AP-PCR için epon kesitlerden DNA izolasyonu koşullarının iyileştirilmesi
Improvement of DNA isolation conditions from epon sections for AP-PCR
- Tez No: 114145
- Danışmanlar: PROF. DR. SABİRE KARAÇALI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: DNA izolasyonu, Epon kesitler, AP-PCR (RAPD-PCR), DNA, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, DNA isolation, Epon sections, AP-PCR (RAPD-PCR), DNA, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2001
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET AP-PCR İÇ EPON KESİTLERDEN DNA İZOLASYONU KOŞULLARININ İYİLEŞTİRİLMESİ OZCAN, Ali Yüksek Lisans Tezi, Biyoloji Bölümü Tez Yöneticisi: Prof.Dr. Sabire KARAÇALI Ocak 2001, 54 Sayfa Bu çalışmada paraformaldehit ve glutaraldehit ile tespit edilmiş ve Epon 812'ye gömülmüş örnekler kullanılarak AP-PCR için DNA izolasyon koşullan geliştirilmiştir. Toplam normal ve hasta insan doku sayısı 30' dur. 5 Liken plan'lı, 5 egzema'lı ve 5 psoriasis'li hasta ve normal dokuları çalışılmıştır. 5 um'lik kesitlerden reçine toluol veya propilen oksit ile uzaklaştırılmıştır. DNA izolasyonu sırasında 30 ul Sindirme tamponu ve 12 ul Proteinaz K kullanılmıştır. Toluol ile propilen oksit uygulamaları arasında fark yoktur. D3S1613 primerinin AP-PCR çalışmalarında kullanılabileceği belirlenmiştir. Bu yöntemle 800 baz çiftine kadar olan bantlarda oxl74VI HaelII markın kullanılarak amplifikasyonun yapılabileceği belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, belli tip 4ıücre DNA izolasyonuna gereksinim duyulduğunda, Epon 8 12' ye gömülmüş örneklerin kullanılabileceğini göstermiştir. Üç farklı hasta doku örnekleri karşılaştırıldığında en fazla bant farklılığı egzemalı örneklerde bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
VII ABSTRACT IMPROVEMENT OF DNA ISOLATION CONDITIONS FROM EPON SECTIONS FORAP-PCR OZCAN, AH M.Sc in Biology Supervisor: Prof.Dr. Sabire KARAÇALI January 2001, 54 Pages In this study, DNA isolation conditions for AP-PCR were improved using fixed and embedded samples in paraformaldehyde- glutaraldehyde and Epon 812, respectively. The total number of normal and patient human tissues were 30. 5 specimens of lichen planus, 5 specimens of eczema and 5 specimens of psoriasis were studied. Embedding resin was removed from 5 um sections by toluol or propilane oxide. 30 ul. digestion buffer and 12 ul proteinase K were used during DNA isolation. There was no difference between toluol and propilene oxide procedures. We determined that D3S1613 primer can be used in AP- PCR. By this method, the possibility of amplification in bands up to 800 bp by using marker (|>xl74 Hae HI was designed.VIII The results showed that the embedded tissues in Epon 812 could be used when spesific type cell DNA isolation was needed. When we compare 3 different groups of patient tissues, the most bant differences were found in eczema samples.
Benzer Tezler
- Dişi farelerde bisfenol M ile oluşturulmuş karaciğer hasarının incelenmesi
Investigation of liver damage induced by bisphenol M in female mice
MUHAMMED CANİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyolojiSakarya ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAZAN DENİZ YÖN ERTUĞ
DOÇ. DR. ASUMAN DEVECİ ÖZKAN
- Mobilya endüstrisinde yaşam döngüsü analizi yaklaşımı ile çevreci tasarım ve sürdürülebilir stratejiler
Eco-design and sustainable strategies for the furniture industry through life cycle approach
MERVE MERMERTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA GERMİRLİ BABUNA
- Küçük hücreli akciğer kanserinin tedavisinde CAV/EP alterne kemoterapi protokolünün etkinliği, prognostik faktör olarak hipofosfatemi ile p53'ün önemi ve yeni tanımladığımız informatif bir mikrosatellit aleli (D5S67-6)
Efficiency of CAV/EP alternate chemotherapy protochol in small cell lung cancer, importance of hypophosphatemia and p53 as prognostic factor and recent described informative microsatellite allele (D5S679-6)
MUSTAFA PEHLİVAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1999
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiDahili Tıp Bilimleri Bölümü
Y.DOÇ.DR. UĞUR YILMAZ
