Tübülin tirozin ligaz gen ifadesini düzenleyen mikroRNA'ların araştırılması
Investigation of MicroRNAs regulating tubulin tyrosine ligase gene expression
- Tez No: 1024547
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GAMZE BORA AKOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Mikro RNA, Mikrotübüller, RNA interferaz, Micro RNA, Microtubules, RNA interference
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tirozinasyon, mikrotübül yapısını oluşturan α-tübülin proteinlerinde görülen post-translasyonel modifikasyonlardan biridir. Tübülin tirozin ligaz (TTL) enzimi tarafından katalizlenen tirozinasyon, mikrotübül depolimerizasyonu sonrası α-tübüline tirozin eklenmesidir. Anabilim Dalı'mızda gerçekleştirilen önceki çalışmalarda, spinal müsküler atrofi (SMA) hastalık modelinde TTL protein düzeyinin arttığı gösterilmiştir. Farklı hastalıklarda da TTL ifade düzeyinde değişiklikler görülmesine rağmen TTL ifadesinin kontrolünü sağlayan moleküler mekanizmalar aydınlatılmamıştır. Bu noktada, gen ifadesinin post-transkripsiyonel kontrolünde görevli, kısa kodlamayan mikroRNA (miRNA)'lara odaklanılarak TTL gen ifadesinin kontrolünde görev aldıkları hipotezi kurulmuştur. TTL mRNA'sına bağlanan bir miRNA'nın tanımlanmamış olması nedeniyle, in silico analizler gerçekleştirilmiş ve miR-138-5p, miR-185-5p ve miR-338-3p aday olarak belirlenmiştir. Aday miRNA'ların ifade düzeyleri NSC34 hücrelerinden kurulan in vitro nöronal SMA modelinde araştırılmış; miR-138-5p ifadesinde istatistiksel olarak anlamlı bir azalma, miR-185-5p ifadesinde ise azalma eğilimi saptanmıştır. miR-338-3p'nin ise hücrelerde ifadesinin bulunmadığı belirlenmiştir. miR-138-5p ve miR-185-5p'nin hücrelerdeki ifade düzeyleri mimik transfeksiyonları yoluyla arttırılmış; miR-138-5p'nin ifadesi arttırıldığında TTL gen ifadesinde RNA düzeyinde istatistiksel olarak anlamlı bir artış saptanmıştır. Ancak TTL protein düzeyinin değişmediği belirlenmiştir. miR-185-5p'nin ifadesi arttırıldığında ise TTL gen ifadesinde RNA düzeyinde azalma yönünde değişim gözlenmiş; ancak protein düzeyinde değişiklik saptanmamıştır. Elde edilen sonuçlar, miR-185-5p'nin TTL ifadesinin regülasyonunda görev almadığını, ancak miR-138-5p'nin TTL gen ifadesini dolaylı olarak regüle edebileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Tyrosination is one of the post-translational modifications observed in the α-tubulin proteins that form microtubule structure. Tyrosination, which is catalyzed by tubulin tyrosine ligase (TTL), play a role of the addition of tyrosine to α-tubulin following microtubule depolymerization. In our department, previous studies show that TTL protein level is increased in a spinal muscular atrophy (SMA) disease model. Although alterations in TTL expression levels have been observed in different diseases, the molecular mechanisms controlling TTL expression have not yet been explained. At this point, our hypothesis was short non-coding RNAs, microRNAs (miRNAs), play a role in the regulation of TTL gene expression. Since no miRNA had previously been shown to bind TTL mRNA, in silico analyses were performed and miR-138-5p, miR-185-5p, and miR-338-3p were identified as candidate miRNAs. The expression levels of these candidates were investigated in an in vitro neuronal SMA model generated using NSC34 cells. A statistically significant decrease in miR-138-5p expression and a decreasing trend in miR-185-5p expression were found. The expression of miR-338-3p was not detected in the cells. Then, the levels of miR-138-5p and miR-185-5p were increased by mimic miRNA transfections. When miR-138-5p expression was increased, a statistically significant increase in TTL gene expression at the RNA level was detected; however, no change in TTL protein level was observed. When miR-185-5p expression was increased, a decrease trend in TTL gene expression was observed, but no change at the protein level was detected. These results indicate that miR-185-5p does not play a role in the regulation of TTL expression, whereas miR-138-5p may indirectly regulate TTL gene expression.
Benzer Tezler
- Koyunlarda haemonchus contortus'un moleküler karakterizasyonu ve benzimidazol dirençliliğinin moleküler olarak araştırılması
Molecular characterization of haemonchus contortus in sheep and molecular investigation of benzimidazole resistance
ZUHAL ÖNDER
Doktora
Türkçe
2014
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALPARSLAN YILDIRIM
- Olfaktör mukozal mezenkimal kök hücrelerin nöral farklılaşmasında peptit jellerin etkisinin ın vitro incelenmesi
Investigation of the effect of peptide gels on neural differentiation of olfactory mucosal mesenchymal stem cells
YONCA ERDAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyomühendislikEge ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYLİN ŞENDEMİR
- Investigation of mechanoregulatory role of desmin protein
Investigation of mechanoregulatory role of desmin protein
NİLÜFER DÜZ
Doktora
Türkçe
2024
Tıbbi BiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PERVİN RUKİYE DİNÇER
- İnsan mezenkimal kök hücrelerinin fonksiyonel nöronlara farklılaştırılması
Differentiation of human mesenchymal stem cells to functional neurons
NURŞAH ÖZTUNÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Tıbbi Biyolojiİstanbul Medipol ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NİHAL KARAKAŞ
PROF. DR. ÜLKAN KILIÇ
- IGF-1R sinyal yolağının genisteinle regülasyonunda P53'ün rolü
Role of P53 in the regulation of IGF-1R pathway with genistein
EKİN KESTEVUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
OnkolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CAN MURATHAN ERİŞTİ