İnsan somatik hücrelerinin uyarılmış plüripotent kök hücrelere yeniden programlanması sürecinde arilhidrokarbon reseptörü sinyalizasyonundaki değişimlerin incelenmesi
Investigation of the alterations in arylhydrocarbon receptor signaling during reprogramming of somatic cells towards ipscs.
- Tez No: 782551
- Danışmanlar: PROF. DR. FAHRİYE DUYGU ÇETİNKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Moleküler Tıp, Tıbbi Biyoloji, Biology, Molecular Medicine, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Uyarılmış plüripotent kök hücre, yeniden programlama, zenobiyotik, plüripotensi, Aril hidrokarbon Reseptörü (AhR), Induced pluripotent stem cells, Reprogramming, xenobiotic, pluripotency, Aryl hydrocarbon Receptor (AhR). This study was supported by Hacettepe University BAP, project numbered TYL-2022-19977
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kök Hücre Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Kök Hücre Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 119
Özet
Somatik hücrelerin in-vitro ortamda yeniden programlanarak uyarılmış pluripotent kök hücrelerin (uPKH) geliştirilmesi, hastalık modelleme, ilaç araştırmaları için önemli fırsatlar sunmaktadır. Somatik hücrenin plüripotentliğe doğru de-diferansiyasyonla yeniden programlanma (Reprogramming, YP) sürecinde etkili mekanizmaların aydınlatılması ve optimal koşulların oluşturulmasına yönelik bilgi ve deneyim kazanılması gerekmektedir. Bu tez çalışması, uPKH'lerin YP aşaması ve kültürde çoğaltma sürecinde, bir zenobiyotik reseptörü olan ve hücre kaderinin yönlendirilmesinde kilit rol oynayan Arilhidrokarbon Reseptör (AhR) sinyalizasyonunun değişimleri araştırmak üzere planlanmıştır. AhR sinyalizasyonunun yeniden programlanma sürecindeki değişimlerinin incelenmesi amacıyla yapılan deneylerde başlangıç hücresi olarak mezenkimal kök hücreler kullanılmış, OSKM faktörlerinin aktarımı epizomal plazmitlerin elektroporasyonuyla gerçekleştirilmiştir. Yeniden programlanmanın ilk yedi günlük süreci ve ardından belirlenen zaman aralıklarında ve ileri pasaj uPKH'lerde, hücrelerin morfolojik değişimleri ve AhR sinyalizasyonu ilişkili gen/protein ifadeleri, somatik hücre/MKH kimliğinin kaybı, mezenkimal-epitelyal geçiş (MET) ve plüripotensi-ilişkili gen ifadeleri araştırılmış, ayrıca AhR agonist (FICZ) ve antagonist (StemRegenin-1) kullanımı ile ön deneyler yapılmıştır. MKH'lerin YP sürecinde AhR ve ilişkili moleküllerin uyarıldığı gözlemlenmiştir. İleri pasaj uPKH'lerde ise AhR gen ifadesinin baskılandığı, AHRR ve pluripotensi ile artan IDO-1 (İndoleamin-pirol 2,3-dioksijenaz)'in ifadesinin arttığı gösterilmiştir. Bu bulguların, hücre biyolojisi ve köklülük durumunun belirlenmesinde AhR sinyalizasyonunun regülatör rolünü düşündürmüştür.
Özet (Çeviri)
Generation of induced pluripotent stem cells (iPSC) by reprogramming somatic cells in-vitro, offers significant opportunities for disease modeling and drug research. In the reprogramming process of the somatic cell with de-differentiation towards pluripotency, it is necessary to gain knowledge and experience to elucidate the effective mechanisms and to create optimal conditions. This thesis study was planned to investigate the changes in Arylhydrocarbon Receptor (AhR) signaling, which is a xenobiotic receptor and plays a key role in the regulation of cell fate, during reprogramming and culturing of iPSCs. Mesenchymal stem cells (MSCs) were used as source cells to investigate the changes in AhR signaling during reprogramming through the transfer of OSKM factors by electroporation of episomal plasmids. The morphological changes of the cells and AhR signaling-related gene/protein expressions, loss of somatic cell/MSC identity, mesenchymal-epithelial transition (MET) -related and pluripotency-related gene expressions were investigated during the first seven-day period of reprogramming and then at specified time intervals, and in mature iPSCs. Preliminary experiments were carried out with the use of AhR agonist (FICZ) and antagonist (StemRegenin-1). Upregulation of AhR and related molecules were noted during reprogramming process of MSCs towards pluripotency. On the other hand AhR gene expression was suppressed in characterized iPSCs when compared to the cells at reprogramming stage. This was associated with upregulated expression of AHRR and IDO-1 shown to increase with pluripotency. These preliminary findings suggested a possible regulatory role of AhR signaling in determining stemness and cell fate.
Benzer Tezler
- The role of histone H3 lysine 36 methylation in reprogramming of fibroblasts and on induced pluripotent stem cell generation
Histon H3 lizin 36 metilasyonunun yeniden programlama ve uyarılmış plüripotent kök hücre oluşumundaki rolü
BURCU ÖZÇİMEN
Doktora
İngilizce
2018
BiyolojiKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TEVFİK TAMER ÖNDER
- Histon 3 metillenmesinin yeniden programlanmadaki etkisinin incelenmesi
The analysis of histone 3 methylation effects on reprogramming
AYYUB EBRAHİMİ
Doktora
Türkçe
2016
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞULE ARI
DOÇ. DR. TEVFİK TAMER ÖNDER
- Uzun QT sendromlu transgenik ve vahşi tip farelerden pluripotent kök hücre üretilmesi ve kardiyomiyosite farklılaştırılarak hastalık fenotipinin incelenmesi
Generation of induced pluripotent stem cell derived cardi̇omyocytes from long QT-syndrome mouse model for disease modeling
GÖKÇE İLAYDA GÖRGÜLÜ SÖZTEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Tıbbi Biyolojiİstanbul Medipol ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA ÇAĞAVİ
- Determining the effects of DOT1L interacting proteins on cellular reprogramming
DOT1L ile etkileşen proteinlerin hücrenin yeniden programlama tekniğine etkilerinin belirlenmesi
DENİZ UĞURLU ÇİMEN
Doktora
İngilizce
2018
Moleküler TıpKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TEVFİK TAMER ÖNDER
- Investigating genetic and epigenetic regulators of human naive pluripotent stem cells
İnsan naif pluripotent kök hücrelerinin genetik ve epigenetik düzenleyicilerinin araştırılması
NİLYA KARASÜRMELİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Tıbbi BiyolojiKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TEVFİK TAMER ÖNDER