Geri Dön

Entegre biyoinformatik analiz ile obezite ve hepatoselüler karsinom ilişkili ortak genlerin belirlenmesi ve monosodyum glutamat ve tannik asit uygulanan sıçanların karaciğer dokularında araştırılması

Identification of common genes associated with obesity and hepatocellular carcinoma by integrated bioinformatics analysis, investigation in liver tissues of rats treated with monosodium glutamate and tannic acid

PDF İndir

  1. Tez No: 963802
  2. Yazar: HİLAL TOSUN
  3. Danışmanlar: DOÇ. HAMİD CEYLAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Atatürk Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 91

Özet

Amaç: Bu tez çalışmasında, biyoinformatik analizler kullanılarak hepatoselüler karsinom (HCC) ile ilişkili anahtar genlerin belirlenmesi ardından, yaygın olarak kullanılan bir gıda katkı maddesi olan monosodyum glutamat (MSG) ile doğal bir polifenol olan tannik asit (TA) uygulanan sıçanların karaciğer dokularında, belirlenen bu genlerin ekspresyon seviyelerinin ayrıntılı olarak incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Çalışma kapsamında yirmi dört sıçan rastgele kontrol ve deney gruplarına ayrılmıştır. Kontrol grubundaki hayvanlar, 21 gün boyunca oral gavaj yoluyla salin ile muamele edilirken; deney gruplarına ise 21 gün boyunca, günde bir kez oral gavaj yoluyla TA, MSG ve MSG+TA uygulanmıştır. Tedavi sonrası, MSG'nin karaciğer dokularında HCC'ye yol açıp açmadığı ve TA'nın olası hepatoprotektif etkileri değerlendirilmiştir. Bu amaçla, HCC belirteci olarak kabul edilen genlerin ekspresyon seviyeleri ölçülmüş ve elde edilen veriler doğrultusunda, TA'nın MSG kaynaklı olası hepatotoksisite üzerindeki hepatoprotektif etkisi analiz edilmiştir. Ayrıca, tüm deney gruplarında belirlenen anahtar genlerin ifade düzeyleri Real-Time PCR yöntemi kullanılarak nicel olarak belirlenmiştir. Bulgular: 21 gün sonunda, MSG ile tedavi edilen sıçanların karaciğer dokularında HCC ile ilişkili belirteç up-regüle genlerin ekspresyon seviyelerinde anlamlı bir artış ve down-regüle genlerin ekspresyon seviyelerinde anlamlı bir azalış gözlenmiştir. Buna karşın, TA ile tedavi edilen sıçanlarda bu genlerin anormal ekspresyon seviyelerinin tersine çevrilebildiği belirlenmiştir. Ayrıca, belirlenen anahtar genlerin transkripsiyonel aktivitelerinin MSG maruziyeti sonrası önemli ölçüde değiştiği, TA ile tedavi edilen karaciğer dokularında ise bu genlerin mRNA ekspresyon seviyelerinin baskılandığı gözlemlenmiştir. Sonuç: Bu çalışmanın bulguları, MSG'nin HCC ile ilişkili anahtar genlerin mRNA ekspresyon seviyelerini değiştirerek HCC gelişimine katkıda bulunabileceğini, ancak bu etkinin TA tarafından baskılanabildiğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Objective: In this thesis study, the aim was to identify key genes associated with hepatocellular carcinoma (HCC) using bioinformatics analyses and then to thoroughly examine the expression levels of these genes in the liver tissues of rats administered monosodium glutamate (MSG), a widely used food additive, and tannic acid (TA), a natural polyphenol. Methods: Within the scope of the study, twenty-four rats were randomly divided into control and experimental groups. The animals in the control group were treated with saline via oral gavage for 21 days, while the experimental groups received TA, MSG, and MSG+TA once daily via oral gavage for 21 days. After treatment, whether MSG induced HCC in liver tissues and the potential hepatoprotective effects of TA were evaluated. For this purpose, the expression levels of genes recognized as HCC markers were measured, and based on the obtained data, the hepatoprotective effect of TA against possible MSG-induced hepatotoxicity was analyzed. Additionally, the expression levels of the identified key genes in all experimental groups were quantitatively determined using the Real-Time PCR method. Results: After 21 days, a significant increase in the expression levels of up-regulated genes associated with HCC and a significant decrease in the expression levels of down-regulated genes were observed in the liver tissues of MSG-treated rats. In contrast, it was found that abnormal expression levels of these genes could be reversed in TA-treated rats. Furthermore, it was observed that the transcriptional activities of the identified key genes significantly changed after MSG exposure, whereas the mRNA expression levels of these genes were suppressed in TA-treated liver tissues. Conclusion: The findings of this study suggest that MSG may contribute to HCC development by altering the mRNA expression levels of key genes associated with HCC, but this effect can be suppressed by TA.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    927592

    Identification of differentially expressed ferroptosis-related hub genes and their association with cigarette smoke-induced chronic obstructive pulmonary disease by bioinformatic analysis

    Diferansiyel olarak eksprese edilen spesifik ferroptoz genlerinin tanımlanması ve sigara dumanına bağlı kronik obstrüktif akciğer hastalığı ile ilişkisinin biyoinformatik analizler yoluyla belirlenmesi

    FATMA ŞİMAL LAÇİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Allerji ve İmmünolojiKoç Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN BAYRAM

  2. Tez No

    817092

    Uncovering dysregulated miRNA-mRNA networks in Alzheimer's disease through integrated bioinformatics and their potential as blood-based biomarkers

    Alzheimer hastalığı'nda entegre biyoinformatik yöntemler kullanılarak disregüle miRNA-mRNA ağlarının ortaya çıkarılması ve kan temelli biyobelirteç olarak potansiyellerinin araştırılması

    BİRGÜL ÇOLAK AL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Biyolojiİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NAGEHAN ERSOY TUNALI

  3. Tez No

    815776

    Çoklu-omik verilerin bütünleşik analizi ile romatoid artrit hastalığına yönelik biyobelirteçlerin belirlenmesi

    Identification of biomarkers for rheumatoid arthritis disease by integrated analysis of multi-omic data

    TUĞÇE ÇELEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Biyomühendislikİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMED ERKAN KARABEKMEZ

  4. Tez No

    713551

    Determination and verification of new targets in liver cancer

    Karaciğer kanserinde yeni hedeflerin belirlenmesi ve doğrulanması

    UMUT EKİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyokimyaDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAVUZ OKTAY

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  5. Tez No

    870620

    Yenidoğan ve çocuk yoğun bakım ünıtesinde hızla kötüleşen kritik yenidoğan ve süt çocuklarında hızlı yeni nesil dizileme ile genetik tanı

    Genetic diagnosis through rapid next generation sequencing for acutely deteriorating critically ill newborn and infant patients in neonatal and pediatric intensive care units

    BENGİSU GÜNER YILMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YASEMİN ALANAY

Geri Dön