Geri Dön

AP-PCR için epon kesitlerden DNA izolasyonu koşullarının iyileştirilmesi

Improvement of DNA isolation conditions from epon sections for AP-PCR

  1. Tez No: 114145
  2. Yazar: ALİ ÖZCAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SABİRE KARAÇALI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: DNA izolasyonu, Epon kesitler, AP-PCR (RAPD-PCR), DNA isolation, Epon sections, AP-PCR (RAPD-PCR)
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

ÖZET AP-PCR İÇ EPON KESİTLERDEN DNA İZOLASYONU KOŞULLARININ İYİLEŞTİRİLMESİ OZCAN, Ali Yüksek Lisans Tezi, Biyoloji Bölümü Tez Yöneticisi: Prof.Dr. Sabire KARAÇALI Ocak 2001, 54 Sayfa Bu çalışmada paraformaldehit ve glutaraldehit ile tespit edilmiş ve Epon 812'ye gömülmüş örnekler kullanılarak AP-PCR için DNA izolasyon koşullan geliştirilmiştir. Toplam normal ve hasta insan doku sayısı 30' dur. 5 Liken plan'lı, 5 egzema'lı ve 5 psoriasis'li hasta ve normal dokuları çalışılmıştır. 5 um'lik kesitlerden reçine toluol veya propilen oksit ile uzaklaştırılmıştır. DNA izolasyonu sırasında 30 ul Sindirme tamponu ve 12 ul Proteinaz K kullanılmıştır. Toluol ile propilen oksit uygulamaları arasında fark yoktur. D3S1613 primerinin AP-PCR çalışmalarında kullanılabileceği belirlenmiştir. Bu yöntemle 800 baz çiftine kadar olan bantlarda oxl74VI HaelII markın kullanılarak amplifikasyonun yapılabileceği belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, belli tip 4ıücre DNA izolasyonuna gereksinim duyulduğunda, Epon 8 12' ye gömülmüş örneklerin kullanılabileceğini göstermiştir. Üç farklı hasta doku örnekleri karşılaştırıldığında en fazla bant farklılığı egzemalı örneklerde bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

VII ABSTRACT IMPROVEMENT OF DNA ISOLATION CONDITIONS FROM EPON SECTIONS FORAP-PCR OZCAN, AH M.Sc in Biology Supervisor: Prof.Dr. Sabire KARAÇALI January 2001, 54 Pages In this study, DNA isolation conditions for AP-PCR were improved using fixed and embedded samples in paraformaldehyde- glutaraldehyde and Epon 812, respectively. The total number of normal and patient human tissues were 30. 5 specimens of lichen planus, 5 specimens of eczema and 5 specimens of psoriasis were studied. Embedding resin was removed from 5 um sections by toluol or propilane oxide. 30 ul. digestion buffer and 12 ul proteinase K were used during DNA isolation. There was no difference between toluol and propilene oxide procedures. We determined that D3S1613 primer can be used in AP- PCR. By this method, the possibility of amplification in bands up to 800 bp by using marker (|>xl74 Hae HI was designed.VIII The results showed that the embedded tissues in Epon 812 could be used when spesific type cell DNA isolation was needed. When we compare 3 different groups of patient tissues, the most bant differences were found in eczema samples.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    86787

    Sağlıklı ve bakteriyel vajinozisli kadınlardan izole edilen Gardnerella vaginalis suşlarının biyotiplendirilmesi ve genetik karakterizasyonu

    Blotyping and genetic characterization of G. vaginalis isolated from healthy women and with BV

    HASAN ÇİFTÇİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FARUK AYDIN

  2. Tez No

    165772

    Hastane infeksiyonu etkeni olan metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarının AP-PCR (arbitrarily primed polymerase chain reaction) yöntemiyle epidemiyolojik yönden incelenmesi

    Başlık çevirisi yok

    GÜZİN GÜNTEKİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

  3. Tez No

    123856

    Aktif çürüklü ve çürüksüz çocuklarda streptococcus mutans görülme sıklığının PCR ve kültür yöntemleriyle karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi

    The prevalence of S. mutants in both caries active and caries-free children, comparatively by conventional culture technique and PCR technique

    ZEHRA MUTLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Diş HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Pedodonti Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. FİRDEVS TULGA ÖZ

  4. Tez No

    334143

    Çocuklarda streptokokkus mutans' ın vertikal (Aile içi) ve horizontal (çevreden) geçişinin araştırılması

    The evaluation of vertical (intra-familial) and horizontal (extra-familial) transmission of streptococcus mutans in children

    ESRA AYHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Diş HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Pedodonti Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURHAN ÖZALP

  5. Tez No

    115929

    Çürüklü ve çürüksüz dişlerden izole edilen streptococcus mutans'ın genotipik ayrımlarının AP-PCR (arbitrarily-primed polymerase chain reaction) yöntemiyle incelenmesi

    Genotipic identification of streptococcus mutans isolated from sound and carious teeth by AP-PCR method

    ZEYNEP ERGÜCÜ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Diş HekimliğiEge Üniversitesi

    Diş Hastalıkları ve Tedavisi Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. NECMİ GÖKAY

Geri Dön