Geri Dön

Inter-tissue convergence of gene expression and loss of identity during ageing

Yaşlanma sırasında gen anlatımlarının dokular arası yakınsaması ve kimlik kaybı

PDF İndir

  1. Tez No: 831279
  2. Yazar: HAMİT İZGİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET SOMEL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoistatistik, Genetik, Geriatri, Biostatistics, Genetics, Geriatrics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 162

Özet

Gelişim sırasındaki gen ifadelerinin değişim yönünün, yaşlanma sırasında tersine dönmesi primat beyin dokularında önceki çalışmalarda gözlemlenmiştir. Bu tersine dönme örüntüsü, yaşlanma sırasında hücresel kimlik kaybıyla ilişkilendirilmiştir. Bu gözlemden yola çıkarak, tersine dönmenin yaygınlığını farklı fare dokularını kulla- narak inceledik. 16 farenin korteks, akciğer, karaciğer ve kas dokularından, hem ge- lişim hem de yaşlanma dönemlerini kapsayan transkriptom verileri ürettik. Yaygın olarak gözlemlediğimiz tersine dönme örüntüsü dokular arasında ortaklık gösterme- mektedir. Buradan yola çıkarak yaptığımız analizler sonucunda, tersine dönme örün- tüsü yeni bir olguyu ortaya çıkarmaktadır: doğum sonrası gelişim döneminde doku transcriptomları birbirinden uzaklaşırken, yaşlanma sırasında benzer gen ifade sevi- yelerine yakınsamaya başlamaktadır. Ayrışma-Yakınsama olarak adlandırdığımız bu örüntünün dokulara özgü genlerle ilişkili olduğunu ve yaşlanma sırasında doku kim- lik kaybına işaret ettiğini gösterdik. Daha önce yayınlanmış bağımsız fare ve insan verilerini kullanarak bu gözlemimizin yaygın olabileceğini gösterdik. Ayrıca, yine daha önce yayınlanmış bir tekil hücre transcriptome verisini kullanarak, ayrışma-yakınsama örüntüsünün hem dokulardaki hücre tiplerinin oranlarındaki değişimlerden hem de hücrelerin otonom gen ifadesi değişikliklerinden kaynaklanabileceğini gösterdik.

Özet (Çeviri)

Gene expression trajectories during development tend to reverse their direction in ageing, a phenomenon previously reported in primate brain tissues. This reversal phenomenon was linked to cellular identity loss during ageing. Motivated by this observation, we studied the prevalence of reversals in different mouse tissues. Gen- erating transcriptome data from cortex, lung, liver and muscle tissues of 16 mice, covering both development and ageing intervals, we fould widespread but tissue spe- cific ageing-associated expression reversals. Cumulatively, these reversals create a unique phenomenon: mammalian tissue transcriptomes diverge from each other dur- ing postnatal development, but during ageing, they tend to converge towards similar expression levels, a process we term divergence-convergence, or DiCo. We revealed that genes showing DiCo pattern are associated with tissue-specific genes, a possible indication of loss of tissue-specificy during ageing. We found further evidence for the DiCo pattern using data from independent mouse and human datasets. Moreover, using publicly available single-cell transcriptome data, we showed that DiCo could be driven both by alterations in tissue cell-type composition and also by cell-autonomous expression changes within particular cell types.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    340706

    Dört farklı kök kanalı irrigasyon yönteminin Enterococcus faecalis ile enfekte edilen kök kanallarındaki antibakteriyal etkinliklerinin in-vitro olarak karşılaştırılması

    An in vitro comparison of antibacterial effects of four different root canal irrigation method in root canals infected with Enterococcus faecalis

    TUBA AYHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Diş HekimliğiYeditepe Üniversitesi

    Diş Hekimliği Bölümü

    DOÇ. DR. FİGEN KAPTAN

  2. Tez No

    728795

    Farklı koşul ve sürelerde dondurarak saklamanın yağ grefti ve stromal vasküler fraksiyon (SVF) ürünlerinin hücresel sağ kalımları üzerinde etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of storage in different conditions and times on cell survival of fat graft and stromal vascular fraction (SVF) products

    MUSTAFA ÖZTÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Histoloji ve EmbriyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Plastik Cerrahi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SELMAN HAKKI ALTUNTAŞ

  3. Tez No

    493885

    Preparation of fab fragment immobilized immunoaffinity cryogels and albumin purification

    Fab fragment immobilize immunoafinite kriyojellerin hazırlanması ve albümin saflaştırılması

    SABINA HUSEYNLI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    KimyaHacettepe Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADİL DENİZLİ

  4. Tez No

    91

    Tamoxifenin testis dokusuna etkisinin ışık ve elektronmikroskop düzeylerinde incelenmesi

    Investigating of the effect of tamoxifen on the testes tissue at light and electronmicroscopical levels

    RECEP KUTLUBAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1987

    MorfolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERDOĞAN GÜRSOY

  5. Tez No

    269613

    Metileugenolün testis üzerindeki etkilerinin ışık mikroskobik düzeyde incelenmesi

    Investigation of effects of methyleugenol on testis by light microscope

    YELİZ ŞEN TANRIVERDİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyolojiTrakya Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AYŞEGÜL ÇERKEZKAYABEKİR

Geri Dön