Denizel ekosistemlerde DNA temelli biyoizleme uygulamalarının zooplankton türleri için sınanması
Assessing DNA-based biomonitoring applications in marine ecosystems on zooplankton species
- Tez No: 873176
- Danışmanlar: PROF. DR. MELEK İŞİNİBİLİR OKYAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Çevre Mühendisliği, Biology, Biotechnology, Environmental Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Deniz ve İçsu Kaynakları Yönetimi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Deniz Biyolojisi Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 174
Özet
Sekanslama teknolojilerinin sürekli gelişimiyle DNA tabanlı yaklaşımlar denizel ekosistemleri hedef alan biyoçeşitlilik çalışmalarında sıklıkla kullanılır olmuştur. Bu tez çalışmasında Marmara Denizi'nde 2021 sonbaharı - 2022 yazı boyunca gözlenen müsilaj olayı sırasında altı farklı lokasyondan topladığımız müsilaj örneklerine ve beş farklı lokasyondan topladığımız deniz suyu örneklerine çevresel DNA metabarkodlama yaklaşımını uyguladık. Bulgularımız, hem müsilajlı agregatlardan çok çeşitli organizmalardan oluşan müsilajın topluluk bileşimini tahmin etmede hem de deniz suyunda eDNA metabarkodlama tekniğinin etkinliğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Recently, the utilization of sequencing technologies has led to the frequent use of DNA-based techniques in research on marine ecosystems. This study applied the environmental DNA metabarcoding method to mucilage samples collected from six locations and seawater samples collected from five different locations during a mucilage event observed in the Marmara Sea from autumn 2021 to summer 2022. Our results demonstrate the efficacy of the eDNA metabarcoding approach in predicting the community composition of mucilage, which is composed of a diverse array of organisms from mucilaginous aggregates and seawater.
Benzer Tezler
- Denizel ortamlarda plastiklerin parçalanma süreçlerini hızlandıracak bir kütinolitik esteraz enziminin fonksiyonel metagenomik yöntemlerle keşfi
Discovery of a cutinolytic esterase enzyme, which accelerate biodegradation of plastics, by functional metagenomic methods
FATMA ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALİ OSMAN ADIGÜZEL
- Manila kum midyesi (Ruditapes philippinarum) kullanılarak civa (Hg) alımında mikroplastiklerin rolünün araştırılması
Investigation of role of microplastics on mercury uptake using by manila clam (Ruditapes philippinarum)
ERCAN SIKDOKUR
- İstanbul Boğazı'nda tanker kazaları ile oluşabilecek petrol dağılımının simülasyonu
Simulation of oil spill after tanker accident at İstanbul Strait
ERSAN BAŞAR
Doktora
Türkçe
2003
Çevre MühendisliğiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBalıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERCAN KÖSE
- Çoklu stresin denizkestanesi arbacia lixula üzerindeki etkilerinin çok disiplinli olarak araştırılması
Multidisciplinary investigation of the effects of multiple stress on the sea urchin arbacia lixula
BERNA ŞAHİN
- Analysis of the lower trophic level of the Black Sea ecosystem after Mnemiopsis leidyi outburst
Karadeniz ekosisteminin alt enerji seviyesinin Mnemiopsis leidyi patlaması sonrası analizi
NUSRET SEVİNÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
Deniz BilimleriOrta Doğu Teknik ÜniversitesiFiziksel Oşinografi ve Deniz Biyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TEMEL OĞUZ
YRD. DOÇ. DR. BARIŞ SALİHOĞLU