Batı akdeniz bölgesindeki gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) çiftliklerinden izole edilen bakteriyel hastalık etkenlerinin, antibiyotik direnç genlerinin ve bazı endemik mercan köşk (Origanum spp.) yağlarının etkenlere karşı antimikrobiyal etkilerinin belirlenmesi
Determination of isolated bacterial disease causes,antibiotic resistance genes and the antimicrobial effects of some endemic marjoram (Origanum spp.) species oils against agents in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) farm operating from the west mediterranean region
- Tez No: 859208
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İFAKAT TÜLAY ÇAĞATAY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Su Ürünleri, Aquatic Products
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 130
Özet
Bu tez çalışmasında Batı Akdeniz Bölgesi'nde faaliyet gösteren gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792) çiftliklerinde sık görülen ve ekonomik kayıplara sebep olan bazı bakteriler izole edilerek ilk olarak bu bakterilerde bulunan çeşitli antibiyotiklere karşı oluşan direnç genlerinin floR, ermA, ermB, tetA, tetE, tetM, sulI, sulII ve sulIII tespiti ve ikinci olarakda bu bakterilere karşı ülkemize endemik Origanum türlerinden olan O. minutiflorum, O. saccatum ve O. bilgeri'nin uçucu bitkisel yağlarına karşı antimikrobiyal etkilerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Batı Akdeniz Bölgesi illerinden toplanan 108 adet hastalık belirtisi gösteren gökkuşağı alabalığından alınan bakteri örneklerinden mikrobiyolojik ekimler yapılarak ekonomik kayıplara sebebiyet veren yersiniosis, lactococcosis ve motil aeromonas septisemisi gibi hastalıkların gökkuşağı alabalıklarında etkeni olan Aeromonas hydrophila, Lactococcus garvieae ve Yersinia ruckeri bakteri türleri moleküler biyolojik yöntemlerden biri olan PCR yöntemi ile teşhis edilmiştir. Ayrıca matriks aracılı lazer dezorbsiyon iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi MALDI TOF (Bruker Microflex) olan bakteryal protein analiz yöntemi ile bu bulgular doğrulanmıştır. İzole edilen ve tanımlanan bakterilerin antibiyotiklerine duyarlılıkları disk difüzyon yöntemiyle eritromisin (15 µg), florfenikol (30 µg), tetrasiklin (30 µg), sulfametakzasol (100 µg) ve sulfametakzasol-trimetoprim (25 µg) antibiyotikleri kullanılarak belirlenmiştir. Ayrıca tanımlanan bu üç bakteri türünün bu çalışmada elde edilen endemik O. minutiflorum, O. saccatum ve O. bilgeri'nin uçucu yağlarına karşı antimikrobiyal etkileri ve minimum inhibisyon konsantrasyon (MİK) değerleri çalışılmıştır. Sonuç olarak, bu bakteri türlerinin eritromisin (15 µg), florfenikol (30 µg), tetrasiklin (30 µg), sulfametakzasol (100 µg) ve sulfametakzasol-trimetoprim (25 µg) antibiyotiklere duyarlı oldukları belirlenirken en etkin antibiyotiğin florfenikol (30 µg) olduğu gözlemlenmiştir. Aeromonas hydrophila, Lactococcus garvieae ve Yersinia ruckeri bakterileri için florfenikol (30 µg) antibiyotik zon çapları ortalaması sıra ile 31,0 mm, 23,0 mm ve 30,0 mm olarak tespit edilmiştir. Bakterilerden Y. ruckeri (tetA, sulI,ile sulII) L. garvieae (floR, ermA, ermB, tetA, tetE, tetM, sulI, sulII ile sulIII) ve Aeromonas hydrophila (sulII) antibiyotik direnç geni taşıdıkları spesifik primer ve PCR ile tespit edilmiştir. Ayrıca çalışılan bakteriler üzerine endemik O. minutiflorum, O. saccatum ve O. bilgeri uçucu bitkisel yağlarının antimikrobiyal etkisinin olduğu, O. saccatum yağının O. minutiflorum ve O. bilgeri yağına göre antimikrobiyal etkisinin daha az olduğu belirlenirken, O. minutiflorum ve O. bilgeri yağının güçlü antimikrobiyal etki gösterdikleri belirlenmiştir. Endemik Origanum uçucu yağlarının minimum inhibisyon konsantrasyon değeri ise A. hydrophila, L. garvieae ve Y. ruckeri bakterileri türleri üzerine O. saccatum yağı için 3,90 µl/mL olarak, O. bilgeri ve O. minutiflorum yağları için ise 1,90 µl/mL olduğu belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this thesis study, some bacteria that are frequently seen and cause economic losses in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792) farms operating in the Western Mediterranean Region were isolated and first the