İnsan kaynaklı probiyotik mikroorganizma adaylarının izolasyonu ve tüm genom analizleriyle karakterizasyonu
Isolation of probiotic microorganism candidates of human source and characterization by whole-genome analysis
- Tez No: 861903
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZKAN UFUK NALBANTOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Probiyotik, Tüm Genom Dizileme, Biyoinformatik, Genomik, Probiotics, Whole Genome Sequencing, Bioinformatics, Genomic
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoinformatik Sistemler Biyolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 74
Özet
Karmaşık ve dinamik bir mikrobiyal topluluktan oluşan bağırsak mikrobiyotasının, hastalık ve sağlıkta önemli rol oynadığı bilinmektedir. Bağırsak mikrobiyota çalışmaları sağlığa yararlı mikroorganizmalar olan probiyotiklere ilgiyi artırmıştır. Probiyotik kullanımının yaygınlaşması ve probiyotikleri denetleyici ortak bir otoritenin eksikliği güvenlik endişelerini gündeme getirmektedir. Aday probiyotiklerin değerlendirilmesinde hala in vitro yöntemler kullanılmaktadır. In vitro yöntemler zaman alır, masraflıdır ve virulans faktörleri, genom stabilitesi gibi önemli konularda yetersizdir. Ancak yeni nesil dizileme ve biyoinformatik araçlarla yapılacak tüm genom analizleri probiyotik adaylarının karakterizasyonu için yüksek verimli ve düşük maliyetli bir yöntemdir. Yapılan bu tezde insana ait anne sütü ve gaita numunelerinden izole edilmiş beş probiyotik adayı mikroorganizmanın tüm genom analizleriyle karakterizasyonu gerçekleştirildi. Aday mikroorganizmalar taksonomik olarak tanımlandı, risk profilleri ve probiyotik özellikleri in silico olarak tespit edildi. Yapılan analizler iki mikroorganizmanın risk faktörleri taşıdığını bir mikroorganizmanın sorgulanabilir olduğunu ve iki mikroorganizmanın probiyotik potansiyeli taşıdığını gösterdi.
Özet (Çeviri)
The gut microbiota, a complex and dynamic microbial community, is known to play an important role in health and disease. Gut microbiota studies have increased interest in probiotics, which are microorganisms beneficial to health. The widespread use of probiotics and the lack of a common authority to regulate probiotics raise safety concerns. In vitro methods are still used for the evaluation of candidate probiotics. In vitro methods are time-consuming, costly, and inadequate for important issues such as virulence factors and genome stability. However, whole genome analysis with next generation sequencing and bioinformatics tools is a highly efficient and cost-effective method for characterization of probiotic candidates. In this thesis, five probiotic candidate microorganisms isolated from human breast milk and stool samples were characterized by whole genome analysis. Candidate microorganisms were taxonomically identified, and their risk profiles and probiotic properties were determined in silico. Analyses showed that two microorganisms carried severe risk factors, one microorganism was questionable, and two microorganisms had probiotic potential.
Benzer Tezler
- Geleneksel sofralık zeytin ve peynirlerden izole edilen laktik asit bakterilerinin gıda endüstrisinde destek kültür olarak kullanım potansiyellerinin araştırılması
Investigation of the potentials of using lactic acid bacteria isolated from traditional table olives and cheeses as adjunct culture in food industry
MUSTAFA DURAN
Doktora
Türkçe
2023
Gıda MühendisliğiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇİSEM BULUT ALBAYRAK
- İnsan kaynaklı vajen laktik asit bakterilerinin bazı probiyotik özelliklerinin araştırılması
The investigation of some probiotic properties of human resources vagina lactic acid bacteria
ESİN KIRAY
- Kolorektal kanseri hücrelerinin 5-Florourasil (5-FU) duyarlılığı üzerine laktik asit bakteri (LAB) kaynaklı postbiyotik etkisinin araştırılması
Investigation of lactic acid bacteria (LAB) induced postbiotic effect on the sensitivity of colorectal cancer cells to 5-Florouracil (5-FU)
BÜŞRA GÖRGÜN
Doktora
Türkçe
2024
GenetikAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiTranslasyonel Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEYLA DİDEM KOZACI
- Bazı probiyotik bakterilerin gıda kaynaklı patojenlere karşı antimikrobiyal aktiviteleri üzerine bir invitro çalışma
An invitro study on the antimicrobial activities of some probiotic bacterias against food born pathogens
SONNUR YEŞİLLİK
- Gıda kaynaklı laktik asit bakterileri kullanılarak ekzopolisakkarit üretimi
Exopolysaccharide production by using food borne lactic acid bacteria
İLKAY KIRMA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP DİLEK HEPERKAN