Geri Dön

COVİD-19 RNA'sı ve IGM tayinine yönelik biyosensör sistemleri geliştirilmesi

Development of biosensor systems for COVİD-19 RNA and İGM detection

PDF İndir

  1. Tez No: 765682
  2. Yazar: SİNAN ŞABAN AKKURT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YASEMİN AKÇAY
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Allerji ve İmmünoloji, Biyokimya, Mikrobiyoloji, Allergy and Immunology, Biochemistry, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 71

Özet

COVID-19 çok ciddi bir solunum yolu hastalığıdır. Tanı konması ise alınan örnek içerisindeki genomunun analizini gerçekleştiren Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile mümkündür. Bu analiz ise yaklaşık 4 saat sürmektedir. Bu nedenle gerçekleştirdiğimiz çalışmada PCR reaksiyonu yerine sadece COVID-19 hedef virüsünde bulunan RNA'nın tayini için kapasitif temelli bir biyosensör geliştirilmiştir. pM dizeyinde ve duyarlı bir analiz gerçekleştirebilmeyi başarmakla birlikte, biyosensör performans testleri de gerçekleştirilmiştir. Bu genosensörde biyotanıma ajanı olarak COVID-19 prob RNA'sı kullanılmıştır. COVID-19 RNA primeri ise https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome programı ile online olarak benzerlik taraması yapılarak belirlenmiştir. Bu çalışma ile prob RNA dizisi olarak 5'CAGAUUCAACUGGCAGUAACCAGA'3 olarak komplmenteri belirlenmiştir. Bunun yanonda ikincil bir biyobelirteç olan IgM ölçümü de COVID-19 belirtilerini doğrulamak için çalışılmıştır ve biyotanıma ajanı olarak anti-IgM kullanılarak iki farklı biyosensör geliştirilmiştir. Ölçümlerde kapasitans (C) kullanılmıştır kullanılacaktır. Kapasitif ölçümler tek moleküle kadar duyarlı ölçümler sağlayabilmeleri sayesinde duyarlılık için tercih edilmiştir. Bu şekilde ülkemize katma değer sağlayabilecek bir ürünün ilk aşamaları geliştirilerek konsept bir virüs biyosensör sistemi geliştirilmiştir.

Özet (Çeviri)

COVID-19 is a very serious respiratory disease. Diagnosis is possible with Polymerase Chain Reaction (PCR), which analyzes the genome in the sample. This analysis takes about 4 hours. Therefore, in our study, a capacitive-based biosensor was developed for the determination of RNA only in the COVID-19 target virus, instead of the PCR reaction. Biosensor performance tests were also carried out, although we were able to perform a sensitive analysis in the pM array. COVID-19 probe RNA was used as a biorecognition agent in this genosensor. The COVID-19 RNA primer was determined by online similarity scanning with the https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome program. In this study, the complement of 5'CAGAUUCAACUGGCAGUAACCAGA'3 was determined as the probe RNA sequence. Besides, measurement of IgM, a secondary biomarker, has also been studied to confirm the symptoms of COVID-19, and two different biosensors have been developed using anti-IgM as a biorecognition agent. Capacitance (C) will be used in the measurements. Capacitive measurements have been preferred for sensitivity as they can provide sensitive measurements up to a single molecule. In this way, a concept virus biosensor system was developed by developing the first stages of a product that can add value to our country..

Benzer Tezler

  1. Tez No

    723124

    COVID-19 hastalarında sars COV-2 virüs saçılımı ve nötralizan antikor düzeyleri

    Shedding of SARS COV-2 virus in COVID-19 patients and neutralizing antibody levels

    TUĞBA AYHANCİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiSakarya Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ

  2. Tez No

    866029

    Development of a selection protocol for target nucleic acids based on nanoparticles

    Nükleik asit hedeflerinde nanopartikul tabanlı seçim protokolü geliştirilmesi

    AYŞE PINAR AKALIN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ

  3. Tez No

    845229

    Comparison of sequencing and phylogenetic analysis of SARS-CoV-2 spike proteins extracted from patients and travelers in Duhok-Iraq

    Duhok-Irak'ta hastalar ve yolculardan alınan SARS-CoV-2 spikeproteinlerinin dizilim ve filogenetik analizinin karşılaştırılması

    OMAR MOHAMMED YOUNUS ALASADY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiHarran Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ARİF PARMAKSIZ

    DOÇ. DR. AMER ABDALLA GOREAL

  4. Tez No

    871959

    Derin öğrenme ile radyolojik görüntüler üzerinden COVID-19 tespiti

    COVID-19 detection in radiological images with deep learning

    TANJU CEYLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZKAN İNİK

  5. Tez No

    858151

    Detection of the OXA 48 gene responsible for carbapenem resistance in uropathogenic Esherichia coli isolated from patients with and without COVID-19 in Iraq

    Irak'ta COVID-19 olan ve olmayan hastalardan izole edilen üropatojenik Esherichia coli'de karbapenem direncinden sorumlu OXA 48 geninin tespiti

    AHMED HAMID SEBT JANABI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR

    PROF. DR. TAGHREED KUDUR MOHAMMED

Geri Dön