resistance genes against various antibiotics found in these bacteria were identified as floR, ermA, ermB, tetA, tetE, tetM, sulI, sulII and sulIII and secondly to determine the antimicrobial effects of essential oils of O. minutiflorum, O. saccatum and O. bilgeri, which are Origanum species endemic to our country, against these bacteria. Microbiological cultivation was performed on bacterial samples taken from 108 rainbow trout showing disease symptoms collected from the provinces of the Western Mediterranean Region, and the bacterial species Aeromonas hydrophila, Lactococcus garvieae and Yersinia ruckeri, which are the causative agents of diseases such as yersiniosis, lactococcosis and motile aeromonas septicemia, which cause economic losses in rainbow trout, were examined using molecular biological methods. It was diagnosed by PCR method. Additionally, these findings were confirmed by the bacterial protein analysis method with matrix-mediated laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry MALDI TOF (Bruker Microflex). The antibiotic susceptibilities of the isolated and identified bacteria were determined by disk diffusion method using the antibiotics erythromycin (15 µg), florfenicol (30 µg), tetracycline (30 µg), sulfametxasol (100 µg) and sulfamethaxasol-trimethoprim (25 µg). In addition, the antimicrobial effects and minimum inhibition concentration (MIC) values of these three identified bacterial species against the essential oils of endemic O. minutiflorum, O. saccatum and O. bilgeri obtained in this study were studied. As a result, it was determined that these bacterial species were sensitive to the antibiotics erythromycin (15 µg), florfenicol (30 µg), tetracycline (30 µg), sulfamethaxsol (100 µg) and sulfamethaxsol-trimethoprim (25 µg), while the most effective antibiotic was florfenicol (30 µg). has been observed. The average antibiotic zone diameters of florfenicol (30 µg) for Aeromonas hydrophila, Lactococcus garvieae and Yersinia ruckeri bacteria were determined as 31.0 mm, 23.0 mm and 30.0 mm, respectively. Among the bacteria, Y. ruckeri (tetA,sulI and sulII), L. garvieae (floR, ermA, ermB, tetA, tetE, tetM, sulI, sulII and sulIII) and Aeromonas hydrophila (sulII) were determined to carry antibiotic resistance genes with the help of specific primers and PCR bands has been made. In addition, it was determined that endemic O. minutiflorum, O. saccatum and O. bilgeri essential oils had an antimicrobial effect on the studied bacteria, and that O. saccatum oil had less antimicrobial effect than O. minutiflorum and O. bilgeri oil, while O. minutiflorum and O. bilgeri oils had less antimicrobial effects. It has been determined that oil has a strong antimicrobial effect. The minimum inhibition concentration value of endemic Origanum essential oils on A. hydrophila, L. garvieae ve Y. ruckeri bacteria species were determined to be 3.90 µl/mL for O. saccatum oil and 1.90 µl/mL for O. bilgeri and O. minutiflorum oils.
Benzer Tezler
- Batı Akdeniz bölgesindeki bazı süt sığırcılığı işletmelerinde sağımcı hatalarının araştırılması
Investigation of milker faults at some dairy herds enterprisein Western Mediterranean region
TUNÇ DOĞACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiTarım Makineleri ve Teknolojileri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET KAMİL BAYHAN
- Batı Akdeniz bölgesindeki sıçrayan örümcekler (Araneae:Salticidae) üzerine faunistik ve sistematik araştırmalar
The faunistic and systematic studies on the jumping spiders (Araneae:Salticidae) of the West Mediterranean region
HATİCE BÜTÜNER
- Batı Akdeniz bölgesindeki Pinus nigra arn. ve Abies cilicica car. taksonlarında dendrokronolojik araştırmalar
Başlık çevirisi yok
ÜNAL AKKEMİK
Doktora
Türkçe
1997
Ormancılık ve Orman Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiOrman Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. İSMET ŞANLI
- Batı Akdeniz bölgesindeki akarsuların çeşitli olasılık seviyelerindeki depolama ihtiyaçlarının hesabı
Başlık çevirisi yok
HÜSNÜ DEMİRPENÇE
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
İnşaat MühendisliğiAkdeniz Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİ DOĞAN