COVİD-19 RNA'sı ve IGM tayinine yönelik biyosensör sistemleri geliştirilmesi
Development of biosensor systems for COVİD-19 RNA and İGM detection
- Tez No: 765682
- Danışmanlar: PROF. DR. YASEMİN AKÇAY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Allerji ve İmmünoloji, Mikrobiyoloji, Biochemistry, Allergy and Immunology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Biyosensörler, COVID 19, Korona virüs enfeksiyonları, Korona virüsler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, RNA, Sensörler, İmmünoglobülin G, Biosensors, COVID 19, Coronavirus enfections, Coronaviridae, Polymerase chain reaction, RNA, Sensors, Immunoglobulin G
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
COVID-19 çok ciddi bir solunum yolu hastalığıdır. Tanı konması ise alınan örnek içerisindeki genomunun analizini gerçekleştiren Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile mümkündür. Bu analiz ise yaklaşık 4 saat sürmektedir. Bu nedenle gerçekleştirdiğimiz çalışmada PCR reaksiyonu yerine sadece COVID-19 hedef virüsünde bulunan RNA'nın tayini için kapasitif temelli bir biyosensör geliştirilmiştir. pM dizeyinde ve duyarlı bir analiz gerçekleştirebilmeyi başarmakla birlikte, biyosensör performans testleri de gerçekleştirilmiştir. Bu genosensörde biyotanıma ajanı olarak COVID-19 prob RNA'sı kullanılmıştır. COVID-19 RNA primeri ise https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome programı ile online olarak benzerlik taraması yapılarak belirlenmiştir. Bu çalışma ile prob RNA dizisi olarak 5'CAGAUUCAACUGGCAGUAACCAGA'3 olarak komplmenteri belirlenmiştir. Bunun yanonda ikincil bir biyobelirteç olan IgM ölçümü de COVID-19 belirtilerini doğrulamak için çalışılmıştır ve biyotanıma ajanı olarak anti-IgM kullanılarak iki farklı biyosensör geliştirilmiştir. Ölçümlerde kapasitans (C) kullanılmıştır kullanılacaktır. Kapasitif ölçümler tek moleküle kadar duyarlı ölçümler sağlayabilmeleri sayesinde duyarlılık için tercih edilmiştir. Bu şekilde ülkemize katma değer sağlayabilecek bir ürünün ilk aşamaları geliştirilerek konsept bir virüs biyosensör sistemi geliştirilmiştir.
Özet (Çeviri)
COVID-19 is a very serious respiratory disease. Diagnosis is possible with Polymerase Chain Reaction (PCR), which analyzes the genome in the sample. This analysis takes about 4 hours. Therefore, in our study, a capacitive-based biosensor was developed for the determination of RNA only in the COVID-19 target virus, instead of the PCR reaction. Biosensor performance tests were also carried out, although we were able to perform a sensitive analysis in the pM array. COVID-19 probe RNA was used as a biorecognition agent in this genosensor. The COVID-19 RNA primer was determined by online similarity scanning with the https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome program. In this study, the complement of 5'CAGAUUCAACUGGCAGUAACCAGA'3 was determined as the probe RNA sequence. Besides, measurement of IgM, a secondary biomarker, has also been studied to confirm the symptoms of COVID-19, and two different biosensors have been developed using anti-IgM as a biorecognition agent. Capacitance (C) will be used in the measurements. Capacitive measurements have been preferred for sensitivity as they can provide sensitive measurements up to a single molecule. In this way, a concept virus biosensor system was developed by developing the first stages of a product that can add value to our country..
Benzer Tezler
- COVID-19 hastalarında sars COV-2 virüs saçılımı ve nötralizan antikor düzeyleri
Shedding of SARS COV-2 virus in COVID-19 patients and neutralizing antibody levels
TUĞBA AYHANCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
MikrobiyolojiSakarya ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ
- Detection of the OXA 48 gene responsible for carbapenem resistance in uropathogenic Esherichia coli isolated from patients with and without COVID-19 in Iraq
Irak'ta COVID-19 olan ve olmayan hastalardan izole edilen üropatojenik Esherichia coli'de karbapenem direncinden sorumlu OXA 48 geninin tespiti
AHMED HAMID SEBT JANABI
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR
PROF. DR. TAGHREED KUDUR MOHAMMED
- Acil serviste COVID-19 tanısı alan hastaların başvuru yakınmalarının incelenmesi
Complaints and clinical processes of patients with COVID-19 in the emergency department
RIDVAN ALAGÖZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Acil TıpEskişehir Osmangazi ÜniversitesiAcil Servis Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURDAN ACAR
- Бишкек шаарында COVID-19 инфекциясын пцр методу менен диагностикалоонун жыйынтыктарын талдоо
PCR yöntemi ile bişkek şehrinde COVID-19 teşhisinin sonuçlarının araştırılması
AYCAN SADIRBAEVA
Yüksek Lisans
Kırgızca
2022
BiyolojiKırgızistan-Türkiye Manas ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KADIRBAY CHEKİROV
- Derin öğrenme ile radyolojik görüntüler üzerinden COVID-19 tespiti
COVID-19 detection in radiological images with deep learning
TANJU CEYLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZKAN İNİK