NF-κB ilişkili Covid-19 patogenetizinin hastalık şiddetine olan etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of NF-κB-related Covid-19 pathogenesis on disease severity
- Tez No: 887178
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF SİBEL ASLAN, DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜVEN YENMİŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Allerji ve İmmünoloji, Genetics, Medical Biology, Allergy and Immunology
- Anahtar Kelimeler: COVID 19, Moleküler genetik, Nükleer faktör-kappa B, SARS virüsü, İnflamasyon, COVID 19, Molecular genetic, Nuclear factor-kappa B, SARS virus, Inflammation
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Biruni Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
COVID-19, SARS-CoV-2 virüsü tarafından tetiklenen solunum yolu hastalığıdır. Hastalığın patogenezinde, SARS-CoV-2'ye ait proteinler, NF-κB sinyal yolağının aktifleşmesine neden olan ateşleyici sinyal görevi görmektedir. NF-κB ilişkili COVID-19 patogenezinin hastalık şiddetine olan etkisini incelediğimiz çalışmadaki amacımız, NF-κB sinyal yolunun, SARS-CoV-2 enfeksiyonuna bağlı bağışıklık yanıtta nasıl bir rol oynadığını ve ACE2, CD147, TLR2, TLR4, miRNA'lar ve şimdiye kadar yapılan çalışmalarda öne çıkan sitokinler (IL-1B, IL-2, IL-6, IL-8, IL-10 ve IL-17) ile olan etkileşimlerinin COVID-19 hastalığının patogenezinde ve klinik seyirdeki rolünü detaylı bir şekilde değerlendirmektir. Çalışmaya, COVID-19 PCR testi pozitif ve asemptomatik, semptomatik ve yoğun bakım desteği gören olmak üzere üç gruba ayrılmış hastalar dahil edilmiştir. Hastalardan toplanan serum örneklerinde NF-κB, IL-1, IL-2, IL-6, IL-8, IL-10 ve IL-17F aktivitesi ELISA yöntemiyle ölçüldü. Aynı hasta gruplarından toplanan kan örneklerinde ise, NF-κB, ACE2, CD147, TLR2, TLR4, miR122 ve miR146a genlerinin ekspresyon düzeyleri gerçek zamanlı polimeraz zincir tepkimesi yöntemi ile belirlendi. Yoğun bakım hastalarında TLR4 ekspresyon düzeyi medyanının, asemptomatik ve semptomatik gruplara kıyasla anlamlı düzeyde düşüş (p= 0.0241); semptomatik grupta NF-κB ekspresyon düzeyleri ile ACE2, CD147, TLR4 ekspresyon düzeyleri arasında anlamlı pozitif ilişkiler (sırasıyla, p<0,0001, p= 0.038 ve p=0.026) ve miR-146a ve miR-122 ekspresyon düzeyleri arasında anlamlı negatif ilişkiler (p<0,0001); yoğun bakım grubunda NF-κB ekspresyon düzeyleri ile ACE2 ve CD147 ekspresyon düzeyleri arasında anlamlı pozitif ilişkiler (p<0,05) ve miR-146a ve miR-122 ekspresyon düzeyleri arasında anlamlı negatif ilişkiler tespit edildi (P<0,0001). Semptomatik grupta NF-κB ekspresyon düzeyi ile IL-1β ve NF-κB serum konsantrasyonları arasında (sırasıyla p= 0.04 ve p<0,0001); yoğun bakım grubunda ise NF-κB ekspresyon düzeyleri ile IL-1β ve NF-κB konsantrasyonları arasında (sırasıyla, p=0,044 ve p<0,0001) ve IL-2, IL-6, IL-8 ve IL-10 serum konsantrasyonları arasında anlamlı pozitif ilişkiler tespit edildi (p<0,05). Elde ettiğimiz veriler, NF-κB'nin dahil olduğu inflamatuvar sürecin COVID-19'un patogenezinde kritik bir rol oynadığını göstermektedir. Buna göre, NF-κB, COVID-19 patogenezi sırasında diğer moleküllerle etkileşime girerek immün sistemi düzenlemektedir.
