Geri Dön

Kolon kanserlerindeki K-ras ve p53 gen mutasyonlarının DNA dizi analizi yöntemi ile belirlenmesi

Analysis of K-ras and p53 gene mutations in colon cancers by DNA sequencing

  1. Tez No: 91495
  2. Yazar: MUSTAFA AKKİPRİK
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. AYŞE ÖZER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Onkoloji, Tıbbi Biyoloji, Oncology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 1999
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

11 ÖZET Kolon kanserleri birçok genetik değişimin birikimi sonucu oluşmaktadır. Bu genetik değişimler içinde K-ras onkogen mutasyonlan ve bir alleldeki mutasyon sonrası diğer allelin kaybı ile giden p53 tümör baskılayıcı gen değişimlerine oldukça yüksek oranlarda rastlanılmaktadır. Kolon kanserlerinin gelişiminde rol alan genetik mekanizmaların ortaya konması gerek erken tanının sağlanması ve gerekse prognozun belirlenmesi ve buna uygun ilave tedavilerin uygulanmasında moleküler birer belirteç olarak kullanılmalarını sağlayacaktır. Bu tez çalışmasında, kolon kanserlerinde allele özgü oligonükleotid (ASO) hibridizasyonu yöntemi ile saptanan K-ras ve pS3 gen mutasyonlannm doğrulanması ve bu yolla saptanamayanların belirlenmesi amacı ile kolon kanserli hastaların doku örneklerinde DNA dizi analizi yöntemi uygulanmıştır. Çalışmaya alınan 9 kolon kanserli doku örneğinin birinde K-ras kodon 12 (G£T-»GTT) diğerinde (GGT->GAT) olmak üzere toplam 2 örnekte (%22.2) nokta mutasyonu saptanmıştır. Bu doku örneklerinden 8'i p53 mutasyonlan için incelemeye alınmış, bir örnekte kodon 248 (CGG->CAG) diğer bir örnekte ise kodon 175 (CfîC->CTC) olarak toplam 2 örnekte (%25) nokta mutasyon bulunmuştur. Örneklerin birinde K-ras kodon 12 (GüT->GTT) mutasyonu ile p53 kodon 175 (CGC^CAC) mutasyonunun bir arada olduğu gözlenmiştir. Ayrıca incelenen örneklerde K-ras kodon 13 ve p53 kodon 249 mutasyonlanna rastlanılmamıştır. Elde ettiğimiz bulgular ASO hibridizasyonu sonuçlarım da doğrular niteliktedir.

Özet (Çeviri)

m ABSTRACT Colon cancers occur with accumulations of many genetic alterations. These alterations include mutations, which are seen more frequently, in the K-ras oncogene and concomitant mutations in one allele together with loss of the other allele of p53 tumor suppressor gene. The recent observations in molecular mechanisms of colon carcinogenesis may be useful molecular markers for diagnostic, prognostic, and therapeutic implications of colon cancers. In this study, DNA sequencing analysis was used to confirm the K-ras and p53 gene mutations shown by allele specific oligonucleotide hybridization (ASO) technique and also detect the ones that could not be shown by the latter. Nine colon cancer tissue samples were used in this study. K-ras codon 12 mutations were observed in 2 of 9 (22.2%) samples. These mutations resulted from substitution of the wild-type codon (GGT) by either mutant codon (GTT) or (GAT). In eight of these tissue samples p53 mutations were analyzed. Two p53 mutations (25%) were found in two different samples. The first one was at codon 248 (CGG- » CAG), and the second one was at codon 175 (CGC- >CAC). On the other hand, one of these samples had also mutations for both p53 gene at codon 175 (CGC- >CAC), and K-ras gene at codon 12 (GGT- >GTT). Moreover, K-ras codon 13 and p53 codon 249 mutations were not found in our studies. Our results confirm the ones of ASO hybridization study of the same samples. tC VtiKS&öÖktftlM KÜRDİ*

Benzer Tezler

  1. Kolorektal kanserlerdeki genetik değişimlerin klinik önemi

    Clinical importance of genetic alterations in colorectal cancers

    MUSTAFA AKKİPRİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Göğüs HastalıklarıMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. AYŞE ÖZER

  2. Akciğer tümörlerinde ve cerrahi sınırındaki histopatolojik normal dokularda K-ras geni kodon 12 mutasyonu ve P53 gen mutasyonlarının araştırılması

    Investigation of K-ras codon 12 and p53 gene mutations in tumor tissues and surgical margins of lung cancer

    ÖZGÜR VATAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    BiyolojiUludağ Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. RAHMİ BİLALOĞLU

  3. Çukurova bölgesinde kolorektal kanserli hastalarda K-ras mutasyonu görülme sıklığına bakılarak kanser tedavisinde kullanılan ilaçlara yönelik prediktif biyomarkerlarının kullanılabilirliğinin tespitinin önemi.

    This study aims at the usable of predictive biomarkers fort the medicine used in cancer treatments by detecting the frequency of K ras mutation in patients with cancer in cukurova region.

    BÜLENT KAPTAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    OnkolojiÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELEK KÖKSAL ERKİŞİ

  4. Kolon poliplerinde K-ras mutasyonu sıklığı

    The frequency of K-ras mutation in colon polyps

    TARKAN KARAKAN

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    GastroenterolojiGazi Üniversitesi

    Gastroenteroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞÜKRÜ GIYASETTİN DUMLU

  5. Metastatik kolon karsinomu tanısı almış olan hastalarda kişisel, klinik ve patolojik özelliklerin karşılaştırılması ve uzun sağkalımla ilişkili olup olmadığının değerlendirilmesi

    Comparison of personal, clinical and pathological features in patients with metastatic colon carcinoma and evaluation of whether associated with longer survival

    FERİDE YILMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    OnkolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FAZIL AYDIN