statistically significant difference between the IGRA test results of the patients and their gender, prognosis, IL-6, lymphocyte, CRP, AST and ALT values. D-dimer (p=.033) and procalcitonin (p=.044) levels of those with intermediate IGRA test results were found to be statistically significantly higher than those with positive results. There was no statistically significant difference between the IGRA test results between the patients hospitalized in the intensive care unit and inpatient clinics. However, negative and intermediate values were relatively high (p=.054) in intensive care unit patients. While age, death rates, D-dimer, CRP, procalcitonin, AST and ALT values of the patients hospitalized in the intensive care unit were significantly higher (p<.001) than the patients hospitalized inpatient clinics, lymphocyte levels were lower (p<.001), gender distribution and IL- 6 levels were found to be similar. Relatively higher IGRA negative results in the elderly, negative and intermediate results in intensive care unit patients, and low lymphocyte levels in intensive care unit patients indicate that the cellular immune response is decreased and/or absent. Mortality rates, D-dimer, CRP, procalcitonin, AST and ALT values of the patients hospitalized in the intensive care unit are higher than those hospitalized inpatient clinics, indicating the severity of inflammation and the development of organ failure. Hyperinflammatory cytokine storm and defect/collapse in the immune response of the host are shown as the most important causes of morbidity and mortality in COVID-19 patients. In the light of these findings, we think that IGRA tests will be a guide in immunomodulatory therapy.

Benzer Tezler

  1. Her2/neu pozitif meme kanserli hastaların cd8 pozitif t lenfositlerinde hücre siklusu proteinlerinin tayini

    An analysis of cell cycle proteins in the cd8 positive t lymphocytes of patients with her2/neu positive breast cancer

    RAFİ SÜZME

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Biyokimyaİstanbul Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. FİGEN GÜRDÖL

  2. Ekinokoklu sığır ve koyunların, akciğer ve karaciğerlerindeki yangısal infiltrasyonun histopatolojik ve immünohistokimyasal olarak araştırılması

    Histopathological and immunohistochemical evolation of the inflammatory infiltrate in the liver and lungs of the cattle and sheep with echinococcosis

    ASLI GÜNEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Veteriner HekimliğiKafkas Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ENVER BEYTUT

  3. Diyabet hastalarında pteridinlerin ve ilgili yolakların değerlendirilmesi

    Evaluation of pteridins and related pathways in diabetes

    SİNEM GÜRCÜ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe Üniversitesi

    Farmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TERKEN BAYDAR

    DOÇ. DR. GÖZDE GİRGİN

  4. Investigation of the relation between Helicobacter pylori and T cell response with examination of PD-L1 expression level in gastric pathogenesis

    Mide patogenezinde PD-L1 ekspresyon seviyesinin belirlenmesi ile Helikobakter pylori ve T hücre cevabıyla arasındaki ilişkinin araştırılması

    ELİF MERVE AYDIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Tıbbi Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. AYÇA SAYI YAZGAN

  5. İnaktive ve mRNA COVID-19 farklı aşılama gruplarında antikor ve t hücre bağışıklık yanıtının değerlendirilmesi

    Evaluation of antibody and t cell immunity response in different immunization groups of inactive and mRNA COVID-19 vaccines

    MERVE ZEREY ALBAYRAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Mikrobiyolojiİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜREYYA GÜL YURTSEVER