Geri Dön

Kolorektal kanserde tanı belirteci olarak mikrorna'ların rolü

The role of microrna's as diagnostic markers in colorectal cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 831280
  2. Yazar: SELÇUK GÜLMEZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEVGİ KALKANLI TAŞ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Moleküler Tıp, Onkoloji, Genel Cerrahi, Molecular Medicine, Oncology, General Surgery
  6. Anahtar Kelimeler: Biyobelirteçler, Gen ifadesi, Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), Kolon hastalıkları, Kolon neoplazmları, Kolorektal cerrahi, Kolorektal neoplazmlar, Mikro RNA, Neoplazmlar, Teşhis, Biomarkers, Gene expression, Reverse transcription polimerase chain reaction, Colonic diseases, Colonic neoplasms, Colorectal surgery, Colorectal neoplasms, Micro RNA, Neoplasms, Diagnosis
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
  10. Enstitü: Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Onkoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Bu çalışma, üç mikroRNA (miRNA)'nın (miRNA-92a-3p, miRNA-29a-3p ve miRNA-21-5p) kolorektal kanser (KRK)'deki tanısal ve prognostik öngörülebilirliğini değerlendirmek için, tümörlü hastalardan elde edilen doku ve serum numunelerinin kontrolleriyle karşılaştırmalı analizini amaçlamaktadır. Gereç ve Yöntem: Önceki çalışmalara dayanarak, KRK tanısı için en umut verici 3 miRNA (miR-92a-3p, miR-29a-3p ve miR-21-5p) seçildi. Çalışmaya yeni tanı almış kolorektal tümörlü toplam 15 hasta prospektif olarak dahil edildi. Kolonoskopi sırasında tümörden (15 tümör örneği) ve 5 cm komşu normal mukozadan (15 kontrol doku örneği) doku örnekleri toplandı. Aynı hastalardan ameliyat öncesi dönemde de kan örnekleri alındı (15 tümör serumu örneği). Kontrol serumları ise, yaş ve cinsiyet eşleştirilerek sağlıklı bireylerden elde edildi (15 kontrol serum örneği). Bulgular: Her üç tümör doku ve serum miRNA'ları da upregüle olmuşlardır. Tümör serum miRNA 92a-3p'nin fold regülasyonu 10,79 (p=0,001), miRNA 29a-3p'nın 0,62 (p=0,003) ve miRNA 21-5p'nın ise 10,01 (p=0,001) idi. ROC (alıcı işletim karakteristiği) eğrisi ile hesaplanan tümör serum miRNA 92a-3p'nin cutoff değeri 8,10 [Area under curve (AUC)=0,885, duyarlılık %80,0 özgüllük %78,3 (p=0,002], miRNA 21-5p için cutoff değeri 6,08 (AUC=0,849, duyarlılık %76,7, özgüllük %72,4 (p=0,004), ve miRNA 21-5p için cutoff değeri 5,93 (AUC=0,822, duyarlılık %73,3, özgüllük %70,1, (p=0,001) idi. Tüm tümör serum miRNA'ları için lenfovasküler invazyon (LVI), tümör derecesi ve tümör evresi anlamlıydı (p<0.05). Kontrolleriyle karşılaştırıldığında tümör serum miR-92a-3p ve miR-29a-3p perinöral invazyon (PNI) için anlamlıydı (her ikisi için de p=0,044), ancak miRNA-21-5p anlamlı bir farklılık göstermedi (p =0,282). Sonuç: Dolaşımdaki miRNA-92a-3p, miRNA-29a-3p ve miRNA-21-5p, KRK'nin tanısı ve prognozu için umut verici görünmektedir.

