Kantitatif PCR ve biyoinformatik analiz yöntemleri ile meme kanseri gelişimi ile ilişkili mikroRNA'ların belirlenmesi
Determination of microRNAs associated with breast cancer development using quantitative PCR and bioinformatics analysis methods
- Tez No: 960578
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜRKAN GÜRER, DOÇ. DR. SEVGİ GEZİCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tezin amacı, meme kanserli hastalarda miR-3928-5p, miR-4295 ve miR-4720-5p'nin ifade seviyelerinin belirlenmesi ve bu miRNA'ların meme kanserindeki rollerinin ortaya konmasıdır. Bu çalışma için Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Yerel Etik Kurulu tarafından onay alınmıştır (Onay no: 2023/197). Çalışmada, Gaziantep Üniversitesi Genel Cerrahi Anabilim Dalı'nda opere edilmiş toplam 67 hastadan alınan tümörlü ve komşu sağlıklı doku örnekleri kullanılmıştır. qRT-PCR ile miR-3928-5p, miR-4295 ve miR-4720-5p'nin ifade seviyeleri belirlenmiştir. Biyoinformatik analizler yapılarak miRNA'ların Fonksiyonel Zenginleştirme Analizi yapılmıştır. Çalışma sonucunda, tümörlü dokularda sağlıklı dokulara kıyasla miR-3928-5p (p<0.001), miR-4295 (p=0.029) ve miR-4720-5p (p<0.001)'nin azalan ifade seviyeleri istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Biyoinformatik analizlerle, miRNA'ların hedeflediği genlerin RAS/RAC sinyal iletimi, klatrin aracılı endositoz gibi biyolojik süreçlere dahil olduğunu, KEGG analizleri ile miRNA'ların MAPK sinyal yolağı, östrojen sinyal yolağı ve endokrin tedavi direnci gibi kanserle ilişkili yollarla bağlantılı olduğunu göstermiştir. SHC1 ve ESR1 gibi merkezi genler, onkojenik yolların ortak düzenleyicileri olarak öne çıkmıştır. Sonuç olarak, bu çalışma miR-3928-5p, miR-4295 ve miR-4720-5p'nin meme kanseri biyolojisinde önemli düzenleyici roller üstlendiğini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
The aim of this thesis is to determine the expression levels of miR-3928-5p, miR-4295, and miR-4720-5p in breast cancer patients and to reveal the roles of these miRNAs in breast cancer. This study was approved by the Local Ethics Committee of Gaziantep University Faculty of Medicine (Approval No: 2023/197). In the study, tumor and adjacent healthy tissue samples were obtained from a total of 67 patients who underwent surgery at the Department of General Surgery, Gaziantep University. The expression levels of miR-3928-5p, miR-4295, and miR-4720-5p were determined using qRT-PCR. Bioinformatic analyses were performed to conduct a Functional Enrichment Analysis of the miRNAs. The results of the study showed that the expression levels of miR-3928-5p (p<0.001), miR-4295 (p=0.029) and miR-4720-5p (p<0.001) were significantly lower in tumor tissues compared to healthy tissues. Bioinformatic analyses showed that the genes targeted by miRNAs are involved in biological processes such as RAS/RAC signal transduction and clathrin-mediated endocytosis, while KEGG analyses revealed that miRNAs are associated with cancer-related pathways such as the MAPK signalling pathway, oestrogen signalling pathway, and endocrine therapy resistance. Central genes such as SHC1 and ESR1 emerged as common regulators of oncogenic pathways. In conclusion, this study demonstrates that miR-3928-5p, miR-4295, and miR-4720-5p play important regulatory roles in breast cancer biology.
Benzer Tezler
- Yaşa bağlı makula dejenerasyonu (YBMD) etyolojisinden sorumlu genlerin in silico analiz ile değerlendirilmesi ve klinik yaklaşımla doğrulanması
Evaluation of genes responsible for the etiology of age-related macular degeneration (AMD) via in silico analysis and validation through clinical approach
SALİH ERKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
Göz HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IŞIL KUTLUTÜRK KARAGÖZ
- Tekrarlayan implantasyon başarısızlığında, doku ve dolaşımdaki MikroRNA'ların etkisi
The role of the serum exosomal and endometrium MicroRNAs in recurrent implantation failure
FATEMEH AZHARI ZARNAGH
Doktora
Türkçe
2019
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SADRETTİN PENÇE
- Genome-wide localisation analysis for IRF4 target gene identification in melanoma cell lines
IRF4 hedef genlerinin melanom hücre hatlarında tanımlanması amacıyla genom düzeyinde lokalizasyon analizi
ULDUZ SOBHI AFSHAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NEŞET CEVDET TOLGA EMRE
- Zeytinde polen uyumunu kontrol eden aday genin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of a candidate gene associated in pollen recognation of olive
ALİ CAN KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyolojiBalıkesir ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLENDAM TÜMEN
- Glut1 eksikliği sendromunda genetik analizler
Başlık çevirisi yok
CEMRE ÖRNEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Genetikİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİBEL AYLİN UĞUR İŞERİ