Geri Dön

Plasmodium vivax'ın laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan geninin polimeraz zincir reaksiyonu ile izolasyonu ve klonlanması

Isolation and cloning of Plasmodium vivax lactate dehydrogenase gene by polymerase chain reaction

PDF İndir

  1. Tez No: 134776
  2. Yazar: EKREM AKBULUT
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. DİLEK TURGUT BALIK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Sıtma, Plasmodium vivax, Laktat Dehidrogenaz, Polimeraz Zincir Reaksiyonu. VIII
  7. Yıl: 2003
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Fırat Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 63

Özet

ÖZET YÜKSEK LİSANS TEZİ Plasmodium vivax'ın LAKTAT DEHIDROGENAZ ENZİMİNİ KODLA YAN GENİNİN POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU İLE İZOLASYONU VE KLONLANMASI Ekrem AKBULUT Fırat Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalı 2003, Sayfa : 50 Varolan antimalarial lara karşı ilaç direncinin oluşması yeni ilaçların geliştirilmesinin gerekliliğini vurgulamaktadır. Bu amaçla bu tezde Plasmodium vivax Belein soyu (FRANSA) genomik DNA'sından laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan gen (/>vLDH) klonlanmış ve dizi analizi yapılmıştır. PvLDH geni günümüze kadar klonlanan ikinci insan malarial laktat dehidrogenaz'ıdır. DNA dizisi, /VLDH'ın Plasmodium falciparum LDH'ı (P/LDH) gibi 316 amino asitlik bir proteini kodlayan 951 bp açık okuma çerçevesini içerdiğini gösterdi. PvLDH'ın P/LDH ve bilinen diğer bazı LDH'lar amino asit dizi kıyaslaması, PvLDH'ın sırası ile PJLDH ile %90,1, Plasmodium berghei LDH'ı ile %90,8, Plasmodium yoelii LDH'\ ile %90,5, insan-M4 LDH'ı ile %26, insan-H4 LDH'ı ile %25 benzer olduğunu gösterdi. Ayrıca PvLDH'ın Glutamat-48 ve Glisin-217 olmak üzere iki tek amino asit delesyonuna sahip olduğu gösterildi. En çok dikkat çeken aktif bölge halkasında 5 amino asit ilavesidir. Önceden P/LDH'dan elde edilen yüksek çözünürlüklü X ışını yapısı bu bölgenin enzim inhibitörleri için cazip bir hedef olabileceğini gösterdi.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT MASTER THESIS ISOLATION AND CLONING OF Plasmodium vivax LACTATE DEHYDROGENASE GENE BY POLYMERASE CHAIN REACTION Ekrem AKBULUT Fırat University Graduate School of Natural and Applied Sciences Department of Biology 2003, Page : 50 Emergence of drug resistance to the existing antimalarials emphasizes the need for the development of new drugs. To this aim, in this thesis, a lactate dehydrogenase gene was cloned and sequenced from genomic DNA of Plasmodium vivax Belem strain (PvLDH). This is the second human malarial lactate dehydrogenase cloned to date. DNA sequence showed that like Plasmodium falciparum LDH (P/LDH), PvLDH contains a 951 bp open reading frame, coding for a 3 16 aminoacid protein. Aminoacid sequence alignment of PvLDH to P/LDH and to some other known LDHs indicated that PvLDH has %90,1 residue identities with P/LDH and 90,8%, 90,5%, 26%o, 25%), P. berghei, P. yoelii, insan-M4, insan-H4 LDHs respectively. It was also shown that PvLDH has two single aminoacid deletions, which are Glutamat-48 and Glisin-217. Most remarkable is a five residue insertion in the active site loop region. The high resolution X- ray structure previously obtained from P/LDH showed that this site might be an attractive target for inhibitors. Keywords : Malaria, Plasmodium vivax, Lactate Dehydrogenase, Polymerase Chain Reaction. IX

Benzer Tezler

  1. Tez No

    185347

    Plasmodium vivax'ın laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan genin ifade edilerek ilgili proteinin saflaştırılması ve analizlerinin yapılması

    Expression of the gene coding enzyme lactate dehydrogenase from Plasmodium vivax purification of the related protein and its analysis

    ABDULLAH ASLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyolojiFırat Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. DİLEK TURGUT BALIK

  2. Tez No

    270010

    Plasmodium vivax laktat dehidrogenaz enzimindeki aktif bölge halkasının ve kofaktör bağlanma bölgesinin diğer apikompleksan laktat dehidrogenaz enzimleri ile karşılaştırmalı analizi

    Comparative analysis of active site loop and cofactor binding site of Plasmodium vivax lactate dehydrogenase enzyme with other apicomplexan lactate dehydrogenase enzymes

    VENHAR ÇELİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyokimyaFırat Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DİLEK TURGUT BALIK

  3. Tez No

    185076

    Plasmodium vivax'da laktat dehidrogenaz enziminin aktif bölge halkası amino asitlerinin yönlendirilmiş mutagenez çalışmalarıyla analizi

    Analysis of active site loop amino asids of enzyme plasmodium vivax lactate dehydrogenase in by site-directed mutagenesis studies

    DİLEK SADAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyolojiFırat Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. DİLEK TURGUT BALIK

  4. Tez No

    244041

    Plasmodium vivax yabanıl tip laktat dehidrogenaz enziminin saflaştırmasının optimizasyonu ve yabanıl tip ile mutant enzimlerinin kinetik analizlerinin yapılması

    The optimization of the purification of the wild type Plasmodium vivax lactate dehydrogenase enzyme and the kinetic analaysis of the wild type and mutant enzymes

    ÖZAL MUTLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyokimyaYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DİLEK TURGUT BALIK

  5. Tez No

    193048

    Plasmodium vivax tanısında kalın damla ile immünokromatografik yöntemin karşılaştırılması

    The comparison of the immünochromatographic method with thick blood examination for diagnosis of plasmodium vivax malaria

    İBRAHİM KOCAÇİFTÇİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    ParazitolojiÇukurova Üniversitesi

    Parazitoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. İ. SONER KOLTAŞ

Geri Dön