Geri Dön

Alu insertion polymorphisms in Anatolian Turks

Anadolu Türkleri'nde alu ara-ilave polimorfizimleri

  1. Tez No: 143161
  2. Yazar: HAVVA DİNÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TOGAN İNCİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Alu ara-ilave polimorfizmleri, Anadolu, komşu birleştirme ağacı, temel öğeler analizi, ayrışım fonksiyonu analizi, Fst, heterozigotluk ve merkezden uzaklık, Alu insertion polymorphisms, Anatolia, neighbor joining tree, principal component analysis, discriminant function analysis, Fst, heterozygosity vs. distance from centroid
  7. Yıl: 2003
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyolojik Bilimler Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 116

Özet

Bu çalışmada on otozomal Alu ara-ilave polimorfizimleri (ACE, APO, A25, B65, Dİ, FXHIB, HS4.32, HS4.69, PV92 and TPA25) Anadolu'dan birbiri ile akraba olmayan yaklaşık 100 bireyde incelenmiştir. Alu ara-ilave polimorfizimlerinin insan evrimi çalışmalarında, diğer nükleer DNA polimorfizimlerine kıyasla birçok avantajı vardır. On Alu ilavelerinin Anadolu'daki frekansları hesaplanmış ve hepsi de Hardy- Weinberg (H-W) dengesinde bulunmuştur (p>0.05). Bu çalışmanın sonuçlarını daha önce dünya çapında yapılan çalışmaların sonuçlan ile birleştirerek, her populasyon çifti arasındaki genetik uzaklık (Nei'nin Da) hesaplanmış ve komşu birleştirme ağaçları çizilmiştir. Genel olarak, coğrafi olarak yakın populasyonlann genetik olarak da benzer olduğu görülmüştür. Temel öğeler analizi uygulandığında Anadolu'nun Avrupa grubunda olduğu bulunmuştur. Bu analiz sonucunda, FXIIIB, PV92 ve ACE değişkenlerinin populasyonlar arası varyasyonu açıklamada en çok katkısı olan değişkenler oldukları sonucu ortaya çıkmıştır. Ek olarak, ayrışım fonksiyonu analizi sonucunda ise, populasyon grupları için en ayırt edici genetik işaretlerin PV92, Dİ, ACE ve HS4.32 oldukları görülmüştür. Anadolu ve verisi mevcut olan bazı populasyonlar arasında ikili Fst değerleri hesaplanmıştır. Sonuç olarak, isviçre ve Fransız Akadyan populasyonları ve Anadolu arasında istatistiksel olarak anlamsız değerler elde edilmiştir. Son olarak, heterozigotluk ve merkezden uzaklık grafiği çizildiğinde, Anadolu ve Hindistan-Hindu populasyonlarının heterozigotluk değerlerinin Harpending ve Ward (1982) modeline göre beklenen değerler oldukları gözlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In the present study; ten autosomal human-specific Alu insertion polymorphisms; ACE, APO, A25, B65, Dl, FXHIB, HS4.32, HS4.69, PV92 and TPA25 were analyzed in approximately 100 unrelated individuals from Anatolia. Alu insertion polymorphisms offer several advantages over other nuclear DNA polymorphisms for human evolution studies. The frequencies of the ten biallelic Alu insertions in Anatolians were calculated and all systems were found to be in Hardy-Weinberg equilibrium (p>0.05). By combining the results of this study with results of previous studies done on worldwide populations, the genetic distance (Nei's Da) between each pair of inpopulations was calculated and neighbor joining trees were constructed. In general, geographically closer populations were found to be also genetically similar. Principal component analysis (PCA) was performed and Anatolia was found to be in the European cluster. As a result of PCA; it was concluded that FXIIIB, PV92 and ACE were the variables contributing the most to the explanation of the variation between the populations. Additionally; canonical variates analysis (CVA) concluded that the most discriminative markers for the groups of populations were PV92, Dl, ACE and HS4.32. Pair-wise Fst values were also calculated between Anatolians and some of the populations for which the data was available. It was concluded that, Anatolians have non-significant pair-wise Fst values with Swiss and French Acadian populations. Lastly, heterozygosity vs. distance from centroid graph was constructed and it was found that Anatolians and India-Hindu had exactly the expected heterozygosity value predicted by the model of Harpending and Ward (1982).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    116204

    9-bp deletion, alu insertion and microsatellite polymorphisms in Anatolia and Central Asian Turks

    Anadolu'da ve Orta Asya Türklerinde 9-bç kaybı (deletion), alu ara-ilave (insertion) ve mikrosatelit polimorfizmleri

    SERAL İÇENER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2001

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İNCİ TOGAN

  2. Tez No

    75669

    Alu insertion polymorphisms in Anatolia

    Anadolu'da alu insersiyon polimorfizmleri

    FİLİZ ÖZBAŞ GERÇEKER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyolojik Bilimler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İNCİ TOGAN

  3. Tez No

    167303

    An extended study on the Alu insertion polymorphisms in Anatolian human population

    Anadolu insan topluluğunda Alu-Ara ilave çeşitliliği üzerine genişletilmiş çalışma

    CERAN ŞEKERYAPAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2005

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. İNCİ TOGAN

  4. Tez No

    748606

    Genetic study of the progesterone receptor for infertile in Iraqi women

    Iraklı kısır kadınlar için progesteron reseptörünün genetik çalışması

    ALAA ALI LAFTA AL-ASADI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZGÜR KUZUKIRAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ WAFAA SABRİ MAHOOD

  5. Tez No

    150372

    Pulmoner embolide ACE gen polimorfizmi sıklığı

    The frequency of ACE gen polymorhism in pulmonary embolism

    BUKET ALTINOK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. NEJAT AKAR

Geri Dön