Terapötik peptit tilapia piscidin 4' ün (TP4) pichia pastoris ekspresyon sisteminde rekombinant üretimi ve HT-29 kolorektal kanser hücreleri üzerine etkisinin araştırılması
Recombinant production of therapeutic peptide tilapia piscidin 4 (TP4) in pichia pastoris expression system and investigation of its effect on HT-29 colorectal cancer cells
- Tez No: 889189
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET KUZUCU, DOÇ. DR. MERT KARAOĞLAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Bioengineering, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erzincan Binali Yıldırım Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 102
Özet
Tilapia piscidin 4 (TP4), Nil Tilapyası (Orechromis niloticus) balıklarının bağışıklık sisteminde yer alan ve yüksek antimikrobiyal aktiviteye sahip katyonik bir peptittir. Antimikrobiyal özelliğinin yanı sıra yara iyileştirici ve antikanser özellikleri dahil olmak üzere çeşitli biyolojik özelliklere sahiptir. Tez çalışması kapsamında, TP4 peptitinin kodon optimizasyonlu dizisi, Pichia pastoris KM71H ekspresyon sisteminde güçlü ve indüklenebilir AOX1 promotörünü içeren pPICZA vektörü kullanılarak eksprese edilmiştir. Rekombinant TP4 peptiti, Ni-NTA afinite kromatografisi ile saflaştırılmış ve antibakteriyel aktivitesi MİK ve MBK yöntemleri ile doğrulanmıştır. TP4, HT-29 kolon kanseri ve HGF-1 sağlıklı dişeti fibroblast hücrelerine uygulanarak hücrelerdeki sitotoksik etkiler MTT, TAS-TOS, MDA yöntemleri ile apoptozda yer alan genler (BAX, BCL-2, CASP3) ve proteinlerin ekspresyon düzeyleri ise RT-qPZR ve ELISA yöntemleri kullanılarak araştırılmıştır. Bu tez kapsamında rekombinant TP4'ün insan HT-29 hücre hattında güçlü antikanser aktiviteye sahip olduğu ilk kez gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
Tilapia piscidin 4 (TP4), a cationic peptide with high antimicrobial activity, is part of the immune system of Nile Tilapia (Oreochromis niloticus). In addition to its antimicrobial properties, it has various biological significances, including wound healing and anticancer properties. In the scope of this thesis, the codon-optimized sequence of the TP4 peptide was expressed in the Pichia pastoris KM71H expression system under the pPICZαA expression vector, which includes the strong and inducible AOX1 promoter. Recombinant TP4 peptide was purified by Ni-NTA affinity chromatography and its antibacterial activity was confirmed by MIC and MBC methods. TP4 was applied to HT-29 colon cancer and HGF-1 healthy gingival fibroblast cells and cytotoxic effects on the cells were investigated by MTT, TAS-TOS, MDA methods and the expression levels of genes (BAX, BCL-2, CASP3) and proteins involved in apoptosis were investigated by RT-qPCR and ELISA methods. In this thesis, it was shown for the first time that recombinant TP4 has strong anticancer activity in human HT-29 cell line.
Benzer Tezler
- Mikroakışkan sistem ile protein yüklü polimerik nanopartiküllerin üretimi ve karakterizasyonu
Production and characterization of protein loaded polymeric nanoparticles by microfluidic system
AYŞENUR BEZELYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BERRİN KÜÇÜKTÜRKMEN
- Isolation of bacterial secondary metabolites from the new actinomycetes producing bioactive peptides and in silico studies
Bakteriyel ikincil metabolitlerin biyoaktif peptit üreten yeni aktinomisitlerden izolasyonu ve in siliko çalışmaları
MOHAMMED ALSAMARAI
Doktora
İngilizce
2024
Tıbbi BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiNanobilim ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER ANDAÇ
- Determination of therapeutic effects of multifunctional antibody and peptide micelle-based nanocarriers on breast cancer cells
Çok fonksiyonlu antikor ve peptit misel nanotaşıyıcılarının meme kanseri hücreleri üzerindeki terapötik etkilerinin belirlenmesi
NUSAIBAH ABDULSALAM ABDULHAD ABDULHADI
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Prof. Dr. YUSUF BARAN
- Knock out of GSH2 gene and production of γ-GC in nicotiana benthamiana leaves with Cas9 vector/cell penetrating peptide complex
Cas9 vektörü/hücreye nüfuz eden peptit kompleksi ile nicotiana benthamiana yapraklarinda GSH2 geninin knock out edilmesi ve γ-GC üretimi
OĞUZHAN YAPRAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiBaşkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEYHUN KAYIHAN
- Tip 1 diyabetik deneklerde lentivirus aracılı vazoaktif intestinal peptit gen naklinin terapötik etkinliğinin belirlenmesi
Therapeutic efficacy of lentivirus mediated vasoactive intestinal peptide gene delivery in type 1 diabetes
FULYA ERENDOR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Tıbbi BiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH ŞANLIOĞLU