Geri Dön

Batı Akdeniz bölgesinde zeytin ağaçlarında görülen Pseudomonas savastanoi pv. Savastanoi'nin neden olduğu bakteriyal dal kanseri hastalığının yayılışı, etmenin moleküler tanısı, izolatlarının elde edilmesi ve moleküler karakterizasyonu

The Distribution molecular identification and characterization of the strains of Pseudomonas savastanoi pv. Savastanoi, a causal agent of olive knot disease on live trees in Western Mediterranean region

  1. Tez No: 133009
  2. Yazar: ASU ERSOY
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HÜSEYİN BASIM
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2002
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

ÖZET ATI AKDENİZ BÖLGESİNDE ZEYTİN AĞAÇLARINDA GÖRÜLEN Pseudomonas savastanoi pv. savastanoP NİN NEDEN ÖLDÜĞÜ BAKTERİYAL DAL KANSERİ HASTALIĞININ YAYDLIŞL ETMENİN MOLEKÜLER TANESL İZOLATLARININ ELDE EDİLMESİ VE MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONÜ ASÜ ERSOY Yüksek Lisans Tezi, Bitki Koruma Anabilim Dalı Ocak 2002, 72 sayla Bu çalışmayla ülkemizde önemli bir tarım ürünü olan zeytin bitkisinde en önemli bakteriyal hastalık olan zeytin dal kanseri hastalığına neden olan Pseudomonas savastanoi pv. savastanof nin mikrobiyolojik açıdan ilk defa detaylı olarak tanımlaması yapılmıştır. Batı Akdeniz Bölgesinde özellikle zeytin bitkisinin yetiştirilmesi bakımından oldukça yüksek potansiyale sahip olan Antalya ili ve ilçelerine (Manavgat, Serik, Aksu, Kaş, Kale, Döşemealtı) yapılan sörveyler ile hastalık yayılış oram belirlenmiştir. Yapılan sörveyler sırasında toplanan hastalıklı bitki materyallerinden hastalık etmeni bakterinin izolasyonu için yarı seçici besi ortamları olan PVF1, King's B ve NSA (Nutrient Sakkaroz Agar) besi ortamları kullanılmış ve 27°C'de inkübasyona bırakılarak P. s. savastanof ye ait koloniler elde edilmiştir. Hastalık etmeninin tanısı ile ilgili olarak NSA ortamında levan oluşumu, oksidaz test, patates testi, arginine dihydrolaz testi ve tütünde hipersensitif reaksiyon testini içeren LOP AT testleri uygulanmıştır. Biyokimyasal testlerle tanısı yapılan hastalık etmeninin patojen|sitesi zeytin bitkisi üzerinde test edilmiştir. Elde edilen bakteriyal izolatlann moleküler düzeyde kesin tanıları ilk defa bu çalışmada dizayn edilen primerler (PSS 1: 5'-TGG GGT GCT ACT TGT ACC GGA -3', PSS 2: 5'-CCG TGT ACT ACG TTC AGC GAG -3', PSS 3: 5'- CAG GAC TTC AGA ACCAC GT -3', PSS 4: 5'- CGG TCG ATG ATG TAG AGC AT -3') kullanılarak sağlanmıştır, u primerler bakterinin patojenisitesi ile ilgili olan IAA (indole-3-acetic acid) ve sitokinin sntezinde görev alan genleri, sırasıyla iaaL (PSS3 ve PSS4) ve ptz (PSS1 ve PSS2) ailerinin nükleotid dizilişlerinden dizayn edilmiştir. Bu çalışmada geliştirilen PCR Sntemiyle patojen bakterinin moleküler olarak kesin tanısı hem P. s. savastanol den elde edilen total genomik DNA' dan hem de direk hücreden sağlanmıştır. Patojenin moleküler karakterizasyonunda bakterinin plazmid içerikleri alkaline lizis öntemi ile tespit edilmiştir. Bunun yanında yine patojen bakterinin moleküler karakterizasyonunda Rep-PCR tekniği ile patojen bakterinin Batı Akdeniz Bölgesinden jplanan izolatlan arasındaki farklılıklar genomik düzeyde ortaya çıkarılmıştır. kNAHTAR KELİMELER: Zeytin, Zeytin Dal Kanseri, P.s. savastanol, PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) JÜRİ Doç. Dr. Hüseyin BASIM (Danışman) Prof. Dr. Oktay YEĞEN Doç. Dr. Hatice ÖZAKTAN

Özet (Çeviri)

