Şeker hastalığının kandan DNA metilasyonu ile yaş tahminine etkisi
The impact of diabetes mellitus on blood age estimation using DNA methylation
- Tez No: 952534
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÖNÜL FİLOĞLU TÜFEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Adli Tıp, Biyoloji, Genetik, Forensic Medicine, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Adli Tıp ve Adli Bilimler Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Fen Bilimleri Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 83
Özet
Son yıllarda birçok alanda kullanılan epigenetik mekanizmalardan biri DNA metilasyonudur. Adli araştırmalarda DNA metilasyonu doku ve hücre tipi tanımlaması, cinsiyet tayini, yaş tahmini ve monozigotik ikizlerin ayırt edilmesi gibi çeşitli amaçlarla kullanılabilmektedir. Geleneksel olarak yaş tahmini, kemik ve/veya dişlerden yapılmaktadır. Son yıllardaki epigenetik çalışmalarda DNA metilasyonu ile yaşlanma arasındaki ilişki keşfedilmiştir. Bu sayede yaş tahmini için yüksek doğruluk gösteren, farklı vücut dokularına özgü yaş tahmin panelleri geliştirilmiştir. Bu tez çalışmasında İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa Adli Tıp ve Adli Bilimler Enstitüsü AR-GE laboratuvarında Filoğlu ve ark. (2024) tarafından geliştirilen kandan yaş tahmin panelinin diyabet hastaları açısından değerlendirilmiştir. Geliştirilmiş olan 8 CpG bölgesini içeren (ELOVL2, ASPA, TOM1L1, C1orf132, RASSF5, FHL2, CCDC102B ve cg07082267) panel, SNaPshot yöntemi ile 51 diyabet hastasına ait kan örneklerinde metilasyon profilleri belirlenerek yaş tahmini yapılmıştır. Yaş tahmin sonuçlarına göre diyabet hastalarında MAE değeri ±5,68 yıl ve RMSE değeri ±6,80 yıl olarak elde edildi. Model grubu ile diyabet çalışma grubunu karşılaştırıldığında yaş tahmininde belirlenen sapmalar diyabet hastalarında öngörüldüğü şekilde yükseklik göstermektedir. Sonuç olarak elde edilen veriler göz önüne alındığında, adli olgularda DNA metilasyonu ile yaş tahmini yapıldığında şüphelilerin hastalık geçmişleri göz önünde bulundurulmalıdır. Metilasyonun rol oynadığı bilinen farklı hastalıklar açısından daha kapsamlı çalışmalar yapılması gerektiği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
One of the epigenetic mechanisms used in many areas in recent years is DNA methylation. In forensic studies, DNA methylation can be used for various purposes such as tissue and cell type identification, gender determination, age estimation and distinguishing monozygotic twins. Traditionally, age estimation is done from bones and/or teeth. In recent years, the relationship between DNA methylation and aging has been discovered in epigenetic studies. In this way, age estimation panels specific to different body tissues, which show high accuracy for age estimation, have been developed. In this thesis study, the blood age estimation panel developed by Filoğlu et al. (2024) in the laboratory of Istanbul University-Cerrahpaşa Institute of Forensic Medicine and Forensic Sciences was evaluated in terms of diabetic patients. The panel, which includes 8 CpG regions (ELOVL2, ASPA, TOM1L1, C1orf132, RASSF5, FHL2, CCDC102B and cg07082267), was used to determine methylation profiles in blood samples of 51 diabetic patients using the SNaPshot method and to estimate age. According to the age estimation results, the MAE value was ±5.68 years and the RMSE value was ±6.80 years in diabetic patients. When the model group and the diabetes study group were compared, the deviations determined in the age estimation were higher in diabetic patients as predicted. Consequently, considering the obtained data, the disease history of the suspects should be taken into consideration when estimating age with DNA methylation in forensic cases. It is thought that more comprehensive studies should be conducted in terms of different diseases in which methylation is known to play a role.
Benzer Tezler
- Çitlembik (Celtis australis L.) ve karayemiş (Prunus laurocerasus) meyvelerinin antioksidan kapasitesinin incelenmesi
Investigation of antioxidant capacity of hackberry (Celtis australis L.) and laurel (Prunus laurocerasus) fruits
SEDA BABACAN
- Kontrollü overyan hiperstimülasyon uygulandığında iyi cevap veren (Good responder) ve zayıf cevap veren (Poor responder) infertil hastalardaki fsh reseptör polimorfizmlerinin, fertil kadınlardaki fsh reseptör polimorfizmleri ile karşılaştırılması
Comparison of fsh reseptor polymorphismis between infertile women (Poor responders and good responders after controlled ovarian hyperstimulation) and fertile women
BARIŞ SEVER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Kadın Hastalıkları ve DoğumAkdeniz ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET ŞİMŞEK
- eNOS T786C ve G894T polimorfizmlerinin koroner arter hastalığında risk olarak değerlendirilmesi
Risk evaluation as eNOS T786C and G894T polymorphisms in coronary artery disease
ŞENAY BALCI FİDANCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyokimyaMersin ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LÜLÜFER TAMER GÜMÜŞ
- A hybrid deep learning metaheuristic model for diagnosis of diabetic retinopathy
Diyabetik retinopatinin tanısı için hibrit bir derin öğrenme meta-sezgisel modeli
ÖMER FARUK GÜRCAN
Doktora
İngilizce
2022
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖMER FARUK BEYCA
- Discovery of small molecule regulators of insulin degrading enzyme via computational screening approach
İnsülin parçalayan enzimin katalitik fonksiyonunu etkileyen öncü molekülleri bulmak üzere hesaplamalı olarak tarama yöntemi kullanılması
EZGİ DAĞYILDIZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
BiyoistatistikKoç ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. METİN TÜRKAY
YRD. DOÇ. DR. SEDA KIZILEL