Cloning two tomato pathogenesis-related-1 (SlPR-1) genes and generating vectors for their heterologous expression
İki adet domates patojen ilişkili-1 (SlPR-1) genin klonlanması ve heterolog ifadelerinin belirlenmesi için farklı vektörlerin oluşturulması
- Tez No: 863790
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET AYDIN AKBUDAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Gen klonlama, Gene cloning
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Dünya nüfusunun hızlı bir şekilde artması ve meydana gelen iklimsel değişiklikler, tarımsal ürün kalitesini ve verimini düşürmektedir. Bunun neden olduğu beslenme bozuklukları veya yetersiz beslenme gibi sorunlar, bitkilerin maruz kaldığı stres koşulları karşısında geliştirdikleri mekanizmaların detaylı olarak araştırılmasını elzem kılmıştır. Bu mekanizmalarla birlikte stres yanıtında görev alan genlerin tanımlanması ve karakterize edilmesi büyük önem taşımaktadır. Bitki patojen ilişkili proteinler, bitki savunma mekanizmasının temel bileşenlerinden biridir. Biyotik stres yanıtlarına ek olarak abiyotik stres koşulları altında da ifadelerinin arttığı yapılan çalışmalar ile ortaya konmuştur. Ancak, abiyotik stres unsurlarına karşı oynadıkları rollerin henüz belirlenememiş olması literatürde büyük bir eksikliğe neden olmaktadır. Bundan yola çıkarak bu tez çalışmasında, kuraklık stresi altında ifadelerinin arttığı rapor edilen SlPR-1.1 ve SlPR-1.2 genlerinin heterolog ifadelerinin belirlenmesine zemin hazırlamak için farklı vektörler hazırlanmıştır. Genlerin ayrı ayrı pIPKb004 bitki ifade vektörüne klonlanması Gateway klonlama yöntemi ile yürütülürken; iki genin birlikte pGFPGUSPlus bitki ifade vektörüne klonlanması geleneksel klonlama yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. Genlerin belirlenen vektörler içindeki varlığı PCR ve kesim reaksiyonları ile doğrulanmıştır. Elde edilen bitki ifade vektörleri, belirlenen iki genin ayrı ayrı ve birlikte ifadelenmesi sonucu özellikle abiyotik stresler karşısında oluşturacakları stres yanıtlarının tespit edilmesine olanak sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
The rapid increase in the world population and the occurrence of climate changes are diminishing the quality and productivity of agricultural products. Issues such as nutritional disorders or inadequate nutrition arising from these factors make it imperative to thoroughly investigate the mechanisms developed by plants in response to stress conditions. The identification and characterization of genes involved in stress response, along with these mechanisms, are of great importance. Pathogenesis-related proteins are fundamental components of plant defense mechanisms. Studies have revealed that these proteins not only respond to biotic stress but also exhibit increased expression under abiotic stress conditions. However, the roles they play in response to abiotic stress factors have not yet been fully determined, leading to a significant gap in the literature. Based on this, in this thesis study, different vectors have been prepared to facilitate the determination of the heterologous expressions of SlPR-1.1 and SlPR-1.2 genes, reported to be upregulated under drought stress. While the cloning of genes into the pIPKb004 plant expression vector was conducted using the Gateway cloning method individually, the cloning of the two genes into the pGFPGUSPlus plant expression vector was carried out using traditional cloning methods. The presence of genes within the designated vectors was confirmed through PCR and restriction digestion reactions. The obtained plant expression vectors will enable the detection of stress responses, especially under abiotic stresses, resulting from the separate and combined expression of the two genes.
Benzer Tezler
- Batı Akdeniz bölgesi domates üretim alanlarında domates kloroz virüsü (Tomato Chlorosis Virus; ToCV)'nün biyolojik ve moleküler karakterizasyonu
Molecular chracterization and biological of tomato chlorosis virus (ToCV) in tomato production areas in Western Mediterranean region
NEVİN AKDURA
Doktora
Türkçe
2011
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BAYRAM ÇEVİK
- MECHANISM OF ENDOSPERM DEVELOPMENT IN TOMATO (Solanum lycopersicum)
Domateste endosperm gelişme mekanızması
RENCY TOMY PULICKAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Ege ÜniversitesiTohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BİRSEN ÇAKIR AYDEMİR
- miRNA'ların CRISPR sistemi kullanılarak susturulmasıyla kuraklığa tolerant domates bitkisinin geliştirilmesi
Development of drought tolerant tomato plants by knocking-out miRNAs using CRISPR system
NOURAIZ AHMED TANVEER
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSA KAVAS
- Begomovirus grubuna karşı CRISPR/Cas9 teknolojisiyle transgenik olmayan dayanıklı domates çeşidi geliştirme
Development of a transgene-free resistant tomato variety to begomoviruses
KÜBRA YILDIZ
- Mikrobiyal gübre hazırlanmasında kullanılabilecek bakterilerin eldesi ve etkinliklerinin laboratuvar ve sera ölçeğinde araştırılması
Determination of bacteria that can be used in microbial fertilizer preparation and investigation of activities in laboratory and greenhouse scale
YASEMİN KEVSER ÖZCAN
Doktora
Türkçe
2020
MikrobiyolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ÇABUK