Genetic composition of Pinus brutia ten. forests established with seeds from seed stands and orchards determined by using DNA markers
Tohum meşcereleri ve bahçeleri tohumlarıyla kurulan Pinus brutia ten. ormanlarında genetik yapılanmanın moleküler markörler yardımıyla belirlenmesi
- Tez No: 119444
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ KAYA, DOÇ. DR. SERTAÇ ÖNDE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: P. brutia Ten, RAPD markör, genetik çeşitlilik, tohum meşçereleri, tohum bahçeleri, plantasyonlar. vııı T.C YÜKSEKÖĞRETİM KUEÜH, P. brutia Ten, RAPD markör, genetik çeşitlilik, tohum meşçereleri, tohum bahçeleri, plantasyonlar. vııı T.C YÜKSEKÖ?RETİM KUEÜH
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 149
Özet
oz TOHUM MEŞÇERELERİ VE BAHÇELERİ TOHUMLARIYLA KURULAN PINUS BRUTIA TEN. ORMANLARINDA GENETİK YAPILANMANIN MOLEKÜLER MARKÖRLER YARDIMIYLA BELİRLENMESİ İÇGEN, Yasemin Doktora, Biyoloji Bölümü Tez yöneticisi: Prof. Dr. Zeki Kaya Ortak tez yöneticisi: Doç. Dr. Sertaç Önde Nisan 2002, 131 sayfa 18 Pinus brutia Ten. (Kızılcam) tohum kaynağında genetik çeşitliliğin miktar ve yapılaşmasını belirlemek amacıyla Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPD) markörleri kullanılmıştır. Üç farklı kategoriden örneklenen tohum kaynaklan, Kızılcamın Türkiye'deki 6 değişik ıslah zonundan 6 tohum meşçeresi ve bu meşçerelerden kaynaklanan 6 tohum bahçesi ve 6 plantasyonu kapsamaktadır. Çok düşük frekanslı ve tohum kaynaklarının hepsinde gözlenmeyen 147 bantın elenmesinden sonra, 12 dekamer primer 86 polimorfik RAPD bantı üretmiştir. Bütün tohum kaynaklarındaki polimorfik lokus oranının (0.99 kriterinde) %70.93 ile %91.86 arasında değiştiği görülmüştür. Bütün tohum vıkaynaklarında ortalama polimorfizmin %77 olarak saptanması, çalışılan Kızılcam tohum kaynaklarında genetik çeşitliliğin yüksek olduğunu belirtmektedir. Ortalama Fst değeri genetik çeşitliliğin önemli miktarının (% 87) tohum kaynaklarının içinde olduğunu göstermiştir. Ancak, bütün tohum kaynaklan gözönüne alındığında, tohum kaynaklan arasında önemli ölçüde (% 13) genetik farklılaşma olduğu belirlenmiştir. Fst değerleri (FSt=010-0.11) farklı kategorideki tohum kaynaklarında değişiklik göstermemiştir. Tohum bahçeleri (FB=0.03) ve plantasyonlar (FB= 0.07) tohum meşçerelerine (FB=0.13) oranla daha düşük akrabalar arası döllenme katsayısı göstermiştir, bu da bahçe ve plantasyonlarda akrabalık ilişkisi olmayan ailelerin örneklenmesinden kaynaklanmış olabilir. Tohum meşçereleri ve tohum bahçelerindeki genetik çeşitlilik parametrelerinin karşılaştırılması, lokus basma gözlenen alel sayısı, etkin allel sayısı, Shannon indeksi, beklenen ve gözlenen heterozigotluk değerlerinin benzer olduğunu göstermiştir. Ayrıca, tohum bahçelerindeki ortalama polimorfîk lokus oranının bu bahçelerin doğal karşılıklarından biraz daha yüksek olduğu bulunmuştur. Bu sonuçlar, ıslahçılarca yapılan fenotipik seçimin, Kızılcamda bilinen yüksek genetik çeşitliliği muhafaza ettiğini göstermiştir. Tohum meşçereleri ve plantasyonlar arasında genetik çeşitlilik parametreleri bakımından farklılık bulunmamıştır. Bu sonuçlara aykırı olan tek bulgu üç plantasyonun (Çetibeli, Kumluca and Karaköy plantasyonlan) polimorfîk lokus oranında gözlenen azalmadır ve bunun da fidanlık uygulamalarından kaynaklanmış olabileceği düşünülmüştür. Tohum bahçelerinde bulunan genetik çeşitlilik plantasyonlarda da korunmuştur. Tohum meşçerelerinin dendogramında coğrafi yakınlıkla ilişkilendirilebilecek gruplaşmalar oluşmadı. Ancak, rakım farklılıkları düşük seviyede önemli olabilir. Tohum bahçeleri ve plantasyonlarının dendogramlarında vııgözlenen meşçerelerden farklı gruplaşma şekli, doğal populasyonlardaki genetik çeşitliliğin önemli bir kısmının muhafaza edilmesine rağmen, Kızılcam ormanlarının genetik yapısının orman işletme etkinliklerinden dolayı değiştirilebileceğine olabileceğine işaret etmektedir.
