Geri Dön

Generation of nanobody based chimeric antigen receptor constructs against CD19 positive B cell lymphomas

CD19 pozitif B hücreli lenfomaya karşi nanokor temelli kimerik antijen reseptör modellerinin geliştirilmesi

  1. Tez No: 898758
  2. Yazar: BÜŞRA ŞİMŞEK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET SELİM ÇETİNER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Sabancı Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 194

Özet

CAR-T hücre terapisi, refrakter ve nükseden B hücreli malignitelerin tedavisinde kullanılmak üzere CD19'u hedefleyen dört farklı ürünün FDA tarafından onaylanmasıyla birlikte en umut verici immünoterapi tekniklerinden biri haline gelmiştir. Bu terapilerin tümünde ligand bağlanma bölgesi olarak scFv kullanılmıştır. Ancak scFv'li CAR yapısının büyük boyutu, yüksek düzeyde immünojenitesi, membran üzerinde çökelerek ligand bağımsız reseptör aktivasyonuna sebep olması dolayısıyla terapötik etkinliği azalttığı gösterilmiştir. Nanokorlar, benzer bağlanma potansiyelleri, daha yüksek stabilite ve solubilite sağlamaları ve daha az immunojenisiteye sebep olmaları sayesinde scFv'lere alternatiftir. Bu çalışmada, B hücreli malignitelerin tedavisinde kullanılmak üzere nanokor temelli CAR tasarımlarının geliştirilmesi hedeflenmiştir. İlk adımda hem sentetik maya ve hem de immün faj nanokor kütüphanesi kullanılarak CD19 hedefli nanokor seçimi yapılmıştır. İmmün faj kütüphanesiyle CD19'u hedefleyen 40'tan fazla farklı nanokor elde edilmiştir. İkinci adımda, ikinci nesil CAR tasarımları baz alınarak nanokor temelli yeni bir CAR yapısı tasarlanmıştır. Bu tasarım, scFv temelli tasarım ile benzer yüzey ifadesini veren versiyonun seçilmesi yoluyla elde edilmiştir. Üçüncü adımda, seçilen anti-CD19 nanokorları, yeni tasarlanan CAR yapısı içerisinde Jurkat-Raji ko-kültür deneyleri ile bağlanma ve aktivasyon potansiyelleri açısından değerlendirilmiştir. Tüm bu çalışmalar sonucunda, JurkatT hücresi yüzeyinde başarılı bir şekilde ifade edilen ve insan CD19 transmembran proteinine bağlandığında T hücrelerinin aktive olması sağlayan çok sayıda CD19 spesifik nanokor temelli CAR yapısı elde edilmiştir.

Özet (Çeviri)

Thanks to its therapeutic potential, CAR-T cell therapy became one of the most promising immunotherapy techniques with the approval of four different CD19 targeting CAR-T cell products by the FDA for the treatment of refractory and relapsed B-cell malignancies. However, all these therapies were developed using scFv as a ligand binding domain, shown to decrease therapeutic efficacy due to its large size, high level of immunogenicity and propensity for self-aggregation on the membrane leading to ligand independent activation. Nanobodies are promising alternatives to scFv, based on their comparable binding potential, higher stability and solubility, and lower immunogenicity. In this study, we aimed to develop novel nanobody-based anti-CD19 CAR constructs to be used in the treatment of B-cell malignancies. In the first step, we performed nanobody selection using two different libraries: synthetic yeast display and immune phage display libraries, the latter yielded more than 40 different nanobodies targeting CD19. In the second step, we generated a nanobody-based CAR construct using the second-generation CAR design, achieving comparable surface expression to scFv-based CAR. In the third step, we evaluated the selected anti-CD19 nanobodies in terms of binding and activation potentials within the newly designed CAR construct in Jurkat-Raji co-culture experiments. In summary, we obtained numerous CD19 specific CAR constructs that were successfully expressed on the Jurkat T cell surface and resulted in activation upon specific CD19 binding.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    888291

    Computational investigation of allostery in nanobody – antigen complexes

    Nanokor – antijen komplekslerindeki alosterinin hesaplamalı incelenmesi

    NURŞAH HALİSDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ARZU UYAR

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HÜMEYRA TAŞKENT SEZGİN

  2. Tez No

    84578

    Dönel makine elemanları için iges tabanlı Cnc parça programının üretilmesi ve grafik simülasyonu

    Generation of CNC part programs for rotational machine components besed on IGES format

    METİN ATALAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Makine MühendisliğiSelçuk Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SÜLEYMAN YILDIZ

  3. Tez No

    75713

    Generation of rainfall using disaggregation models

    Parçalara ayırma modelleri kullanılarak yağış miktarı üretilmesi

    ALİ İHSAN MARTI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    İnşaat MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UYGUR ŞENDİL

  4. Tez No

    75741

    Generation of flexible process plans using feature recognition

    Parça elemanları yöntemiyle esnek imalat planlarının oluşturulması

    HAKAN BORAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    Makine MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. S. ENGİN KILIÇ

  5. Tez No

    78093

    Yüksek doğru gerilimli enerji iletim sistemlerinde optimum DGM anahtarlama açılarının yapay sinir ağı ile üretilmesi

    Generation of optimum pulse width modulation switching angles by artificial neural network in high voltage direct current systems

    MUSTAFA FIRAT HANCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEFA AKPINAR

Geri Dön