Türkiye'deki anatololacerta anatolica (werner, 1900) türünün genom-çaplı belirteçlere dayalı filocoğrafyası
Phylogeography of anatololacerta anatolica (werner, 1900) in türki̇ye based on genome-wide markers
- Tez No: 970803
- Danışmanlar: PROF. DR. ÇETİN ILGAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Genetik-popülasyon, Genetics-population
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Zooloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında, Batı Anadolu'da yayılış gösteren Anatololacerta anatolica ve A. pelasgiana türlerinin filocoğrafik yapısı, RAD-seq temelli genom çaplı SNP verileri kullanılarak incelenmiştir. Toplam 29 bireyden elde edilen veriler, iPyRAD işlem hattı aracılığıyla analiz edilmiş ve 154.001 SNP içeren yüksek çözünürlüklü bir veri seti oluşturulmuştur. Maksimum Olasılık (ML) analizi, IQ-TREE 2 yazılımı kullanılarak TVM+F+R2 modeliyle gerçekleştirilmiş; sonuçlar, bireylerin tür düzeyinde iki güçlü monofiletik gruba ayrıldığını göstermiştir. Popülasyon genetik yapısı ADMIXTURE yöntemiyle analiz edilmiş ve en düşük CV hata değeri K=2'de gözlenmiştir; bu da iki genetik kümenin varlığını desteklemektedir. Türler arasında sınırlı gen akışı dışında belirgin bir karışım saptanmamıştır. Çalışma hem morfolojik hem de moleküler belirteçlere dayalı önceki sınıflandırmaları genom çapında verilerle test ederek, A. anatolica ve A. pelasgiana arasında genom düzeyinde net bir farklılaşma olduğunu ortaya koymuş, türleşme sürecinin genetik izlerini coğrafi bağlamda açıklamaya katkı sunmuştur
Özet (Çeviri)
In this thesis, the phylogeographic structure of Anatololacerta anatolica and A. pelasgiana, distributed in Western Anatolia, was investigated using RAD-seq based genome-wide SNP data. Data obtained from a total of 29 individuals were analyzed through the iPyRAD pipeline, resulting in a high-resolution dataset containing 154,001 SNPs. Maximum Likelihood (ML) analysis was conducted using IQ-TREE 2 software with the TVM+F+R2 substitution model, revealing two robust monophyletic groups corresponding to the species level. Population genetic structure was examined using the ADMIXTURE method, and the lowest cross-validation (CV) error was observed at K=2, indicating the presence of two distinct genetic clusters. Apart from limited gene flow, no significant admixture was detected between the species. This study tested previous classifications based on morphological and molecular markers with genome-wide data, demonstrating clear genomic differentiation between A. anatolica and A. pelasgiana, thus contributing to understanding the genetic signatures of the speciation process within a geographic context.
Benzer Tezler
- Türkiye'deki konut sorununun çözümünde endüstrileşmiş yapım yöntemlerinin yeri ve hücre sistemi ile yapılan tasarımda değişebilirliğe yönelik bir çalışma
A Study on the importance of the industrialized building methods in handling the housing problem in Turkey and the changeability in the box-unit design
NEJDET TANATMIŞ
- Türkiye'deki dış ticaret sermaye şirketlerinin dünyadaki benzerleriyle karşılaştırmalı analizi
Başlık çevirisi yok
ERTAN ŞİDE
- Türkiye'deki teknik ara insangücünün eğitimin ekonomik değeri kapsamındaki nitelikler açısından değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
L.IŞIL ÜNAL
Doktora
Türkçe
1987
Eğitim ve ÖğretimHacettepe ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA AYDIN
- Türkiye'deki para politikasının eleştirisi (1963-1981)
Criticism of monetary policy in Turkey: 1963-1981
MEHMET DEĞİRMENCİ