Özet (Çeviri)

Aim: This study aims to evaluate the suitability of miR-92a-3p, miR-29a-3p, and miR-21-5p for diagnostic and prognostic predictability of colorectal cancer (CRC) by comparative analysis of tissue and serum samples with controls. Materials and Methods: Based on previous studies, the three most promising miRNAs (miR-92a-3p, miR-29a-3p, and miR-21-5p) for CRC diagnosis were selected. A total of 15 patients with newly diagnosed colorectal tumors were included prospectively. Tissue samples were collected during colonoscopy from the tumor (15 tumor samples) and 5 cm adjacent normal mucosa (15 control tissue samples). Blood samples were taken from the same patients in the preoperative period (15 tumor serum samples). Control serums were achieved from healthy individuals by matching age and gender (15 control serum samples). Results: All of these miRNAs were up-regulated. The fold regulation of tumor serum miRNA 92a-3p was 10.79 (p=0.001), for miRNA 29a-3p 7.62 (p=0.003), and for miRNA 21-5p 10.01 (p=0.001). The cutoff value of tumor serum miRNA 92a-3p calculated with ROC curve was 8.10 (AUC=0.885, sensitivity 80.0%, specificity 78.3%, (p=0.002), for miRNA 21-5p 6.08 (AUC=0.849, sensitivity 76.7%, specificity 72.4%, (p=0.004)), and for miRNA 21-5p 5.93 (AUC=0.822, sensitivity 73.3%, specificity 70.1%, (p=0.001). LVI, tumor grade, and tumor stage were significant for all tumor serum miRNAs (p<0.05). The tumor serum miR-92a-3p and miR-29a-3p were significant for PNI compared to their controls (p=0.044 for both), but miRNA-21-5p was not significantly different (p=0.282). Conclusion: Circulating miRNA-92a-3p, miRNA-29a-3p, and miRNA-21-5p appear promising for the diagnosis and prognosis of CRC.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    887266

    Variant detection in inflammatory diseases

    İnflamatuvar hastalıklarda varyant belirlenmesi

    GİZEM ALKURT

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  2. Tez No

    502352

    Kolorektal kanserli hastalarda EPCAM (epidermal celladezyon molekülü) ve VCAM-1 (vasküler cell adezyonmolekülü) seviyelerinin klinik öneminindeğerlendirilmesi

    Evaluation of clinical trials of EPCAM (epidermal celladhesive molecular) and VCAM-1 (vascular cell adhesive molecular) levels in patients with colorectal cancer,

    ELİF KAHRAMAN GÜNER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    OnkolojiBülent Ecevit Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN ENGİN

  3. Tez No

    171878

    Kolon polipli ve kolorektal kanserli hastalarda serum NO ve TGF-&#946;1'in klinik önemi

    Clinical role of NO and TGF-&#946;1 in patients with colon polyps and colorectal cancers

    ZUHAL ARSLAN KÖKSAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    OnkolojiGazi Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ŞÜKRÜ DUMLU

  4. Tez No

    992065

    Psödoinvazyon/invajinasyon alanı içeren adenomatöz kolorektal polipler ile kolorektal malign polipler arasında ve normal mukoza ile konvansiyonel adenokarsinom tanısı alan kolorektal tümörlerin 5-hidroksimetilsitozin (5HMC) ve 5-metilsitozin (5MC) ekspresyonun değerlendirilmesi

    Evaluation of 5-hydroxymethylcytosine (5HMC) and 5-methylcytosine (5MC) expression in adenomatous colorectal polyps containing areas of pseudoinvasion/invagination and in colorectal malignant polyps, and in colorectal tumors diagnosed as conventional adenocarcinoma compared with normal mucosa

    İREM AYLİN ÖZKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    PatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CEM LEBLEBİCİ

  5. Tez No

    310044

    Kolorektal kanser tanısında fekal ve plazma tımp-1,cox-2,mmp-7 kombinasyonunun tümör belirteçi olarak değerlendirilmesi

    Evaluation of fecal and plasma timp-1,cox-2,mmp-7 combinations as a tumor marker in colorectal cancer

    RABİA KIYAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyokimyaDokuz Eylül Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLGÜN OKTAY

Geri Dön