Aşırı DEK2 izoformu ifadesinin HS-27A hücre biyolojisine etkilerinin araştırılması
Investigation effect of overexpressed DEK2 isoform on HS-27A cell biology
- Tez No: 768529
- Danışmanlar: PROF. DR. AYTEN KANDİLCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
DEK proteini DNA tamiri dahil birçok hücresel süreçte yer alan ve bazı solid kanser türlerinde aşırı ifade gösteren bir onkoproteindir. DEK geni, alternatif kırpılmayla iki farklı DEK izoformunu kodlamaktadır. DEK izoform-1 (DEK1) hücresel süreçlerdeki rolü araştırılsa bile, DEK izoform-2 (DEK2) detaylı olarak incelenmemiştir Tez kapsamında, HS-27A hücrelerinde retroviral transdüksiyon yöntemiyle, N-terminal bölgesine Myc ya da Flag epitopu eklenmiş DEK1 ve DEK2 proteinlerinin kalıcı aşırı ifadesi sağlandı. Protein lokalizayon analizi, DEK1'in çekirdekte konumladığı, DEK2'ninse çekirdeğe ek olarak bu hücrelerin yaklaşık %90'nında Nucleophosmin-1 ile örtüşen agregatlar oluşturduğunu gösterdi. Bu hücrelerde doxorubicin ile DNA hasarı oluşturuldu. HS-27A MycDEK1 veya MycDEK2 hücrelerinin kontrol (HS-27A-GFP) hücrelerinden daha fazla gamma-H2AX DNA hasar sinyali oluşturduğu belirlendi. Ancak, doxorubicin uzaklaştırıldıktan 24 saat sonra DEK2 hücrelerindeki DNA hasar seviyesinin kontrol ve DEK1 hücrelerine göre daha yüksek seviyede olduğu tespit edildi (p
Özet (Çeviri)
DEK protein is an oncoprotein involved in many cellular processes, including DNA repair and overexpressed in some solid cancers. DEK gene encodes two different DEK isoforms by alternative splicing. Although DEK isoform-1 (DEK1) in cellular processes has been investigated, DEK isoform-2 (DEK2) has not been studied in detail. In this thesis, persistent overexpression of DEK1 and DEK2 proteins with a Myc or Flag epitope at the N-terminus were expressed by the retroviral method in HS-27A cells. DEK1 and DEK2 protein location was found in nucleus, but DEK2 protein also in nucleolus by overlapping Nucleophosmin-1 in approximately 90% cells. Doxorubicin induced DNA damage analysis showed that DEK1 and DEK2 cells produced more gamma-H2AX DNA damage signals than control cells. However, 24 hours after doxorubicin removal, DEK2 cells showed higher signal than control and DEK1 cells (p
Benzer Tezler
- DEK-2 izoformunun klonlanması ve fonksiyonel analizi
Cloning and functional analysis of DEK-2 isoform
EMRAH ÖZÇELİK
Doktora
Türkçe
2023
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN KANDİLCİ
- DEK3 izoformunun fonksiyonel analizi
Functional analysis of DEK3 isoform
AÇELYA AVCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN KANDİLCİ
- İnsan stroma ve monosit hücre hatlarında DEK1 ve DEK2 izoformlarının salgılanmasının belirlenmesi
Determination of the secretion of DEK1 and DEK2 isoforms in human stroma and monocyte cell lines
BÜŞRA ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN KANDİLCİ
- Aşırı geniş bantlı iletişim sistemleri için kanal kestirimi
Channel estimation for ultra wideband communication systems
MEHMET BAŞARAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN ALİ ÇIRPAN
YRD. DOÇ. DR. SERHAT ERKÜÇÜK
- Aşırı pretermlerde Prematüre Retinopatisinin (ROP) uzun dönem işitme kaybı ve nörogelişim ile ilişkisinin değerlendirilmesi
Evolution of the relationship between long-term hearing loss and neurodevelopment in extremely preterm infants with retinopathy of prematurity (ROP)
KONUL DUNDAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLKE MUNGAN AKIN
DOÇ. DR. FUNDA YAVANOĞLU ATAY