Phenotypıc and genotypıc bıofılm formatıon characterıstıc of acınetobacter baumannıı ısolated from ıntensıve care unıts
Yoğun bakim ünitelerinden izole edilen acinetobacter baumannii izolatlarinin fenotipik ve genotipik biofilm formasyon özellikleri
- Tez No: 803813
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYLİN ÜSKÜDAR GÜÇLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Başkent Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Acinetobacter baumannii, nozokomiyal enfeksiyonlarla yaygın olarak ilişkili önemli bir patojendir. Biyofilm oluşturma yeteneği, hastane ortamlarında hayatta kalmasını sağlar ve yok edilmesi için zorluklar yaratır. Bu çalışmada, yoğun bakım ünitelerinden (YBÜ) izole edilen imipenem, meropenem, amikasin, gentamisin, levofloksasin, siprofloksasin, trimetoprim/sülfametoksazol, tigesiklin ve kolistin dirençli A. baumannii izolatlarında biyofilm oluşumunun yapısal özelliklerinin araştırılması ve buna katkıda bulunan genetik altyapının belirlenmesi amaçlanmıştır. Başkent Üniversitesi Ankara Hastanesi yoğun bakım ünitelerinden elde edilen toplam 52 klinik A. baumannii izolatı çalışmaya dahil edildi. Antibiyotik duyarlılıkları test edildi ve kristal viyole boyama yöntemi kullanılarak biyofilm oluşturma yetenekleri değerlendirildi. Ek olarak, biyofilmler taramalı elektron mikroskobu (SEM) altında görselleştirildi. Biyofilm canlılığı, MTT yöntemi kullanılarak belirlendi ve blaCsuE, blaOmpA, blaabaI, blapgaA, blabap ve blaPer1 dahil olmak üzere biyofilmle ilgili genlerin varlığı, PCR kullanılarak tespit edildi. 52 A. baumannii izolatının %96,1'i biyofilm oluşturma yeteneği göstermiştir. Biyofilm ilişkili genler blabap ve blaabaI izolatların %98'inde tespit edilmiştir. Bunları takiben izolatların sırasıyla %96,1'inde blaOmpA ve %94,0'ında blaCsuE saptanmıştır. İzolatların sırasıyla %50,0 ve %40,3'ünde blapgaA ve blaPer1 genleri bulunmuştur. MTT analizi ile izolatların biyofilmdeki canlılıkları %13,5 ile %112,4 arasında belirlenmiştir. Bu faktörlerin varlığını ve aralarındaki ilişkileri anlamak, A. baumannii enfeksiyonlarını önlemek ve yönetmek için yeni yaklaşımlar geliştirmek için çok önemlidir. Bu patojenle mücadelede etkili stratejiler geliştirmek için biyofilm oluşumunda yer alan genlere dikkat edilmelidir.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumannii is a significant pathogen commonly associated with nosocomial infections. Its ability to form biofilms enables it to survive in hospital settings and poses challenges for eradication. This study aimed to investigate the structural characteristics of biofilm formation in imipenem, meropenem, amikacin, gentamicin, levofloxacin, ciprofloxacin, trimethoprim/sulfamethoxazole, tigecycline and colistin resistant A. baumannii isolates from intensive care units (ICUs) and identify the genetic backgrounds contributing to biofilm formation. A total of 52 clinical A. baumannii isolates obtained from ICUs at Baskent University Ankara Hospital were included in the study. Antibiotic susceptibilities were tested, and biofilm formation ability was assessed using the crystal violet staining method. Additionally, biofilms were visualized under scanning electron microscope (SEM). Biofilm viability was measured using the MTT assay, and the presence of biofilm-related genes, including blaCsuE, blaOmpA, blaabaI, blapgaA, blabap, and blaPer1, was detected using PCR. Among the 52 A. baumannii isolates, 96.1% demonstrated biofilm formation ability. The biofilm-related genes blabap and blaabaI were detected in 98% of the isolates. Following these, blaOmpA and blaCsuE were present in 96.1% and 94.0% of the isolates, respectively. The presence of blapgaA and blaPer1 was observed in 50.0% and 40.3% of the isolates, respectively. The MTT assay revealed varying viability percentages ranging from 13.5% to 112.4%. Understanding the presence and relationships between these factors is crucial for developing novel approaches to prevent and manage A. baumannii infections. Attention should be directed towards the genes involved in biofilm formation to devise effective strategies for combating this pathogen
Benzer Tezler
- Acinetobacter baumannii klinik suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması
Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of acinetobacter baumannii clinical isolates
NEZAHAT KOŞAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHitit ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE SEMRA GÜRESER
- Burdur'daki mezbahalarda listeria monocytogenes'in prevalansı, fenotipik ve genotipik karakterlerinin araştırılması
Investigation of the prevalence, phenotypic and genotypic characteristics of listeria monocytogenes in slaughterhouses in Burdur
ZEKİ EROL
Doktora
Türkçe
2022
Besin Hijyeni ve TeknolojisiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiGıda Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FULYA TAŞÇI
- Isolation, identification and determination of some pathogenic characteristics of salmonella spp. from retail chicken meat by phenotypic and genotypic methods
Salmonella türlerinin perakende tavuk etinden fenotipik ve genotipik metodlarla izolasyonu, identifikasyonu ve bazı patojenik özelliklerinin belirlenmesi
CEREN BETÜL EKEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
BiyolojiAbant İzzet Baysal ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEZA ARSLAN
- Staphylococcus aureus suşlarında biyofilm üretimi,biyofilm pozitif ve negatif suşların genotipik ve fenotipik karakterlerinin karşılaştırılması
Biofilm production in Staphylococcus aureus strains,comparison of genotypic and phenotypic characteristics of biofilm positive and negative strains
RASİM ŞAHİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
MikrobiyolojiPamukkale ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. İLKNUR KALELİ
- Metisilin dirençli Staphylococcus aureus izolatlarında biyofilm oluşumunun genotipik ve fenotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of biofilm in methicillin resistant Staphylococcus aureus isolates by genotypic and phenotypic methods
ZELİHA SEYFİ ŞANDA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DEMET GÜR VURAL