Geri Dön

Production of nanobodies targeting il-1R1

İnterlökin-1 reseptörünü hedefleyen nanokorların üretimi

  1. Tez No: 885452
  2. Yazar: GİZEM ÇİLE
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ARZU ÇELİK FUSS
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Allerji ve İmmünoloji, Allergy and Immunology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 118

Özet

IL-1R1, IL-1 ailesi reseptörlerinin bir üyesi olup, doğal bağışıklık ve enflamasyonun düzenlenmesinde önemli roller oynar. IL-1α ve IL-1ꞵ , IL-1R1'in ligandları olup, ateşin indüklenmesi, lenfositlerin proliferasyonunun uyarılması ve pro-inflamatuar sitokinlerinin salgılanması gibi çeşitli enflamatuar tepkilerde rol oynarlar. IL-1 sinyalindeki düzensizlikler enflamatuar hastalıklara yol açar ve genellikle Canakinumab, Anakinra ve Rilonacept gibi IL-1 inhibitörleri tedavi amaçlı kullanılır. Bu tedaviler hastalık belirtilerinin hafifletilmesinde etkili olmakla beraber bazı sınırlamalara sahiptir. Nanokorlar, sadece ağır zincirden oluşan antikorların değişken fragmanlarından elde edilir. Küçük boyutları, yüksek afiniteleri, stabiliteleri ve çözünürlükleri gibi özellikleri nedeniyle diğer IL-1 inhibitörlerine alternatif olabilirler. Bu yüzden bu çalışma anti-enflamatuar ajanlar olarak anti-IL-1R1 nanokorları üretmeyi amaçlamıştır. Bu doğrultuda iki farklı strateji izlenmiştir: IL-1R1'e yüksek affinite ile bağlandığı tahmin edilen bir nanokorun gen sentezinin yapılması ve immünize edilmiş lamalardan elde edilen nanokorların üretimi. Gen sentezi başarılı olmasına rağmen, bakteride nanokorun ifadesi sağlanamamıştır. Ancak, immünize edilen lamalardan elde edilmiş olan nanokorlar başarılı bir şekilde saflaştırılmış ve karakterize edilmiştir. IL-1R1'e yüksek affinite ile bağlanan ondan fazla nanokor tespit edilmiş ve içlerinden 3WEB23 ve 2TED12 nanokorlarının hücre kültüründe IL-1R1'i etkili bir şekilde inhibe ettiği gözlemlenmiştir. Bu nanokorlar, enflamatuar hastalıklara karşı umut verici terapötik adaylardır, ancak in vivo fonsiyonelliklerinin daha fazla araştırılması gerekmektedir. Epitop gruplaması (epitope binning) deneylerinde, bu iki aday nanokorların bağlanma kapasitelerinin diğer yüksek affiniteli nanokorlar tarafından engellenmediği gözlemlenmiştir. Bu yüzden epitop gruplaması deneyleri nanokorların multivalent nanokor üretiminde kullanılmasını desteklemektedir. Genel olarak, bu çalışma inflamatuar hastalıklar için alternatif terapötik adaylar olarak iki anti-IL-1R1 nanokoru belirlemiştir.

Özet (Çeviri)

IL-1R1, a member of the IL-1 receptor family, is essential for innate immunity and regulation of inflammation. IL-1α and IL-1ꞵ are the ligands of IL-1R1 and have various roles in the inflammatory response, such as induction of fever, stimulation of T and B cell proliferation, and pro-inflammatory cytokine secretion. Dysregulation in IL-1 signaling leads to inflammatory diseases which are generally treated with Canakinumab, Anakinra or Rilonacept. Despite their effectiveness in causing remission of disease symptoms, these drugs still have limitations. Nanobodies, derived from variable fragments of heavy-chain-only antibodies, offer promising alternatives due to their small size, high affinity, stability, and solubility. Regarding advantageous properties of nanobodies in therapeutic applications, this study aimed to develop anti-IL-1R1 nanobodies as potential anti-inflammatory agents. Two strategies were employed: synthesis of a synthetic nanobody gene against IL-1R1 and production of anti-IL-1R1 nanobodies derived from immunized llamas. Although the nanobody gene synthesis was successful, its expression in bacteria was not possible. On the other hand, purification and characterization of the nanobodies from the immune library identified over ten candidates with high affinity to IL-1R1. Among them, 3WEB23 and 2TED12 effectively inhibited human IL-1R1 in cell culture. These two nanobodies are promising therapeutic candidates against inflammatory diseases but their in vivo functionality needs further investigation. To enhance inhibitory activities, developing a multivalent nanobody can be considered. Epitope binning experiments confirmed that the binding capability of these two candidate nanobodies were unaffected by any other high affinity nanobodies, supporting their potential use in multivalent nanobody production. Overall, this study identified two anti-IL-1R1 nanobodies as alternative therapeutic candidates for inflammatory diseases.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    749780

    Investigation of the interaction and oligomerization of HIV capsid and single domain antibody as a biotechnological drug against HIV

    HİV'e karşı biyoteknolojik ilaç olmak üzere HİV kapsit ve tek bölgeli antikorun etkileşimi ve oligomerizasyonun incelenmesi

    SENİHA GÜNEY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HÜMEYRA TAŞKENT SEZGİN

  2. Tez No

    80919

    Alfa-1 proteaz inhibitorlerine yönelik antikor üretimi ve iki farklı immünoassay ortamında alfa-1 proteaz inhibitörünün düzeyinin belirlenmesinde kullanımı

    Production of antibody against alpha-1 proteinose inhibitor and using for determination level of alpha-1 proteinose inhibitor in two different immunoassay medium

    OYA ORTAPAMUK ÖZDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    BiyokimyaHacettepe Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİLGÜN SÜMER

  3. Tez No

    82265

    Afyon yöresi harman tuğlacılığı ve bu yöntemin sanatsal alanda kullanımı

    Production of field brickiu Afyon region and using of this method at fiue arts area

    ABİDİN ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Güzel SanatlarMarmara Üniversitesi

    Seramik ve Cam Ana Sanat Dalı

    PROF. DR. GÜNGÖR GÜNER

  4. Tez No

    82522

    Production of microtubers in potato (Solanum tuberosum l.)

    Patateste mikrotüber üretimi (Solanum tu berosum l.)

    SEVGİ BEYAZOVA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM

  5. Tez No

    82558

    Production of Cu-based shape memory alloys by powder metallurgy

    Bakır esaslı şekil bellekli alaşımların toz metalurjisi yöntemiyle üretimi

    ARCAN FEHMİ DERİCİOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Metalurji MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BİLGEHAN ÖGEL

Geri Dön