Özet (Çeviri)
oz TOHUM MEŞÇERELERİ VE BAHÇELERİ TOHUMLARIYLA KURULAN PINUS BRUTIA TEN. ORMANLARINDA GENETİK YAPILANMANIN MOLEKÜLER MARKÖRLER YARDIMIYLA BELİRLENMESİ İÇGEN, Yasemin Doktora, Biyoloji Bölümü Tez yöneticisi: Prof. Dr. Zeki Kaya Ortak tez yöneticisi: Doç. Dr. Sertaç Önde Nisan 2002, 131 sayfa 18 Pinus brutia Ten. (Kızılcam) tohum kaynağında genetik çeşitliliğin miktar ve yapılaşmasını belirlemek amacıyla Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPD) markörleri kullanılmıştır. Üç farklı kategoriden örneklenen tohum kaynaklan, Kızılcamın Türkiye'deki 6 değişik ıslah zonundan 6 tohum meşçeresi ve bu meşçerelerden kaynaklanan 6 tohum bahçesi ve 6 plantasyonu kapsamaktadır. Çok düşük frekanslı ve tohum kaynaklarının hepsinde gözlenmeyen 147 bantın elenmesinden sonra, 12 dekamer primer 86 polimorfik RAPD bantı üretmiştir. Bütün tohum kaynaklarındaki polimorfik lokus oranının (0.99 kriterinde) %70.93 ile %91.86 arasında değiştiği görülmüştür. Bütün tohum vıkaynaklarında ortalama polimorfizmin %77 olarak saptanması, çalışılan Kızılcam tohum kaynaklarında genetik çeşitliliğin yüksek olduğunu belirtmektedir. Ortalama Fst değeri genetik çeşitliliğin önemli miktarının (% 87) tohum kaynaklarının içinde olduğunu göstermiştir. Ancak, bütün tohum kaynaklan gözönüne alındığında, tohum kaynaklan arasında önemli ölçüde (% 13) genetik farklılaşma olduğu belirlenmiştir. Fst değerleri (FSt=010-0.11) farklı kategorideki tohum kaynaklarında değişiklik göstermemiştir. Tohum bahçeleri (FB=0.03) ve plantasyonlar (FB= 0.07) tohum meşçerelerine (FB=0.13) oranla daha düşük akrabalar arası döllenme katsayısı göstermiştir, bu da bahçe ve plantasyonlarda akrabalık ilişkisi olmayan ailelerin örneklenmesinden kaynaklanmış olabilir. Tohum meşçereleri ve tohum bahçelerindeki genetik çeşitlilik parametrelerinin karşılaştırılması, lokus basma gözlenen alel sayısı, etkin allel sayısı, Shannon indeksi, beklenen ve gözlenen heterozigotluk değerlerinin benzer olduğunu göstermiştir. Ayrıca, tohum bahçelerindeki ortalama polimorfîk lokus oranının bu bahçelerin doğal karşılıklarından biraz daha yüksek olduğu bulunmuştur. Bu sonuçlar, ıslahçılarca yapılan fenotipik seçimin, Kızılcamda bilinen yüksek genetik çeşitliliği muhafaza ettiğini göstermiştir. Tohum meşçereleri ve plantasyonlar arasında genetik çeşitlilik parametreleri bakımından farklılık bulunmamıştır. Bu sonuçlara aykırı olan tek bulgu üç plantasyonun (Çetibeli, Kumluca and Karaköy plantasyonlan) polimorfîk lokus oranında gözlenen azalmadır ve bunun da fidanlık uygulamalarından kaynaklanmış olabileceği düşünülmüştür. Tohum bahçelerinde bulunan genetik çeşitlilik plantasyonlarda da korunmuştur. Tohum meşçerelerinin dendogramında coğrafi yakınlıkla ilişkilendirilebilecek gruplaşmalar oluşmadı. Ancak, rakım farklılıkları düşük seviyede önemli olabilir. Tohum bahçeleri ve plantasyonlarının dendogramlarında vııgözlenen meşçerelerden farklı gruplaşma şekli, doğal populasyonlardaki genetik çeşitliliğin önemli bir kısmının muhafaza edilmesine rağmen, Kızılcam ormanlarının genetik yapısının orman işletme etkinliklerinden dolayı değiştirilebileceğine olabileceğine işaret etmektedir.
Benzer Tezler
- The Impact of anthropogenic factors on the composition of genetic variation on pinus brutia ten. populations determined by DNA markers
İnsan kaynaklı faktörlerin pinus brutia ten. populasyonlarındaki genetik çeşitliliğe etkilerinin DNA markörler vasıtasıyla belirlenmesi
YILDIRAY LİSE
Yüksek Lisans
İngilizce
2000
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEKİ KAYA
DOÇ. DR. SERTAÇ ÖNDE
- Vegetation phenology and its interactions with climate change – a study on Turkey and its region
Türkiye ve bölgesinde iklim değişikliği ve vejetasyon fenolojisi ilişkisi: Uydu verilerine dayalı bir yaklaşım
TUĞÇE ŞENEL
Doktora
İngilizce
2023
Botanikİstanbul Teknik Üniversitesiİklim ve Deniz Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN NÜZHET DALFES
- Genetic composition of four marginally located anatolian black pine (Pinus nigra Subsp. Pallasiana) populations determined by ssr markers
Marjinal dağılımlı dört anadolu karaçamı (Pinus nigra Subsp. Pallasiana) popülasyonlarının ssr markörleri yardımıyla genetik yapılarının belirlenmesi
SILA AYGÜN
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEKİ KAYA
- Küre Dağları Milli Parkının vejetasyon ekolojisi ve iklim değişikliği senaryolarına göre değerlendirilmesi (Doğu kayını örneği)
Vegetation ecology of Küre Mountains National Park and assessment of climate change scenarios (Fagus orientalis sample)
MUHAMMET ÖZTEKİNCİ
- Matkap uçlarının Ark PVD ile Tin kaplanmasında proses parametrelerinin Taguchi metodları ile optimizasyonu
Başlık çevirisi yok
ÖZGÜL KELEŞ