ABSTRACT THE DISTRIBUTION, MOLECULAR IDENTIFICATION AND CHARACTERIZATION OF THE STRAINS OF Pseudomtmas savastanoi pv. «ivastanoi, A CAUSAL AGENT OF OLIVE KNOT DISEASE ON OLIVE TREES IN WESTERN MEDITERRANEAN REGION ASU ERSOY M. S. in Plant Protection January, 2002, 72 Pages In this study, Pseudomonas savastanoi pv. savastano, olive knot pathogen, the most nportant bacterial disease of olive plants, an important agricultural product İn Turkey, was ientified and characterized in detail for the first time. The distribution of the olive knot disease in Antalya province was determined by urveying the presence of the disease of the potentially olive growing areas of Manavgat, »erik, Aksu, Kaş, Kale, Döşemealtı. LOP AT tests including levan formation in the NSA medium, oxidase test, potato test, xginine dihydrolase test and hypersensitive reaction test in tobaco plant were firstly applied or identification of the pathogenic bacteria, isolated from the diseased olive plants. Both »iochemical and pathogenicity tests were also applied for the identification of the pathogenic »acterium. The primers, PSS1: 5'- TGG GGT GCT ACT TGT ACC GGA -3', PSS2: 5'-CCG TGT ACT ACG TTC AGC GAG -3', PSS3: 5'- CAG GAC TTC AGA ACC CAC GT-3', PSS4: 5'- CGG TCG ATG ATG TAG AGC AT-3', designed in this study, were used for nolecular and certain identification of pathogenic bacterium. The primers were designed from he DNA sequences coding the ptz (PSS1 and PSS2) and iaaL (PSS3 and PSS4) genes.esponsible for cytokinin and IAA (indole-3 -acetic acid) production. Using the primers will lelp to develop a new detection techniques of the pathogenic bacterium by PCR. mAC GT -3', PSS 4: 5'- CGG TCG ATG ATG TAG AGC AT -3') kullanılarak sağlanmıştır, u primerler bakterinin patojenisitesi ile ilgili olan IAA (indole-3-acetic acid) ve sitokinin sntezinde görev alan genleri, sırasıyla iaaL (PSS3 ve PSS4) ve ptz (PSS1 ve PSS2) ailerinin nükleotid dizilişlerinden dizayn edilmiştir. Bu çalışmada geliştirilen PCR Sntemiyle patojen bakterinin moleküler olarak kesin tanısı hem P. s. savastanol den elde edilen total genomik DNA' dan hem de direk hücreden sağlanmıştır. Patojenin moleküler karakterizasyonunda bakterinin plazmid içerikleri alkaline lizis öntemi ile tespit edilmiştir. Bunun yanında yine patojen bakterinin moleküler karakterizasyonunda Rep-PCR tekniği ile patojen bakterinin Batı Akdeniz Bölgesinden jplanan izolatlan arasındaki farklılıklar genomik düzeyde ortaya çıkarılmıştır. kNAHTAR KELİMELER: Zeytin, Zeytin Dal Kanseri, P.s. savastanol, PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) JÜRİ Doç. Dr. Hüseyin BASIM (Danışman) Prof. Dr. Oktay YE?EN Doç. Dr. Hatice ÖZAKTAN

Benzer Tezler

  1. Tez No

    425987

    Antalya ili, Kaş ilçesi zeytin bahçelerinde zeytin fidantırtılı, Palpita unionalis (Hübner) (Lepidoptera: Pyralidae)'in popülasyon gelişimi üzerine araştırmalar

    Studies on development of population of olive sapling caterpillar Palpita unionalis (Hübner) (Lepidoptera: Pyralidae) in Kaş district of Antalya province

    MUKADDES KOÇAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    ZiraatMustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FEZA CAN CENGİZ

  2. Tez No

    427333

    The Ancient South Marmara Harbors

    Antik Güney Marmara Limanları

    SERKAN GÜNDÜZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    ArkeolojiUludağ Üniversitesi

    Arkeoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ŞAHİN

    PROF. DR. MARTİNA SEIFERT

  3. Tez No

    66642

    Burhaniye'de Yağcı Zeytinyağı Fabrikası restorasyonu

    Restoration of the Yağcı Olive Oil Factory in Burhaniye

    RANA LİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Mimarlıkİstanbul Teknik Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE ZEYNEP AHUNBAY

  4. Tez No

    173436

    Türkiye'nin seçilmiş bazı müzelerinden Hellenistik ve Roma Dönemi bronz heykelcikleri

    Hellenistic-Roman period bronze sculptures from some chosen museums from Turkey

    İSA KIZGUT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    ArkeolojiAkdeniz Üniversitesi

    Arkeoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. BURHAN VARKIVANÇ

  5. Tez No

    334426

    Zeytin sineği (Bactrocera oleae) popülasyonlarının genetik karakterizasyonu ve bu popülasyonlarda organofosfat insektisit direnç mutasyon frekanslarının belirlenmesi

    Genetic characterization of olive fly (Bactrocera oleae) populations and the determination of organophosphate resistance-associated mutation frequencies of these populations

    ERSİN DOĞAÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. VATAN TAŞKIN

Geri Dön