Geri Dön

Multiple skleroz hastalığı için periferik kan mononükleer hücrelerinde miRNA ve mRNAbiyobelirteç adaylarının belirlenmesi

Identification of candidate miRNA and mRNA biomarkers in peripheral blood mononuclear cells for multiple sclerosis

  1. Tez No: 971180
  2. Yazar: BADRELDIN IBRAHIM AFIFI MOHAMED AFIFI
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Moleküler Tıp, Genetik, Molecular Medicine, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Multipl skleroz (MS), merkezi sinir sistemini etkileyen, kronik ve bağışıklık aracılı bir hastalık olup, özellikle genç erişkinlerde görülmekte ve küresel ölçekte ciddi nörolojik ve sosyoekonomik yük oluşturmaktadır. Enflamatuvar demiyelinizasyon ve ilerleyici nörodejenerasyon ile karakterize edilen MS'nin patogenezi, genetik ve çevresel faktörlerin karmaşık etkileşimiyle şekillenmektedir. Bu çalışmada, multipl sklerozun erken moleküler tanısına katkı sağlayabilecek potansiyel mikroRNA (miRNA) ve haberci RNA (mRNA) biyobelirteçlerini tanımlamayı amaçladık. Bu doğrultuda, çeşitli halka açık transkriptomik veri tabanlarından elde edilen dört miRNA ve on iki mRNA veri seti analiz edilmiştir. En az iki veri setinde ortak olarak farklı düzeyde ifade edilen miRNA ve mRNA'lar belirlenmiştir. Tanımlanan mRNA'lar için; Gen Ontolojisi (GO), KEGG yolak zenginleştirme analizleri ve STRING veritabanı kullanılarak protein–protein etkileşim (PPI) ağı oluşturulmuştur. Analizler sonucunda, hsa-miR-1260b, hsa-miR-197 ve hsa-miR-494'ün MS hastalarında anlamlı şekilde farklı düzeyde ifade edildiği saptanmıştır. Ayrıca, CAMP, HBD, ERAF, KRT1, NR4A2, AREG, HBQ1, HBA2 genlerinin yüksek düzeyde, STAT2 geninin ise düşük düzeyde ifade edildiği belirlenmiştir. Sonunda, Bu gen ve miRNA'ların, MS hastalarında potansiyel tanısal biyobelirteçler olarak önemli rol oynayabileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Multiple sclerosis (MS) is a chronic, immune-mediated disorder of the central nervous system that predominantly affects young adults and poses substantial neurological and socioeconomic burdens worldwide. Characterized by inflammatory demyelination and progressive neurodegeneration, the pathogenesis of MS involves a complex interplay of genetic and environmental factors. In this study, we sought to identify potential microRNA (miRNA) and messenger RNA (mRNA) biomarkers in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of Multiple sclerosis patients that could aid in the early molecular diagnosis of the disease. To this end, we conducted a comprehensive transcriptomic analysis across four miRNA and twelve mRNA datasets retrieved from public repositories. Differentially expressed miRNAs and mRNAs shared across at least two datasets were identified. For the mRNAs, functional enrichment analyses including Gene Ontology (GO), KEGG pathway analysis, and protein–protein interaction (PPI) network construction via STRING were performed. Our findings revealed significant dysregulation of hsa-miR-1260b, hsa-miR-197, and hsa-miR-494 in MS patients. Moreover, elevated expression levels of CAMP, HBD, ERAF, KRT1, NR4A2, AREG, HBQ1, HBA2, and decreased expression of STAT2 were consistently observed in MS samples compared to healthy controls. Overall, these genes and miRNAs may serve as promising diagnostic biomarkers and offer insight into the molecular mechanisms underlying MS.

Benzer Tezler

  1. Bağırsak hasar modellerinde kemik iliği mezenkimal kök hücre ve bağırsak mezenkimal kök hücrelerin rejeneratif ve immün modülatuvar etkilerinin karşılaştırılması

    Comparison of regenerative and immune modulatory effecets of bone marrow and intestinal mesenchymal stem cells i intestinal damage models

    BURCU PERVİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİMA AERTS KAYA

  2. Multipl skleroz CD3+ t hücrelerinde sinyal yolağı aktivasyonlarının araştırılması

    Investigation of signaling pathway activations in Multiple Sclerosis of CD3+ t cells

    FATMA BETÜL ÖKTELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SUZAN ÇINAR

  3. Otoimmün hastalıkların metabolik yolaklarının transkriptomik verilerle bütünleşik incelenmesi

    Integrated analysis of metabolic pathways in autoimmune diseases using transcriptomic datasets

    ŞEHNAZ MELİSA ACAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Biyomühendislikİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMED ERKAN KARABEKMEZ

  4. Generation and characterization of induced pluripotent stem cell lines from multiple sclerosis patients and healthy individuals

    Multipl skleroz hastalarından ve sağlıklı bireylerden uyarılmış pluripotent kök hücre hatlarının üretimi ve karakterizasyonu

    ONUR CAN BEGENTAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERKAN KİRİŞ

  5. Miyelin interaktom analizi ile multiple skleroz için biyobelirteç ve tedaviye yönelik yolakların tanımlanması

    Identification of biomarkers and candidate pathways for therapy of multiple sclerosis via interactome analysis

    BURCU KURT VATANDAŞLAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Fizyolojiİstanbul Medipol Üniversitesi

    Sinir Bilim Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. BİLAL ERSEN KERMAN