Özet (Çeviri)
COVID-19 is a respiratory illness triggered by the SARS-CoV-2 virus. SARS-CoV-2 proteins act as inflammatory signals, triggering the activation of the NF-κB signaling pathway, a key regulator of inflammatory responses. This study delves into the intricate relationship between the NF-κB signaling pathway and COVID-19 pathogenesis. Our primary objective is to comprehensively examine the role of NF-κB in the immune response to SARS-CoV-2 infection and its interactions with ACE2, CD147, TLR2, TLR4, miRNAs, and prominent cytokines (IL-1β, IL-2, IL-6, IL-8, IL-10, and IL-17) identified in previous studies. The study included patients divided into three groups: COVID-19 PCR test positive and asymptomatic, symptomatic, and requiring intensive care unit support. The activity of NF-κB, IL-1b, IL-2, IL-6, IL-8, IL-10, and IL-17F was measured in serum samples collected from the patients using the ELISA method. The expression levels of the NF-κB, ACE2, CD147, TLR2, TLR4, miR122, and miR146a genes were determined in blood samples collected from the same patient groups using the real-time polymerase chain reaction method. The median expression level of TLR4 was found to be significantly lower in intensive care unit patients compared to the asymptomatic and symptomatic groups (p=0.0241). When the correlations between NF-κB expression level and other mRNA levels were examined, significant positive relationships were found between NF-κB expression level and CD147 and TLR2 expression level in asymptomatic patients (p<0.05). In the symptomatic group, significant positive relationships were found between patients' NF-κB expression level and ACE2, CD147, and TLR4 expression levels (p<0.0001, p=0.038, and p=0.026, respectively), and significant negative relationships were found between NF-κB expression level and miR-146a and miR-122 expression levels (p<0.0001). In the intensive care unit group, significant positive relationships were also found between NF-κB expression level and ACE2 and CD147 expression levels (p<0.05), and significant negative relationships were found between NF-κB expression level and miR-146a and miR-122 expression levels (p<0.0001). In the symptomatic patient group, significant positive relationships were found between NF-κB expression level and IL-1β and NF-κB serum concentrations (p=0.04 and p<0.0001, respectively). Significant positive relationships were also found between NF-κB expression levels and IL-1β and NF-κB concentrations in intensive care unit patients (p=0.044 and p<0.0001, respectively). Significant positive relationships were also found between NF-κB expression levels and IL-2, IL-6, IL-8, and IL-10 serum concentrations in intensive care unit patients (p<0.05). The findings of this study indicate that NF-κB plays a critical role in the pathogenesis of COVID-19. NF-κB seems to regulate the immune system by interacting with other molecules during COVID-19 pathogenesis.
Benzer Tezler
- 1,3-difenil-4,5-bis(hidroksiimino)-imidazolidin ve Ni(II), Cu(II), Pd(II), UO2(VI) komplekslerinin sentezi
Başlık çevirisi yok
VEFA AHSEN
Doktora
Türkçe
1984
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZER BEKAROĞLU
- Bir pamuk iplikhanesinde fiili çalışma metodlarının incelenmesi ve mevcut işlemlerin standart sürelerinin saptanması
Başlık çevirisi yok
MÜRŞİDE KESEROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
İşletmeEge ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA NAZMİ ERCAN
- Türkiye trafik düzeninde kazaların azaltılması açısından yeni trafik kanunu uygulaması ile ilgili sorunlar ve çözüm yolları
Başlık çevirisi yok
ERDAL UÇAR
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
UlaşımGazi ÜniversitesiKazaların Çevresel ve Teknik Araştırması Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. RIDVAN EGE
- Tekstil işletmelerinin çevre kirlenmelerine etkileri
Başlık çevirisi yok
REMZİ GEMCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Tekstil ve Tekstil MühendisliğiUludağ ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET TASMACI