Geri Dön

Dermatofitlerin izolasyonu ve moleküler tanımlanması ve bununla ilişkili bazı çevresel faktörlerin incelenmesi

Isolation and molecular identification of dermatophytes and investigation of some environmental factors associated with it

PDF İndir

  1. Tez No: 775576
  2. Yazar: MURAD KHAMEES MUSHIB
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMET GAFFAROĞLU, YRD. DOÇ. DR. WALED KHALİD AHMED
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

Bu çalışmanın amacı, dermatofitlerin laboratuvarda fungal test yöntemleriyle izole edilmesi ve teşhis edilmesi, ortaya çıkan türlerin tanımlanması ve mevcut yerel izolatların Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) tarafından sağlananlarla karşılaştırılmasıdır. Dermatofitlere çoğunlukla Trichophyton, Microsporum ve Epidermophyton gibi birbiriyle yakından ilişkili bir grup cins neden olmaktadır. Bu mantar grupları deri, saç ve tırnakların stratum corneum'unu istila eder. Örnekler, Musul - Irak'taki Ibn Al-Atheer Hastanesi'nde dermatofitlerle enfekte olmuş 100 hastadan toplanmıştır. Her numunenin bir kısmı mikroskobik olarak incelenmiş ve her numunenin geri kalanı kloramfenik ve gentamisin (SDACG) ile desteklenmiş Saboraud Dekstroz Agar plakaları üzerinde kültüre edilmiştir. Sonuçlar, 100 dermatofit vakasından sadece 70'inin (%70) doğrudan KOH testi ve kültür ile pozitif olduğunu gösterirken, örneklerin 30'unda (%30) yanlış negatif sonuçlar kaydedilmiştir. Örnek kültür sonuçları altı dermatofit türünün tanımlandığını göstermiştir. Trichophyton spp, Scopulariopsis brevicaulis ve Candida spp %40 ile en yüksek insidansı gösterirken, bunu %30 insidans ile Trichophytonspp, ardından hiç görülmeyen 20 örnek ile S. brevicaulis ve %10 insidans ile Trichophyton spp izlemiştir. Diğer 20 örnek hiç görülmezken, mantar enfeksiyonu insidansı değişiklik göstermiştir. En yaygın klinik tip tinea korporis olmuştur. Erkekler kadınlardan daha fazla etkilenmiştir. Sonuçlar ayrıca 6-9 aylık yaş grubunun deri mantarları ile enfekte olma olasılığının daha yüksek olduğunu göstermiştir. Dermatofit izolatları, kolonilerinin makroskopik ve mikroskopik özellikleri incelenerek tanımlanmıştır. Teşhislerinin doğruluğundan emin olmak için, PCR tekniği kullanılarak elde edilen sonuçlar, primerlerin (ITS1, ITS4) incelenen mantarların genomlarını çoğalttığını ve çoğaltılan bantların (600 baz çifti) arasında değiştiğini göstermiştir. Bu çalışmadaki 1.2.3.4 numaralı izolatlar, izolatlarla benzerlik göstermektedir. Genbank'ta OP752127 numarasıyla kayıtlı Candida albicans. 5.6.7.8.9 numaralı izolatlar da OP752433 numaralı GenBank'ta kayıtlı C. glabrata izolatları ile benzerlik göstermektedir. 10.11.12 numaralı türler OP712459 numaralı GenBank'ta kayıtlı C. tropicalis izolatları ile benzerlik göstermektedir. 13.14.15 ve 16 numaralı izolatlar GenBank OP712621'de kayıtlı T. mentagrophytes izolatları ile benzerlik göstermektedir. 17 ve 18 numaralı izolatlar da S. brevicaulis ile benzerlik göstermektedir ve Genbank OP752128'de kayıtlıdır.

Özet (Çeviri)

This study aimed to isolate and diagnose dermatophytes by fungal assay methods in the laboratory, identify the species that emerged and compare the current local isolates with those provided by the National Center for Biotechnology Information (NCBI). Dermatophytes are mostly caused by a group of closely related genera of Trichophyton, Microsporum, and Epidermophyton. These groups of fungi invade the stratum corneum of the skin, hair, and nails. Samples were collected from 100 patients infected with dermatophytes at Ibn Al-Atheer Hospital, Mosul-Iraq. A portion of each sample was examined microscopically and the remainder of each sample was cultured on plates of Saboraud Dextrose Agar supplemented with chloramphenic and gentamicin (SDACG). The results showed that among the 100 cases of dermatophytes, only 70 (70%) were positive by direct KOH assay and culture, while false negative results were recorded in 30 (30%) of the samples. Sample culture results showed the identification of six types of dermatophytes. Trichophyton spp and Scopulariopsis brevicaulis, Candida spp showed the highest incidence with 40%, followed by Trichophyton spp with an incidence of 30%, then Scopulariopsis brevicaulis with 20 samples not seen at all, followed by Trichophyton spp with an incidence of 10 %. While the other 20 specimens were never seen, the incidence of fungal infection varied. The most common clinical type was tinea corporis. Men were more affected than women. The results also showed that the age group 6-9 months were more likely to be infected with skin fungi. Dermatophytes isolates were identified by studying the macroscopic and microscopic characteristics of their colonies. To ensure the correctness of their diagnosis, the results obtained using the PCR technique showed that the primers (ITS1, ITS4) amplified the genomes of the fungi examined and the amplified bands ranged from (600 base pairs). The isolates numbered 1.2.3.4 in this study were similar to the isolates. Candida albicans recorded in Genbank numbered OP752127. The isolates numbered 5.6.7.8.9 also showed similarity with the isolates of Candida glabrata recorded in GenBank numbered OP752433. Species numbered 10.11.12 are similar to Candida tropicalis isolates recorded in the GenBank numbered OP712459. Isolates 13.14.15 and 16 show similarity to isolates of Trichophyton mentagrophytes recorded in GenBank OP712621. Isolates 17 and 18 are also similar to Scopulariopsis brevicaulis and are recorded in Genbank OP752128.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    194451

    Kedi ve köpeklerden dermatofitlerin izolasyonu

    Isolation of dermatophytes from cats and dogs

    OSMAN YAŞAR TEL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MEHMET AKAN

  2. Tez No

    335539

    Topraktan ve insandan izole edilen bazı dermatofitlerin moleküler tanısı

    Molecular identification of some dermatophytes isolated from soil and man

    MERVE YAVUZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. H. HALİL BIYIK

    PROF. DR. FEVZİ BARDAKÇI

  3. Tez No

    729690

    Kutanöz mantar enfeksiyonu şüphesi olan hastalardan alınan deri kazıntı örneklerinde dermatofit ve diğer mantar etkenlerinin konvansiyonel ve PCR yöntemleriyle saptanması

    Determination of dermatophyte and other fungus agents in conventional and PCR methods in skin scraping samples taken from patients with suspected cutanus fungi infection

    FATMA GÜNBEY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZÜLAL AŞÇI TORAMAN

  4. Tez No

    118448

    Yüzeyel mikoz infeksiyonu düşünülen hastalardan etkenlerin izolasyonu, identifikasyonu ve antifungal ilaçlara in vitro duyarlılıkları

    Isolation, identification and in vitro susceptibility to antifungal drugs of the agents isolated from patients with superficial mycoses infection

    NURİYE KARACA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. A. NEDRET KOÇ

  5. Tez No

    491782

    Dermatofitlerde tür tayini ve Van yöresinde izole edilen dermatofitler

    Identifcation of dermatophytes and isolation of dermatophytes in the Van region

    HAMZA BOZKURT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    MikrobiyolojiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA BERKTAŞ

Geri Dön