Geri Dön

Kanatlı işletmeleri atık sularından izole edilen escherichia col ve koliform izolatlarının GSβL, AMP-C ve karbapenamaz aktivitelerinin incelenmesi

Investigation of ESβL, AMP-C and carbapenemase activities of escherichia coli and coliform isolates obtained from poultry farm wastewater

PDF İndir

  1. Tez No: 994222
  2. Yazar: TOLGA AKHARMAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SİBEL KIZIL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Antibiyotik dirençliliği, Evrensel sağlık kapsamı, Universal health coverage
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kırıkkale Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Antimikrobiyal direnç (AMR), kanatlı sektöründe giderek artan bir sorun hâline gelmekte ve hem hayvan sağlığını hem de halk sağlığını tehdit etmektedir. Bu çalışmada, Ankara ilindeki iki farklı damızlık broyler işletmesinden, toplam 12 kümesin altlık sularından izole edilen 13 adet Escherichia coli (E. coli) ve koliform bakteride antibiyotik direnç profilleri ile GSβL, Amp-C ve karbapenemaz aktivitelerinin fenotipik ve genotipik düzeyde belirlenmesi amaçlanmıştır. İzolatların identifikasyonu konvansiyonel yöntemlerle gerçekleştirilmiş, antibiyotik duyarlılık testleri EUCAST (2025) ve CLSI (2024) kriterlerine göre yapılmıştır. Fenotipik sonuçlara göre en yüksek direnç oranı ampisilin için %100 olarak belirlenmiş; bunu sırasıyla sefoksitin %92.3, nalidiksik asit %69.2, trimetoprim-sülfametoksazol %61.5, tetrasiklin %53.8 ve siprofloksasin %46.2 izlemiştir. Sefotaksim için direnç %15.4, gentamisin %30.8 ve kloramfenikol %23.1 düzeyinde bulunurken, seftazidim ve meropenem için hiçbir direnç tespit edilmemiştir. Fenotipik testlerde tüm izolatları Amp-C açısından pozitif, GSβL ve karbapenemaz açısından ise negatif değerlendirilmiştir. Genotipik incelemelerde, klasik PCR sonuçları izolatların büyük bir bölümünde CTX-M gen grubunun (özellikle CTX-M-1 ve CTX-M-9) pozitif olduğunu göstermiştir. Ayrıca TEM geninin %53.8 oranında pozitifliği birden fazla GSβL geninin birlikte taşındığını düşündürmektedir. FOX (%30.8) ve OXA-48 (%23.1) genlerinin pozitif bulunması, belirli izolatlarda Amp-C β-laktamaz veya karbapenemaz potansiyeli bulunduğuna işaret etmektedir. Buna karşın IMP, VIM, KPC ve NDM-1 gibi karbapenemaz genlerinin hiçbir izolatta tespit edilmemesi, karbapenemaz kaynaklı direnç oranlarının düşük olduğunu doğrulamaktadır. Sonuç olarak, Ankara'daki damızlık broyler işletmelerinden elde edilen izolatlarda yaygın çoklu antibiyotik direnci ve yüksek Amp-C varlığı dikkat çekmektedir. Fenotipik olarak GSβL ve karbapenem direncinin düşük olması olumlu bir bulgu olmakla birlikte, CTX-M ve TEM pozitifliklerinin yüksekliği, genotipik düzeyde önemli bir GSβL rezervuarının varlığına işaret etmektedir. Bu durum, kanatlı sektöründe antibiyotik kullanımının dikkatle yönetilmesi gerektiğini ve rutin izleme çalışmalarının önemini vurgulamaktadır.

Özet (Çeviri)

Antimicrobial resistance (AMR) is an increasing concern in the poultry industry, posing significant risks to both animal health and public health. This study aimed to determine the phenotypic antibiotic resistance profiles and the presence of ESβL, Amp-C, and carbapenemase activities in Escherichia coli (E. coli) and coliform bacteria isolated from litter water samples collected from 12 broiler breeder houses belonging to two different poultry enterprises in Ankara, Türkiye. A total of 13 isolates were identified using conventional methods, and antimicrobial susceptibility testing was performed according to EUCAST (2025) and CLSI (2024) guidelines. Phenotypic results revealed that the highest resistance rate was observed against ampicillin (AM) at 100%, followed by cefoxitin (FOX) 92.3%, nalidixic acid (NA) 69.2%, trimethoprim–sulfamethoxazole (SXT) 61.5%, tetracycline (TE) 53.8% and ciprofloxacin (CIP) 46.2%. Moderate resistance rates were detected for gentamicin (CN) 30.8%, chloramphenicol (C) 23.1% and cefotaxime (CTX) 15.4%. No resistance was detected against ceftazidime (CAZ), or meropenem (MEM). Based on phenotypic criteria, all isolates were evaluated as Amp-C positive, while no ESβL or carbapenemase activity was observed. Genotypic analyses performed with conventional PCR revealed that a large proportion of isolates carried CTX-M gene groups, particularly CTX-M-1 and CTX-M-9. Additionally, the TEM gene was detected in (53.8%) of isolates, suggesting the coexistence of multiple ESβL genes in some strains. FOX (30.8%) and OXA-48 (23.1%) gene positivity indicated the potential for Amp-C β-lactamase or carbapenemase production in certain isolates. Importantly, major carbapenemase genes such as IMP, VIM, KPC and NDM-1 were not detected in any isolate, demonstrating a low genotypic risk for carbapenem resistance. In conclusion, isolates obtained from broiler breeder operations in Ankara exhibited widespread multidrug resistance and high Amp-C activity. Although phenotypic ESβL and carbapenem resistance remained low, the high prevalence of CTX-M and TEM genes highlights the presence of a significant genotypic ESβL reservoir in the poultry environment. These findings underscore the need for prudent antibiotic use, ongoing surveillance and integrated AMR control strategies in the poultry sector.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    46854

    Güney Marmara bölgesi sanayi domates alanlarındaki toprak, sulama suyu ve domates meyvelerinde ağır metal içeriklerinin belirlenmesi

    Başlık çevirisi yok

    ÖMER LÜTFİ ELMACI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1995

    ZiraatEge Üniversitesi

    Toprak Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MÜZEYYEN SEÇER

  2. Tez No

    381869

    Seydişehir Eti alüminyum işletmesi kırmızı çamur atık barajı mühendislik ve çevre jeolojisi

    The engineering and envorimental geology of Seydi̇şehi̇r Eti aluminium company's red mud tailing dam

    SÜVEYDA MUŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Jeoloji Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİR VARDAR

  3. Tez No

    568323

    Amasya ilindeki hayvansal atıkların biyogaz potansiyelinin belirlenmesi

    Determination of biogas potential from animal waste in Amasya province

    YAHYA AKSU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    ZiraatTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Biyosistem Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GAZANFER ERGÜNEŞ

  4. Tez No

    642691

    Yeni kurulacak Tuzla Halinin eski hale göre sağlayacağı fayda ve maliyet analizi

    Benefit and cost analysis to be provided by Tuzla state to be established according to the old state

    MEVLÜT DURMUŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    İşletmeİstanbul Okan Üniversitesi

    Uluslararası Lojistik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HALİM YURDAKUL

  5. Tez No

    733684

    IPARD desteklerinden yararlanan kanatlı eti üreticilerinin üretim ve pazarlama yapısı: Ankara ili örneği

    Production and marketing struction of poultry meat producers which benefited from IPARD supports: Ankara example

    ÖZGEN MARTAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    EkonomiAnkara Üniversitesi

    Tarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEVHİBE ALBAYRAK

Geri Dön