Türkiye'de ectyma contagiosum enfeksiyonunun virolojik yöntemlerle araştırılması ve virus izolasyonu
Investigation of ectyma contagiosum infection by virological methods and virus isolation in Turkey
- Tez No: 941035
- Danışmanlar: PROF. DR. SİBEL YAVRU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Ektima (Orf), Parapoxvirus cinsinin bir üyesi olan ORF virusunun (ORFV) neden olduğu bulaşıcı bir hastalıktır. Küçükbaş ruminantları ve bazen diğer vahşi hayvanları etkileyen hastalık, koyun ve keçilerin yetiştiriciliği yapılan her yerde görülebilmektedir. Bu çalışma Türkiye'de ORFV'nin koyun ve keçi sürülerindeki varlığını, moleküler karekterizasyonunu ve ayrıca virusun hem mihrak içerisinde hem de mihrak dışındaki hayvanlara olan etkisini epidemiyolojik olarak ortaya koymak amacı ile planlandı. Bu çalışmada 14 şehirden (Aydın, Denizli, Elazığ, Iğdır, İzmir, Kars, Manisa, Muğla, Nevşehir, Samsun, Sinop, Sivas, Rize ve Tokat) 22 işletmeden 70 adet materyal (10 lezyonlu doku/ 31 svap/ 18 EDTA'lı kan/11 deri kazıntısı) Real-Time PCR ile test edildi. 70 adet materyalden 45 pozitif, 25 negatif belirlendi. Bu çalışmadan elde edilen bulgulara göre hayvan türlerinin ve yaş gruplarının sonuçlar üzerine anlamlı (p<0.05) bir etkisinin olmadığı tespit edildi. Numune alım şekillerinin Real Time PCR ile yapılan testte nükleik asit varlığının tespitinde anlamlı (p<0.05) sonuçlar verdiği tespit edilmiştir. ORFV genom varlığı belirlenen örnekler, virus izolasyonu için Afrika yeşil maymun (Cercopithecus aethiops) böbrek (Vero) devamlı hücre kültürlerine inokule edildi. ORFV genom varlığı pozitif olan, ayrıca Vero devamlı hücre kültürlerinde izole edilip, Real Time PCR ile identifiye edilen örneklerin moleküler karekterizasyonu hizmet alımı ile yapıldı. Projede kullanılan referans E(P)CK20 ORFV suşunun üretilmesinde ve serum nötralizasyon testinde (SNT) Madin-Darby Bovine Kidney (MDBK) devamlı hücre kültürleri kullanıldı. Virus pozitif hayvan belirlenen sürülere en yakın ve ayrıca odaklara 10 km ve/veya daha uzak olan aşı uygulanmamış işletmelerdeki hayvan varlığının durumuna göre, hastalık bildirimini takip eden 10. haftanın sonunda, koyun ve keçilerden alınan toplam 540 adet serumda antikor tespit etmek için SNT yapıldı. Yapılan SNT'i ile 4 pozitif 536 adet negatif tespit edildi. Çalışma da hayvan türleri ve cinsiyetleri arasında yapılan karşılaştırmada hem mihrak çıkan işletmeye yakın bölgelerde hem de 10 km alan dışında olan uzak bölgelerde SNT ile antikor tespit edilmesinde anlamlı bir sonuç (p>0.05) belirlenmedi. ORFV'un B2L, F1L ve VIR gen bölgelerinin filogenetik analizi yapıldı. Ülkemizde sirküle olan ORFV'nin aşı suşu ve genbanka girilmiş diğer izolatlar karşılaştırıldığında hem nükleotit hemde amino asit benzerliği bakımından değişimlerin olduğu tespit edildi. Diğer ülke dizilimleri ile karşılaştırıldığında özellikle Çin, Hindistan, İspanya, Yunanistan gibi ülkeler başta olmak üzere çeşitli ülkelerle yakın genetik ilişkili olduğu görüldü. Çalışma ile ORFV'lerinin ülke içinde yaygın olarak sirküle olduğu, hayvan hareketlerinin bu sirkülasyonda önemli bir rol oynadığı, koruma kontrol mücadelesinin etkili olmasının ve aşı kullanımının yaygınlaştırılmasının gerektiği sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
