Şeker pancarında alfa amino azot oranının azaltılması
Reducing alpha amino nitrogen ratio in sugar beet
- Tez No: 909161
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ARSLAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: CRISPR/Cas9, alfa amino N, koline monoksigenaz, transformasyon, şeker pancarı, CRISPR/Cas9, alpha amino N, koline monoksigenaz, transformation, sugar beet breeding
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
Şeker pancarındaki alfa amino N oluşumunun şekerin kristalizasyonunu engelleyerek daha az şeker elde edilmesine neden olmaktadır. Bitki ıslahı çalışmalarında genel olarak verim ve hastalıklara dayanıklılık çalışmalarına odaklanılsa da kalite parametreleri endüstride ürün işleme açısından büyük öneme sahiptir. Bu çalışmada şeker pancarı kalite parametrelerinden biri olan alfa amino N oluşumuna etki eden Betain sentez yolağındaki koline monoksigenaz enzimini CRISPR/Cas9 teknolojisi ile susturarak Betain sentezini engelleyerek alfa amino N oranını düşürmek hedeflenmiştir. Çalışmada iki adet sgRNA ve pFGC-pcoCas9 T-plazmiti kullanılmıştır. sgRNA tasarımında protein dizisinin her iki domaininde mutasyona uğrayabilmesi için birinci ekzon bölgesinden tasarlanmıştır. Şeker pancarında direkt rejenerasyon protokolünün optimizasyonu için üç farklı eksplant ( )ve dört farklı hormon ( ) ile bunların farklı konsantrasyonları denenmiştir. En yüksek rejenerasyon petiyol eksplantında 0.5 cmg/L kinetin + 0.25 mg/L NAA içeren ortamda % 14'lük bir başarı ile belirlenmiştir. Seçici ortam olarak en başarılı rejenerasyon ortamına 50 mg/L kanamisin + 200 mg/L timentin içeren ortam olduğu belirlenmiştir. Bu ortamda Agrobacterium tumafaciens ile yapılan transformasyon sonrası % 2'lik bir rejenerasyon elde edilmiştir. Transformasyon sonrası iki adet rejenere bitkicik elde edilmiştir bunlardan alınan yaprak örneklerinden yapılan dizileme sonrasında dizilerde herhangi bir mutasyonun oluşmadığı tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Alpha amino N formation in sugar beet prevents the crystallization of sugar by causing less sugar to be obtained. Although plant breeding studies generally focus on yield and disease resistance studies, the quality parameters of the products have a great impact on the industrial process. In the current study, it was aimed to prevent the formation of betaine, one of the factors affecting the formation of alpha amino N, one of the quality parameters of sugar beet, by silencing the koline monoksigenaz enzyme in the pathway with CRISPR/Cas9 technology and to reduce the alpha amino N rate. Two sgRNA and pFGC-pcoCas9 T-plasmid were used in the study. In the design of sgRNA, it was designed from the first exon region so that it can be mutated in both domains of the protein sequence. For the optimization of the direct regeneration protocol in sugar beet, three different explant types and four different hormones and their different concentrations were tested. The highest regeneration was determined with a success rate of 14% in the petiole explant containing 0.5 mg/L kinetin + 0.25 mg/L NAA. It has been determined that our most successful regeneration medium as a selective medium is medium containing 50 mg/L kanamycin + 200 mg/L timentin. In this culture, 2% regeneration was achieved after transformation with Agrobacterium tumafaciens. After transformation, two regenerated plantlets were obtained. After sequencing the leaf samples taken from them, it was determined that no mutations occurred in the sequences.
Benzer Tezler
- Erzincan koşullarında bazı şeker pancarı (beta vulgaris l.) çeşitlerinin verim ve kalite özelliklerinin belirlenmesi
Determination of yield and quality characteristics of some sugar beet (beta vulgaris l.) cultivars in Erzincan conditions
İKRAM BAĞCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatBayburt ÜniversitesiOrganik Tarım İşletmeciliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VOLKAN GÜL
- Apiacea familyasına dahil bazı türlerin uçucu yağlarının şeker pancarı (Beta vulgaris var. saccharifera l.)'nda verim ve şeker metabolizmasına etkileri
Root yield and sucrose metabolism of sugar beet (Beta vulgaris var. saccharifera l.) in response to essential oils of some apiaceae species
HAMİDE DAĞLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARİF ŞANLI
- Farklı azot ve fosfor miktarlarının şeker pancarında (Beta vulgaris L. ) kök-gövde verimi ve bazı kalite özelliklerine etkisi
The Effects of various quantities of nitrogen and phosphorus on root-trunk yield and some quality features of sugar beet (Beta vulgaris L. )
TAHSİN ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
ZiraatHarran ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. M. ATİLLA GÜR
- Şeker pancarında sitoplazmik erkek kısır hatların geliştirilmesinde kullanılacak o-tip hatların genetik ve morfolojik karakterizasyonu
Genetic and morphological characterization of o-type breeding lines using for devoloping cytoplasmic male sterile lines in sugar beet
EMİNE DİRİM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ARSLAN
- Topraktan ve yapraktan uygulanan farklı rizobakterilerin şeker pancarında (Beta vulgaris L.) agronomik özelliklere etkisi
The effect of different rhizobacteria applied from soil and leaf on agronomic properties in sugar beet (Beta vulgaris L.)
AKİF BAĞYETİŞTİREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AZİZ ŞATANA