İlaç yeniden konumlandırma tabanlı anti-alzheimer ilaç keşfi ve in vitro değerlendirilmesi
Drug repositioning based anti-alzheimer drug discovery and in vitro evaluation
- Tez No: 955953
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞÜKRÜ BEYDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: İlaç yeniden konumlandırma, Alzheimer hastalığı, Cmap, İlaç keşfi, Asetilkolinesteraz, Drug repositioning, Alzheimer's disease, CmAp, Drug discovery, Acetylcholinesterase
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 104
Özet
Geleneksel ilaç geliştirme yöntemlerinin uzun zaman alması ve yüksek maliyetler, zaman- maliyet açısından daha verimli yöntemlerin kullanımını gerekli kılmaktadır. Alzheimer hastalığı (AH), günümüzde halen daha etkin ilaçlara ihtiyaç duyulan ve semptomatik tedavi uygulanan nörodejeneratif bir hastalıktır. İlaç yeniden konumlandırma, mevcut ilaçların asıl tasarlandıkları terapötik amaçlarının ötesinde, yeni endikasyonlarda kullanılması prensibine dayanan bir ilaç keşif yöntemidir. Bu bakış açısı; farmakokinetik, toksikolojik ve güvenlik verileri daha önce bilinen mevcut ilaçların yeniden değerlendirilmesini içerdiğinden daha güvenli bir profil oluşturmaktadır. Bu bağlamda, tezin temel hedefi, AH için ilaç yeniden konumlandırma stratejisini kullanarak potansiyel ilaç adaylarını belirlemektir. İlk aşamada, NCBI GEO veritabanı kullanılarak AH'ye ait gen ekspresyon profilleri elde edilip cMAP platformu aracılığıyla aday ilaçlar belirlenmiştir. Bu aşamanın sonunda, dehidroizoadosteron, moricizine, SKF-96365, KU-0063794, ouabain, proscillaridin A, digoxin, WYE-354, MK-212, parbendazole, cinobufagin aday moleküller olarak seçilmiştir. İkinci aşamada ise belirlenen potansiyel ilaçların asetilkolinesteraz (AChE) enzim inhibisyonu çalışması gerçekleştirilerek in vitro değerlendirme yapılmıştır. Yapılan değerlendirme sonucunda; araştırılan bileşikler 31,181 nM-113,134 nM (standart bileşik takrin: 33,052 nM) arasında IC50 değerleri ve 8,065±4,700 nM-123,164±92,915 nM (standart bileşik takrin: 7,177±4,429) arasında KI değerleri ile inhibitör potansiyel göstermiştir. Bu tez çalışması, AH tedavisi için alternatif potansiyel ilaç seçeneklerini genişletmek amacıyla in silico yöntemlerle potansiyel ilaçların tespiti ve in vitro yöntem ile de bu bulguların desteklenmesi açısından yenilikçi bir yaklaşım sunmuştur.
Özet (Çeviri)
Due to the high time and cost involved of conventional drug development methods, there is a need for more efficient methods in terms of time and cost. Alzheimer's disease (AD) is a neurodegenerative disease for which effective drugs are still needed and which is treated symptomatically. Drug repositioning is a method of drug discovery based on the principle of using existing drugs beyond their original therapeutic purpose for the treatment of other diseases or for new indications. This perspective creates a safer profile as it involves the re-evaluation of existing drugs with already known pharmacokinetic, toxicological and safety data. In this context, the main objective of this work is to identify potential drug candidates for Alzheimer's disease using the drug repositioning strategy. In the first phase, gene expression profiles of Alzheimer's disease were generated using the NCBI GEO database and drug candidates were identified using the cMAP platform. At the end of this phase, dehydroisoadosterone, moricizine, SKF-96365, KU-0063794, ouabain, proscillaridin A, digoxin, WYE-354, MK-212, parbendazole and cinobufagin were selected as candidate molecules. In the second phase, an in vitro evaluation was performed by conducting an acetylcholinesterase enzyme inhibition study for the identified potential drugs. The compounds tested showed IC50 values between 31.181 nM-113.134 nM (standard compound tacrine: 33.052 nM) and Ki values between 8.065± 4.700 nM-123.164±92.915 nM (standard compound tacrine: 7.177±4.429). This dissertation study presented an innovative approach to expand the available treatment options for Alzheimer's disease.
Benzer Tezler
- Drug repurposing in Ras/Raf/Mek/ERK signaling pathway
Ras/Raf/Mek/ERK sinyal yolağında ilaç yeniden konumlandırma
AHENK ZEYNEP SAYIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaKoç ÜniversitesiKimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEHRA ÖZLEM KESKİN ÖZKAYA
PROF. DR. ATTİLA GÜRSOY
- Identification of candidate biomarkers and potential therapeutics for idiopathic pulmonary fibrosis through systems biology approaches
İdı̇opatı̇k pulmoner fı̇brozı̇s içı̇n aday bı̇yobelı̇rteç ve potansı̇yel terapötı̇klerı̇n sı̇stem bı̇yolojı̇sı̇ yaklaşımları ile belı̇rlenmesı̇
MECBURE NUR AKÇA
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyomühendislikMarmara ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CEYDA KASAVİ
- Production of functional nanofibrous gelatin wound dressings and a study on drug repositioning
Fonksiyonel nanolif jelatin yara örtülerinin üretimi ve ilaç yeniden konumlandırılması üzerine bir çalışma
HİLAL ÖZYURT
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİ KILIÇ
- İşlemsel ilaç yeniden konumlandırma yaklaşımının geliştirilmesi
Development of computational drug repositioning approach
ÜLKÜ ÜNSAL
Doktora
Türkçe
2023
BiyoistatistikKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoistatistik ve Tıp Bilişimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL TURHAN
- Development a computational compound repositioning approach
Hesaplamalı bir bileşik yeniden konumlandırma yaklaşımı geliştirilmesi
ALİ CÜVİTOĞLU
Doktora
İngilizce
2023
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolDokuz Eylül ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZERRİN IŞIK