Ecthyma (Orf) is an infectious disease caused by the ORF virus (ORFV), a member of the Parapoxvirus genus. The disease, which affects small ruminants and sometimes other wild animals, can be seen wherever sheep and goats are raised. This study was planned to epidemiologically reveal the presence of ORFV in sheep and goat herds in Turkey, its molecular characterization, and also the effects of the virus on animals both in and outside the outbreak. In this study, 70 materials (10 lesion tissue/31 swabs/18 EDTA blood/11 skin scrapings) from 22 farms in 14 cities (Aydın, Denizli, Elazığ, Iğdır, İzmir, Kars, Manisa, Muğla, Nevşehir, Samsun, Sinop, Sivas, Rize and Tokat) were tested with Real-Time PCR. 45 positive and 25 negative were determined from 70 materials. According to the findings obtained from this study, it was determined that animal species and age groups did not have a significant (p<0.05) effect on the results. It was determined that the sampling methods gave significant (p<0.05) results in the detection of nucleic acid presence in the test performed with Real Time PCR. Samples with ORFV genome presence were inoculated into African green monkey (Cercopithecus aethiops) kidney (Vero) continuous cell cultures for virus isolation. Molecular characterization of samples that were positive for ORFV genome presence and were also isolated in Vero continuous cell cultures and identified with Real Time PCR was performed by service procurement. Madin-Darby Bovine Kidney (MDBK) continuous cell cultures were used in the production of the reference E(P)CK20 ORFV strain used in the project and in the serum neutralization test (SNT). According to the status of animal presence in farms that are closest to the herds with virus-positive animals and also 10 km and/or more away from the focus areas, SNT was performed to detect antibodies in a total of 540 sera taken from sheep and goats at the end of the 10th week following the disease notification. 4 positive and 536 negative were detected with the SNT. In the comparison made between animal species and genders in the study, no significant result (p>0.05) was determined in the detection of antibodies with SNT both in the regions close to the farm where the outbreak occurred and in the remote regions outside the 10 km area. Phylogenetic analysis of B2L, F1L and VIR gene regions of ORFV was performed. When the vaccine strain of ORFV circulating in our country and other isolates entered into the genbank were compared, it was determined that there were changes in terms of both nucleotide and amino acid similarity. When compared with other country sequences, it was seen that it was closely genetically related to various countries, especially China, India, Spain, and Greece. The study concluded that ORFVs circulate widely within the country, animal movements play an important role in this circulation, and that protection and control efforts should be effective and vaccine use should be expanded.
Benzer Tezler
- Kuzu ve oğlakların ağız bölgesinde orf virus (Ektima) nedeniyle meydana gelen dudak lezyonlarının moleküler ve virolojik yönden araştırılması ve papilend™ krem ile tedavi sürecinin incelenmesi
Investigation of molecular and virological of lip lesions caused by orf virus (Ecthyma) in mouth side of lamb and goat kids and examination of the papilend™ cream treatment process
GÜLER BERAT KAYA
Doktora
Türkçe
2022
Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiViroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KALE
- Türkiye imalat sanayiinde çalışan esnaf ve sanatkarların sosyo ekonomik yapıdaki yeri ve başlıca sorunları ve Bursa'da tatbiki bir araştırma
Başlık çevirisi yok
MEHMET TAŞTAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
İşletmeUludağ ÜniversitesiÇalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri Ana Bilim Dalı
- Türkiye'de aile planlaması çalışmalarında erkeklerin önemi, hastane personeli ile fabrika işçilerinin doğum kontrol yöntemlerine karşı tutum ve davranranışlarında farklılığın araştırılması
Başlık çevirisi yok
KAMİL MALKOÇLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Demografiİstanbul ÜniversitesiAile Sağlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DERİN KÖSEBAY