Nörodejeneratif mekanizmaların başlangıcının 5XFAD transgenik alzheimer hastalığı fare modelinde proteomik yöntemlerle araştırılması
Proteomic investigation of neurodegenerative mechanisms in neonatal 5XFAD transgenic alzheimer's disease mouse model
- Tez No: 872519
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET TARIK BAYKAL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 134
Özet
Alzheimer hastalığı (AH), belirgin hafıza eksikliği ile unutkanlığa neden olan, çeşitli moleküler patolojilerle karakterize ve yaşlı nüfusunda en sık görülen ilerleyici bir hastalıktır. Hastalık tanısından önce mevcut olan patoloji, klinik semptomlarla oldukça ilişkilidir. Bu ilişki, hastalığın çeşitli evrelerinde, özellikle beyin dokusu üzerinde proteomik ve metabolomik temelli çalışmalarla incelenmiştir. Ancak hastalığın yenidoğan evresi kadar erken dönemini hedefleyen ve başlangıç noktasında moleküler seviyede ne gibi değişimler olduğunu aydınlatmaya yönelik çalışmalar literatürde bulunmamaktadır. Bu tez çalışmasında, yenidoğan 5xFAD AH fare modeli beynindeki proteomik ve ayrıca metabolomik değişimlerin bölgesel olarak incelenmesi ve hastalığın erken evredeki moleküler izlerinin ortaya çıkarılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, yenidoğan 5xFAD beyin dokusundaki proteomik değişiklikler MALDI-MSI, metabolomik değişiklikler ise DESI-MSI yöntemi ile incelenmiştir. MALDI-MSI ve DESI-MSI analizleri sonucunda tanımlanan protein ve metabolitler literatür yardımıyla AH ile ilişkilendirilmiştir. Çalışmanın diğer bir basamağında, nörodejenerasyonda“Seyirci Etkisi”olarak isimlendiren faktörün erken nörodejenerasyon kavramındaki rolünün araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, yenidoğan 5xFAD transgenik ve kontrol fare beyinleri korteks, serebellum ve hipokampüs bölgelerine ayrılarak ko-kültür çalışmaları yapılmış ve doğuştan hasarlı olduğu düşünülen 5xFAD hücrelerinin, kontrol hücreleri üzerindeki nörodejeneratif etkisi LC-MS/MS proteomik analizler ile araştırılmıştır. Sonuç olarak elde edilen bulgular, hastalığın erken moleküler mekanizmalarının ortaya çıkarılmasının AH'nin patogenezini daha iyi anlamak için büyük önem taşıdığını göstermektedir. Ayrıca, AH'nin doğum kadar erken dönemde var olabileceği ve beynin hasara karşı daha savunmasız olduğu yaşlılık döneminde ortaya çıkabileceği ve bazı moleküllerin yenidoğan AH beyninde nörodejeneratif öncüler olabileceği fikrini desteklemektedir.
Özet (Çeviri)
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder characterized by memory loss that mainly affects the elderly population. The pathology present before the diagnosis is highly correlated with clinical symptoms. This relationship has been studied at various stages of the disease, particularly through proteomic and metabolomic-based studies on brain tissue. However, there are no studies in the literature that focus on the neonatal stage of the disease to elucidate the molecular changes that occur at the onset of the disease. This study aims to investigate the spatial proteomic and also metabolomic changes in the brain of the neonatal 5xFAD AD mouse model and to uncover the molecular traces of the disease in its early stages. For this purpose, proteomic changes in the neonatal 5xFAD brain tissue were investigated by MALDI-MSI, and metabolomic changes were examined by DESI-MSI analyses. The proteins and metabolites identified by MALDI-MSI and DESI-MSI analyses were associated with AD according to the literature. Another aim of this study is to investigate the role of the“Bystander Effect”in early neurodegeneration. For this purpose, co-culture studies were performed by separating the cortex, cerebellum, and hippocampus regions of neonatal 5xFAD transgenic and control mouse brains. The neurodegenerative effect of 5xFAD brain cells, presumed to be congenitally damaged, on control cells was investigated by LC-MS/MS analyses. The results indicate that elucidating the early molecular mechanisms of AD is crucial for a better understanding of its pathogenesis. These findings support the idea that AD may exist as early as birth and appear in old age, when the brain is more vulnerable to damage, and that some proteins are neurodegenerative presages in the neonatal AD brain.
Benzer Tezler
- EIF2 alfa fosforilasyonu üzerinden gerçekleşen ökaryotik translasyonel kontrol mekanizmasına yeni ilaç etken maddelerinin etkisinin proteom ebadında araştırılması
Investigation of new pharmaceutical active molecules on eukaryotic translational control mechanisms through EIF2 alpha phosphorylation by proteomic tools
SELEN PEKER
Doktora
Türkçe
2016
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA DUYGU ÖZEL DEMİRALP
- Akut migren atağında serum neopterin düzeylerinin değerlendirilmesi
Evaluation of serum neopterin levels in acute migraine attack
VAHİDE ASLANKOÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Acil TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASIM KALKAN
- Dirençli obsesif kompulsif bozukluk hastalarında beyin kaynaklı nörotrofik faktör ve sitokin düzeylerinin prognostik değerleri
Başlık çevirisi yok
SHAFIGA MURSALOVA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
PsikiyatriBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiRuh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. İSMET KIRPINAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ FATMA AKYÜZ KARACAN
- Koku bozukluğu oluşturulan sıçanlarda alfa melanosit stimulan hormonun koku alma mekanizmalarına ve tedaviye etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of alpha melanocyte stimulating hormone on olfactory mechanisms and treatment in rats with induced olfactory dysfunction
OĞUZHAN EKİCİ
Doktora
Türkçe
2024
Fizyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖNÜL ŞİMŞEK
- 'C6 glioma hücrelerinde histon deasetilaz inhibitörlerinin ve sinir büyüme faktörü'nün rolü'
'The role of nerve growth factor and histone deacetylase inhibitors in C6 glioma cells'
SEVİNÇ NARİN